← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/utopic/nwchem/utopic

« back to all changes in this revision

Viewing changes to src/tools/ga-5-1/pario/pablo2upshot

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Michael Banck, Daniel Leidert, Andreas Tille, Michael Banck
  • Date: 2013-07-04 12:14:55 UTC
  • mfrom: (1.1.2)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20130704121455-5tvsx2qabor3nrui
Tags: 6.3-1
http://bugs.debian.org/696361
* New upstream release.
* Fixes anisotropic properties (Closes: #696361).
* New features include:
  + Multi-reference coupled cluster (MRCC) approaches
  + Hybrid DFT calculations with short-range HF 
  + New density-functionals including Minnesota (M08, M11) and HSE hybrid
    functionals
  + X-ray absorption spectroscopy (XAS) with TDDFT
  + Analytical gradients for the COSMO solvation model
  + Transition densities from TDDFT 
  + DFT+U and Electron-Transfer (ET) methods for plane wave calculations
  + Exploitation of space group symmetry in plane wave geometry optimizations
  + Local density of states (LDOS) collective variable added to Metadynamics
  + Various new XC functionals added for plane wave calculations, including
    hybrid and range-corrected ones
  + Electric field gradients with relativistic corrections 
  + Nudged Elastic Band optimization method
  + Updated basis sets and ECPs 

[ Daniel Leidert ]
* debian/watch: Fixed.

[ Andreas Tille ]
* debian/upstream: References

[ Michael Banck ]
* debian/upstream (Name): New field.
* debian/patches/02_makefile_flags.patch: Refreshed.
* debian/patches/06_statfs_kfreebsd.patch: Likewise.
* debian/patches/07_ga_target_force_linux.patch: Likewise.
* debian/patches/05_avoid_inline_assembler.patch: Removed, no longer needed.
* debian/patches/09_backported_6.1.1_fixes.patch: Likewise.
* debian/control (Build-Depends): Added gfortran-4.7 and gcc-4.7.
* debian/patches/10_force_gcc-4.7.patch: New patch, explicitly sets
  gfortran-4.7 and gcc-4.7, fixes test suite hang with gcc-4.8 (Closes:
  #701328, #713262).
* debian/testsuite: Added tests for COSMO analytical gradients and MRCC.
* debian/rules (MRCC_METHODS): New variable, required to enable MRCC methods.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
src/tools/ga-5-1/pario/pablo2upshot
1
 
#!/bin/csh -f
2
 
/home/aydt/pablo/bin/SDDFconverter << CONV_END
3
 
Pablo.bin
4
 
a
5
 
pab.ascii
6
 
n
7
 
CONV_END
8
 
./pabody
9
 
/bin/rm -f pab.sort pab.upshot
10
 
sort -n +5 pab.out > pab.sort
11
 
set nevents=`wc pab.sort | awk '{print $1}'`
12
 
set tfirst=`head -1 pab.sort | awk '{print $6}'`
13
 
set tlast=`tail -1 pab.sort | awk '{print $6}'`
14
 
 
15
 
cat > pab.upshot << END_HEADER
16
 
-1 0 0 0 0 0 sddf
17
 
-2 0 0  $nevents  0 0
18
 
-3 0 0 1 0 0
19
 
-4 0 0 1 0 0
20
 
-5 0 0 10 0 0
21
 
-6 0 0 0 0  $tfirst
22
 
-7 0 0 0 0  $tlast
23
 
-8 0 0 1 0 0
24
 
-11 0 0 0 0 4294967295
25
 
-13 0 700001 701001 0 0 blue: Native Open
26
 
-13 0 700003 701003 0 0 blue: Native fopen
27
 
-13 0 700005 701005 0 0 red: Native close
28
 
-13 0 700007 701007 0 0 red: Native fclose
29
 
-13 0 700009 701009 0 0 green: Native read
30
 
-13 0 700011 701011 0 0 green: Native fread
31
 
-13 0 700013 701013 0 0 yellow: Native lseek
32
 
-13 0 700015 701015 0 0 yellow: Native fseek
33
 
-13 0 700017 701017 0 0 magenta: Native write
34
 
-13 0 700019 701019 0 0 magenta: Native fwrite
35
 
-13 0 710000 711000 0 0 chocolate1: elio_write
36
 
-13 0 710001 711001 0 0 chocolate4: elio_awrite
37
 
-13 0 710002 711002 0 0 brown1: elio_read
38
 
-13 0 710003 711003 0 0 brown4: elio_aread
39
 
-13 0 710004 711004 0 0 LightSalmon1: elio_probe
40
 
-13 0 710005 711005 0 0 LightSalmon4: elio_wait
41
 
-13 0 710006 711006 0 0 coral1: elio_stat
42
 
-13 0 710007 711007 0 0 coral4: elio_open
43
 
-13 0 710009 711009 0 0 DeepPink1: elio_close
44
 
-13 0 710010 711010 0 0 DeepPink4: elio_set_cb
45
 
-13 0 710011 711011 0 0 HotPink1: elio_delete
46
 
-13 0 710012 711012 0 0 HotPink4: elio_init
47
 
END_HEADER
48
 
 
49
 
cat pab.sort >> pab.upshot
50
 
#/bin/rm -f pab.sort pab.out pab.ascii
51