~ubuntu-branches/ubuntu/jaunty/primer3/jaunty

« back to all changes in this revision

Viewing changes to test/primer_list_last/SP01-06-with-repeat1.for

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2006-09-28 20:18:54 UTC
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20060928201854-45pwapz5e3a6d684
Tags: upstream-1.0b
ImportĀ upstreamĀ versionĀ 1.0b

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
ACCEPTABLE LEFT PRIMERS
 
2
                                  0-based     #               self  self   lib  qual-
 
3
   # sequence                       start ln  N   GC%     Tm   any   end   sim   lity
 
4
   0 TCGCAATCAAATTTTTTCTATGACCTG       36 27  0 33.33 65.188  6.00  1.00  9.00 12.188
 
5
   1 TCGCAATCAAATTTTTTCTATGACCT        36 26  0 30.77 63.123  6.00  1.00 10.00  9.123
 
6
   2 ATCGCAATCAAATTTTTTCTATGACCT       35 27  0 29.63 63.204  6.00  1.00 10.00 10.204
 
7
   3 TCGCAATCAAATTTTTTCTATGACC         36 25  0 32.00 62.463  6.00  0.00 11.00  7.463
 
8
   4 ATCGCAATCAAATTTTTTCTATGACC        35 26  0 30.77 62.574  6.00  0.00 11.00  8.574
 
9
   5 AATCGCAATCAAATTTTTTCTATGACC       34 27  0 29.63 63.467  6.00  0.00 11.00 10.467
 
10
   6 TCGCAATCAAATTTTTTCTATGAC          36 24  0 29.17 59.542  6.00  1.00 10.00  4.458
 
11
   7 ATCGCAATCAAATTTTTTCTATGAC         35 25  0 28.00 59.789  6.00  2.00 10.00  5.211
 
12
   8 AATCGCAATCAAATTTTTTCTATGAC        34 26  0 26.92 60.843  6.00  1.00 10.00  6.843
 
13
   9 GAATCGCAATCAAATTTTTTCTATGAC       33 27  0 29.63 62.235  6.00  1.00 10.00  9.235
 
14
  10 TCGCAATCAAATTTTTTCTATGA           36 23  0 26.09 58.793  6.00  2.00 10.00  4.207
 
15
  11 AATCGCAATCAAATTTTTTCTATGA         34 25  0 24.00 60.202  6.00  2.00 10.00  5.202
 
16
  12 GAATCGCAATCAAATTTTTTCTATGA        33 26  0 26.92 61.653  6.00  2.00 10.00  7.653
 
17
  13 TGAATCGCAATCAAATTTTTTCTATGA       32 27  0 25.93 63.763  6.00  2.00 11.00 10.763
 
18
  14 TCGCAATCAAATTTTTTCTATG            36 22  0 27.27 57.077  6.00  2.00 10.00  4.923
 
19
  15 ATCGCAATCAAATTTTTTCTATG           35 23  0 26.09 57.456  6.00  2.00 10.00  5.544
 
20
  16 AATCGCAATCAAATTTTTTCTATG          34 24  0 25.00 58.677  6.00  2.00 10.00  5.323
 
21
  17 GAATCGCAATCAAATTTTTTCTATG         33 25  0 28.00 60.202  6.00  2.00 10.00  5.202
 
22
  18 TGAATCGCAATCAAATTTTTTCTATG        32 26  0 26.92 62.397  6.00  2.00 10.00  8.397
 
23
  19 ATGAATCGCAATCAAATTTTTTCTATG       31 27  0 25.93 62.507  6.00  2.00 10.00  9.507
 
24
  20 TCGCAATCAAATTTTTTCTAT             36 21  0 23.81 54.389  6.00  2.00  9.00  6.611
 
25
  21 TCGCAATCAAATTTTTTCTA              36 20  0 25.00 53.814  6.00  2.00  9.00  6.186
 
26
  22 ATCGCAATCAAATTTTTTCTA             35 21  0 23.81 54.389  6.00  2.00  9.00  6.611
 
27
  23 AATCGCAATCAAATTTTTTCTA            34 22  0 22.73 55.850  6.00  2.00  9.00  6.150
 
28
  24 GAATCGCAATCAAATTTTTTCTA           33 23  0 26.09 57.561  6.00  2.00  9.00  5.439
 
29
  25 TGAATCGCAATCAAATTTTTTCTA          32 24  0 25.00 59.977  6.00  2.00 10.00  4.023
 
30
  26 ATGAATCGCAATCAAATTTTTTCTA         31 25  0 24.00 60.202  6.00  2.00 10.00  5.202
 
31
  27 TATGAATCGCAATCAAATTTTTTCTA        30 26  0 23.08 60.204  6.00  2.00 10.00  6.204
 
32
  28 TTATGAATCGCAATCAAATTTTTTCTA       29 27  0 22.22 61.199  6.00  2.00 10.00  8.199
 
33
  29 TCGCAATCAAATTTTTTCT               36 19  0 26.32 53.559  6.00  2.00 10.00  7.441
 
34
  30 ATCGCAATCAAATTTTTTCT              35 20  0 25.00 54.168  6.00  2.00 10.00  5.832
 
35
  31 AATCGCAATCAAATTTTTTCT             34 21  0 23.81 55.693  6.00  2.00 10.00  5.307
 
36
  32 GAATCGCAATCAAATTTTTTCT            33 22  0 27.27 57.467  6.00  2.00 10.00  4.533
 
37
  33 TGAATCGCAATCAAATTTTTTCT           32 23  0 26.09 59.967  6.00  2.00 10.00  3.033
 
38
  34 ATGAATCGCAATCAAATTTTTTCT          31 24  0 25.00 60.199  6.00  2.00 10.00  4.199
 
39
  35 TATGAATCGCAATCAAATTTTTTCT         30 25  0 24.00 60.202  6.00  2.00 10.00  5.202
 
40
  36 TTATGAATCGCAATCAAATTTTTTCT        29 26  0 23.08 61.226  6.00  2.00 10.00  7.226
 
41
  37 ATTATGAATCGCAATCAAATTTTTTCT       28 27  0 22.22 61.382  6.00  2.00 10.00  8.382
 
42
  38 TCGCAATCAAATTTTTTC                36 18  0 27.78 52.197  6.00  2.00  9.00  9.803
 
43
  39 ATCGCAATCAAATTTTTTC               35 19  0 26.32 52.911  6.00  2.00  9.00  8.089
 
44
  40 AATCGCAATCAAATTTTTTC              34 20  0 25.00 54.571  6.00  2.00  9.00  5.429
 
45
  41 GAATCGCAATCAAATTTTTTC             33 21  0 28.57 56.457  6.00  2.00  9.00  4.543
 
46
  42 TGAATCGCAATCAAATTTTTTC            32 22  0 27.27 59.091  6.00  2.00 10.00  2.909
 
47
  43 ATGAATCGCAATCAAATTTTTTC           31 23  0 26.09 59.374  6.00  2.00 10.00  3.626
 
48
  44 TATGAATCGCAATCAAATTTTTTC          30 24  0 25.00 59.404  6.00  2.00 10.00  4.596
 
49
  45 TTATGAATCGCAATCAAATTTTTTC         29 25  0 24.00 60.502  6.00  2.00 10.00  5.502
 
50
  46 ATTATGAATCGCAATCAAATTTTTTC        28 26  0 23.08 60.694  6.00  2.00 10.00  6.694
 
51
  47 AATTATGAATCGCAATCAAATTTTTTC       27 27  0 22.22 61.652  8.00  2.00 10.00  8.652
 
52
  48 TATGAATCGCAATCAAAT                30 18  0 27.78 49.586  4.00  2.00 10.00 12.414
 
53
  49 ATTATGAATCGCAATCAA                28 18  0 27.78 49.586  5.00  2.00 10.00 12.414
 
54
  50 AATTATGAATCGCAATCAA               27 19  0 26.32 51.609  5.00  2.00 10.00  9.391