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Viewing changes to Code/BasicFilters/json/ProjectedLandweberDeconvolutionImageFilter.json

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Ghislain Antony Vaillant
  • Date: 2017-11-02 08:49:18 UTC
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20171102084918-7hs09ih668xq87ej
Tags: upstream-1.0.1
Import upstream version 1.0.1

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Lines of Context:
Code/BasicFilters/json/ProjectedLandweberDeconvolutionImageFilter.json
 
1
{
 
2
  "name" : "ProjectedLandweberDeconvolutionImageFilter",
 
3
  "template_code_filename" : "ImageFilter",
 
4
  "template_test_filename" : "ImageFilter",
 
5
  "number_of_inputs" : 2,
 
6
  "doc" : "Some global documentation",
 
7
  "pixel_types" : "BasicPixelIDTypeList",
 
8
  "include_files" : [
 
9
    "sitkBoundaryConditions.hxx"
 
10
  ],
 
11
  "custom_set_input" : "filter->SetInput( image1 ); filter->SetKernelImage( image2 );",
 
12
  "members" : [
 
13
    {
 
14
      "name" : "Alpha",
 
15
      "type" : "double",
 
16
      "default" : "0.1",
 
17
      "briefdescriptionSet" : "",
 
18
      "detaileddescriptionSet" : "Set the relaxation factor.",
 
19
      "briefdescriptionGet" : "",
 
20
      "detaileddescriptionGet" : "Get the relaxation factor."
 
21
    },
 
22
    {
 
23
      "name" : "NumberOfIterations",
 
24
      "type" : "int",
 
25
      "default" : "1",
 
26
      "briefdescriptionSet" : "",
 
27
      "detaileddescriptionSet" : "Set the number of iterations.",
 
28
      "briefdescriptionGet" : "",
 
29
      "detaileddescriptionGet" : "Get the number of iterations."
 
30
    },
 
31
    {
 
32
      "name" : "Normalize",
 
33
      "type" : "bool",
 
34
      "default" : "false",
 
35
      "doc" : "",
 
36
      "briefdescriptionSet" : "",
 
37
      "detaileddescriptionSet" : "Normalize the output image by the sum of the kernel components\n",
 
38
      "briefdescriptionGet" : "",
 
39
      "detaileddescriptionGet" : ""
 
40
    },
 
41
    {
 
42
      "name" : "BoundaryCondition",
 
43
      "enum" : [
 
44
        "ZERO_PAD",
 
45
        "ZERO_FLUX_NEUMANN_PAD",
 
46
        "PERIODIC_PAD"
 
47
      ],
 
48
      "default" : "itk::simple::ProjectedLandweberDeconvolutionImageFilter::ZERO_FLUX_NEUMANN_PAD",
 
49
      "custom_itk_cast" : "nsstd::auto_ptr< ImageBoundaryCondition< InputImageType > > bc( CreateNewBoundaryConditionInstance< Self, FilterType >( m_BoundaryCondition ) ); filter->SetBoundaryCondition( bc.get() );\n"
 
50
    },
 
51
    {
 
52
      "name" : "OutputRegionMode",
 
53
      "enum" : [
 
54
        "SAME",
 
55
        "VALID"
 
56
      ],
 
57
      "default" : "itk::simple::ProjectedLandweberDeconvolutionImageFilter::SAME",
 
58
      "itk_type" : "typename FilterType::OutputRegionModeType"
 
59
    }
 
60
  ],
 
61
  "tests" : [
 
62
    {
 
63
      "tag" : "defaults",
 
64
      "description" : "Projected Landweber deconvolution of image blurred with a Gaussian kernel",
 
65
      "settings" : [
 
66
        {
 
67
          "parameter" : "Normalize",
 
68
          "value" : "true",
 
69
          "python_value" : "True",
 
70
          "R_value" : "TRUE"
 
71
        }
 
72
      ],
 
73
      "tolerance" : "0.0001",
 
74
      "inputs" : [
 
75
        "Input/DeconvolutionInput.nrrd",
 
76
        "Input/DeconvolutionKernel.nrrd"
 
77
      ]
 
78
    }
 
79
  ],
 
80
  "briefdescription" : "Deconvolve an image using the projected Landweber deconvolution algorithm.",
 
81
  "detaileddescription" : "This filter performs the same calculation per iteration as the LandweberDeconvolutionImageFilter . However, at each iteration, negative pixels in the intermediate result are projected (set) to zero. This is useful if the solution is assumed to always be non-negative, which is the case when dealing with images formed by counting photons, for example.\n\nThis code was adapted from the Insight Journal contribution:\n\n\"Deconvolution: infrastructure and reference algorithms\" by Gaetan Lehmann https://hdl.handle.net/10380/3207 \n\n\\author Gaetan Lehmann, Biologie du Developpement et de la Reproduction, INRA de Jouy-en-Josas, France \n\nCory Quammen, The University of North Carolina at Chapel Hill\n\n\\see IterativeDeconvolutionImageFilter \n\n\\see RichardsonLucyDeconvolutionImageFilter \n\n\\see LandweberDeconvolutionImageFilter",
 
82
  "itk_module" : "ITKDeconvolution",
 
83
  "itk_group" : "Deconvolution"
 
84
}
 
 
b'\\ No newline at end of file'