← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/maverick/ncbi-tools6/maverick

« back to all changes in this revision

Viewing changes to network/wwwblast/data/PAM30

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Aaron M. Ucko
  • Date: 2005-03-27 12:00:15 UTC
  • mfrom: (2.1.2 hoary)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20050327120015-embhesp32nj73p9r
Tags: 6.1.20041020-3
http://bugs.debian.org/295110
* Fix FTBFS under GCC 4.0 caused by inconsistent use of "static" on
  functions.  (Closes: #295110.)
* Add a watch file, now that we can.  (Upstream's layout needs version=3.)

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
network/wwwblast/data/PAM30
 
1
#
 
2
# This matrix was produced by "pam" Version 1.0.6 [28-Jul-93]
 
3
#
 
4
# PAM 30 substitution matrix, scale = ln(2)/2 = 0.346574
 
5
#
 
6
# Expected score = -5.06, Entropy = 2.57 bits
 
7
#
 
8
# Lowest score = -17, Highest score = 13
 
9
#
 
10
    A   R   N   D   C   Q   E   G   H   I   L   K   M   F   P   S   T   W   Y   V   B   Z   X   *
 
11
A   6  -7  -4  -3  -6  -4  -2  -2  -7  -5  -6  -7  -5  -8  -2   0  -1 -13  -8  -2  -3  -3  -3 -17
 
12
R  -7   8  -6 -10  -8  -2  -9  -9  -2  -5  -8   0  -4  -9  -4  -3  -6  -2 -10  -8  -7  -4  -6 -17
 
13
N  -4  -6   8   2 -11  -3  -2  -3   0  -5  -7  -1  -9  -9  -6   0  -2  -8  -4  -8   6  -3  -3 -17
 
14
D  -3 -10   2   8 -14  -2   2  -3  -4  -7 -12  -4 -11 -15  -8  -4  -5 -15 -11  -8   6   1  -5 -17
 
15
C  -6  -8 -11 -14  10 -14 -14  -9  -7  -6 -15 -14 -13 -13  -8  -3  -8 -15  -4  -6 -12 -14  -9 -17
 
16
Q  -4  -2  -3  -2 -14   8   1  -7   1  -8  -5  -3  -4 -13  -3  -5  -5 -13 -12  -7  -3   6  -5 -17
 
17
E  -2  -9  -2   2 -14   1   8  -4  -5  -5  -9  -4  -7 -14  -5  -4  -6 -17  -8  -6   1   6  -5 -17
 
18
G  -2  -9  -3  -3  -9  -7  -4   6  -9 -11 -10  -7  -8  -9  -6  -2  -6 -15 -14  -5  -3  -5  -5 -17
 
19
H  -7  -2   0  -4  -7   1  -5  -9   9  -9  -6  -6 -10  -6  -4  -6  -7  -7  -3  -6  -1  -1  -5 -17
 
20
I  -5  -5  -5  -7  -6  -8  -5 -11  -9   8  -1  -6  -1  -2  -8  -7  -2 -14  -6   2  -6  -6  -5 -17
 
21
L  -6  -8  -7 -12 -15  -5  -9 -10  -6  -1   7  -8   1  -3  -7  -8  -7  -6  -7  -2  -9  -7  -6 -17
 
22
K  -7   0  -1  -4 -14  -3  -4  -7  -6  -6  -8   7  -2 -14  -6  -4  -3 -12  -9  -9  -2  -4  -5 -17
 
23
M  -5  -4  -9 -11 -13  -4  -7  -8 -10  -1   1  -2  11  -4  -8  -5  -4 -13 -11  -1 -10  -5  -5 -17
 
24
F  -8  -9  -9 -15 -13 -13 -14  -9  -6  -2  -3 -14  -4   9 -10  -6  -9  -4   2  -8 -10 -13  -8 -17
 
25
P  -2  -4  -6  -8  -8  -3  -5  -6  -4  -8  -7  -6  -8 -10   8  -2  -4 -14 -13  -6  -7  -4  -5 -17
 
26
S   0  -3   0  -4  -3  -5  -4  -2  -6  -7  -8  -4  -5  -6  -2   6   0  -5  -7  -6  -1  -5  -3 -17
 
27
T  -1  -6  -2  -5  -8  -5  -6  -6  -7  -2  -7  -3  -4  -9  -4   0   7 -13  -6  -3  -3  -6  -4 -17
 
28
W -13  -2  -8 -15 -15 -13 -17 -15  -7 -14  -6 -12 -13  -4 -14  -5 -13  13  -5 -15 -10 -14 -11 -17
 
29
Y  -8 -10  -4 -11  -4 -12  -8 -14  -3  -6  -7  -9 -11   2 -13  -7  -6  -5  10  -7  -6  -9  -7 -17
 
30
V  -2  -8  -8  -8  -6  -7  -6  -5  -6   2  -2  -9  -1  -8  -6  -6  -3 -15  -7   7  -8  -6  -5 -17
 
31
B  -3  -7   6   6 -12  -3   1  -3  -1  -6  -9  -2 -10 -10  -7  -1  -3 -10  -6  -8   6   0  -5 -17
 
32
Z  -3  -4  -3   1 -14   6   6  -5  -1  -6  -7  -4  -5 -13  -4  -5  -6 -14  -9  -6   0   6  -5 -17
 
33
X  -3  -6  -3  -5  -9  -5  -5  -5  -5  -5  -6  -5  -5  -8  -5  -3  -4 -11  -7  -5  -5  -5  -5 -17
 
34
* -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17 -17   1