← Back to branch summary

~ubuntu-branches/debian/experimental/ncbi-tools6/experimental

« back to all changes in this revision

Viewing changes to debian/control

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Aaron M. Ucko
  • Date: 2008-07-14 19:43:15 UTC
  • mfrom: (2.1.12 intrepid)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080714194315-ed44u9ek7txva2rz
Tags: 6.1.20080302-3
http://bugs.debian.org/490437
tools/readdb.c: enable madvise()-based code on all glibc (hence all
Debian) systems, not just Linux.  (Closes: #490437.)

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
debian/control
2
2
Section: libdevel
3
3
Priority: optional
4
4
Maintainer: Aaron M. Ucko <ucko@debian.org>
5
 
Build-Depends: debhelper (>= 5), binutils (>= 2.14.90.0.7), lesstif2-dev, libxmu-dev (>= 1:1), libxt-dev (>= 1:1), libx11-dev (>= 2:1), libsm-dev (>= 1:1), libice-dev (>= 1:1), libxext-dev (>= 1:1), libpng12-dev | libpng-dev, libglu1-mesa-dev | libglu-dev, libgl1-mesa-dev | libgl-dev, tcsh | c-shell, libpcre3-dev, cdbs (>= 0.4.40), pmake, dpkg-dev (>= 1.13.19)
6
 
Build-Depends-Indep: imagemagick
7
 
Standards-Version: 3.7.2
 
5
Build-Depends: csh | c-shell, debhelper (>= 7), dpkg-dev (>= 1.14.17), lesstif2-dev, libglu1-mesa-dev | libglu-dev, libpcre3-dev, libpng12-dev | libpng-dev, libxmu-dev
 
6
Build-Depends-Indep: icoutils, imagemagick
 
7
Standards-Version: 3.8.0
 
8
Homepage: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/ToolBox/
8
9
 
9
10
Package: libncbi6
10
11
Architecture: any
11
12
Section: libs
12
13
Depends: ${shlibs:Depends}, ncbi-data (= ${source:Version})
13
 
Conflicts: ncbi-tools6 (<< 6.1.20030421-2), vibrant6 (<< 6.1.20030421-2), blast2 (<< 1:2.2.14), ncbi-tools-bin (<< 6.1.20060507-1), ncbi-tools-x11 (<< 6.1.20060507-1)
14
 
Replaces: ncbi-tools6 (<< 6.1.20030421-2), vibrant6 (<< 6.1.20030421-2)
15
 
Provides: ncbi-tools6
 
14
Conflicts: blast2 (<< 1:2.2.14), ncbi-tools-bin (<< 6.1.20060507-1), ncbi-tools-x11 (<< 6.1.20060507-1)
16
15
Description: NCBI libraries for biology applications
17
16
 The NCBI Software Development Toolkit was developed for the production and
18
17
 distribution of GenBank, Entrez, BLAST, and related services by NCBI.  It
20
19
 
21
20
Package: libncbi6-dev
22
21
Architecture: any
23
 
Depends: libncbi6 (= ${binary:Version})
24
 
Provides: ncbi-tools-dev, ncbi-tools6-dev
25
 
Conflicts: ncbi-tools-dev, menu (<< 2.1.8)
26
 
Replaces: ncbi-tools6-dev (<< 6.1.20030421-2), vibrant-dev (<< 6.1.20030421-2)
 
22
Depends: ${shlibs:Depends}, libncbi6 (= ${binary:Version})
 
23
Provides: ncbi-tools-dev
27
24
Description: NCBI libraries for biology applications (development files)
28
25
 This package is for developers or people who want to compile programs
29
26
 only.  In addition to development headers and libraries, it contains the
33
30
Architecture: any
34
31
Priority: extra
35
32
Depends: libncbi6 (= ${binary:Version})
36
 
Recommends: gdb (>= 6.0)
37
 
Conflicts: ncbi-tools6-dbg
38
 
Replaces: ncbi-tools6-dbg
39
 
Provides: ncbi-tools6-dbg
 
33
Recommends: gdb
40
34
Description: NCBI libraries for biology applications (debugging symbols)
41
35
 This package is useful to provide a backtrace with symbol names in a
42
36
 debugger; this facilitates interpretation of core dumps, and aids in finding
49
43
Package: ncbi-data
50
44
Architecture: all
51
45
Section: libs
52
 
Replaces: ncbi-tools6 (<< 6.1.20011220a-1), libncbi6 (<< 6.1.20060507), libvibrant6 (<< 6.1.20060507)
53
 
Conflicts: ncbi-tools-bin (<< 6.1.20021119), blast2 (<< 6.1.20021119), vibrant6 (<< 6.1.20021119)
 
46
Replaces: libncbi6 (<< 6.1.20060507), libvibrant6 (<< 6.1.20060507)
54
47
Description: Platform-independent data for the NCBI toolkit
55
48
 This package contains support files needed by the NCBI toolkit on all
56
49
 platforms.
58
51
Package: ncbi-tools-bin
59
52
Architecture: any
60
53
Section: science
61
 
Depends: ${shlibs:Depends}, libncbi6 (<< ${source:Upstream-Version}.1)
 
54
Depends: ${shlibs:Depends}, libncbi6 (>= ${source:Upstream-Version}), libncbi6 (<< ${source:Upstream-Version}.1)
62
55
Suggests: blast2, ncbi-tools-x11, libvibrant6a
63
 
Conflicts: menu (<< 2.1.8)
64
56
Description: NCBI libraries for biology applications (text-based utilities)
65
57
 This package includes various utilities distributed with the NCBI C SDK.
66
58
 None of the programs in this package require X; you can find the X-based
70
62
Package: ncbi-tools-x11
71
63
Architecture: any
72
64
Section: science
73
 
Depends: ${shlibs:Depends}, libncbi6 (<< ${source:Upstream-Version}.1), libvibrant6a (<< ${source:Upstream-Version}.1)
 
65
Depends: ${shlibs:Depends}, libncbi6 (>= ${source:Upstream-Version}), libncbi6 (<< ${source:Upstream-Version}.1), libvibrant6a (>= ${source:Upstream-Version}), libvibrant6a (<< ${source:Upstream-Version}.1), ncbi-data (>= 6.1.20070822-2)
74
66
Suggests: blast2, ncbi-tools-bin
75
 
Replaces: libncbi6 (<< 6.1.20051206), ncbi-tools6 (<< 6.1.20030421-2)
 
67
Replaces: libncbi6 (<< 6.1.20051206)
76
68
Description: NCBI libraries for biology applications (X-based utilities)
77
69
 This package includes some X-based utilities distributed with the
78
70
 NCBI C SDK: Cn3D, Network Entrez, Sequin, ddv, and udv.  These
82
74
Package: blast2
83
75
Architecture: any
84
76
Section: science
85
 
Depends: ${shlibs:Depends}, libncbi6 (<< ${source:Upstream-Version}.1)
 
77
Depends: ${shlibs:Depends}, libncbi6 (>= ${source:Upstream-Version}), libncbi6 (<< ${source:Upstream-Version}.1)
86
78
Suggests: ncbi-tools-bin, ncbi-tools-x11, libvibrant6a
87
 
Conflicts: menu (<< 2.1.8)
 
79
Homepage: http://www.ncbi.nih.gov/BLAST/
88
80
Description: Basic Local Alignment Search Tool
89
81
 The famous sequence alignment program. This is "official" NCBI version,
90
82
 #2. The blastall executable allows you to give a nucleotide or protein
97
89
Package: libvibrant6a
98
90
Architecture: any
99
91
Section: libs
100
 
Depends: ${shlibs:Depends}
101
 
Replaces: vibrant6 (<< 6.1.20030421-2), libvibrant6, libvibrant6-gl, libvibrant6-nogl
102
 
Conflicts: libvibrant6, libvibrant6-gl, libvibrant6-nogl
 
92
Depends: ${shlibs:Depends}, libncbi6 (>= ${source:Upstream-Version}), libncbi6 (<< ${source:Upstream-Version}.1)
 
93
Replaces: libvibrant6
 
94
Conflicts: libvibrant6
103
95
Description: NCBI libraries for graphic biology applications
104
96
 This is the library for those who just want to run Vibrant applications.
105
97
 It also includes a wrapper (vibrate) that allows many NCBI applications to
107
99
 
108
100
Package: libvibrant6-dev
109
101
Architecture: any
110
 
Depends: libvibrant6a (= ${binary:Version}), libncbi6-dev (= ${binary:Version}), lesstif2-dev, libxmu-dev, libglu1-mesa-dev | libglu-dev, libgl1-mesa-dev | libgl-dev
111
 
Provides: vibrant-dev
112
 
Replaces: vibrant-dev (<< 6.1.20030421-2), libvibrant6-gl-dev, libvibrant6-nogl-dev
 
102
Depends: libvibrant6a (= ${binary:Version}), libncbi6-dev (= ${binary:Version}), lesstif2-dev, libxmu-dev, libglu1-mesa-dev | libglu-dev
113
103
Description: NCBI libraries for graphic biology applications (development files)
114
104
 Vibrant allows you to develop portable (Motif, MS-Windows, Mac-OS) graphic
115
105
 biological applications.
118
108
Architecture: any
119
109
Priority: extra
120
110
Depends:  libvibrant6a (= ${binary:Version})
121
 
Recommends: gdb (>= 6.0)
 
111
Recommends: gdb
122
112
Suggests: libncbi6-dbg (= ${binary:Version})
123
 
Conflicts: vibrant6-dbg
124
 
Replaces: vibrant6-dbg
125
 
Provides: vibrant6-dbg
126
113
Description: NCBI libraries for graphic biology applications (unstripped)
127
114
 This package is useful to provide a backtrace with symbol names in a
128
115
 debugger; this facilitates interpretation of core dumps, and aids in finding