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~ubuntu-branches/ubuntu/raring/ncbi-tools6/raring

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  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Aaron M. Ucko
  • Date: 2011-09-05 18:55:02 UTC
  • mfrom: (1.1.11 upstream)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20110905185502-iuvmoe65ytljhckn
Tags: 6.1.20110713-1
* New upstream release.
* debian/*.symbols: update accordingly.
* make/makeshlb.unx: link libcn3dOGL.so against -lm for sqrt.
* doc/man/*.1: update for new release.
* debian/rules:
  - (VIB): add asnmacro, as upstream takes care to publish binaries thereof.
  - Retire obsolete multiarch-unaware checks for libpthread.
  - Fully modernize Debhelper usage; in particular, transition to overrides.
* debian/compat: advance to 9 per rules modernization.
* debian/ncbi-tools-bin.install: add asnmacro.
* make/makenet.unx: link asnmacro only against libraries it directly needs.
* doc/man/asnmacro.1: give asnmacro a man page.
* doc/man/Psequin.1: list it in SEE ALSO.
* network/id1arch/idfetch.c: revert redundant change (from #295110).
* Convert to multiarch.
  - debian/rules: Install libraries (and ncbithr.o) to multiarch directories.
  - debian/lib*.install: match multiarch library paths.
  - debian/control:
    + Build-Depends: debhelper (>= 8.1.3~), implying a recent dpkg-dev.
    + Set Multi-Arch: as appropriate across the board, and specify
      Pre-Depends: ${misc:Pre-Depends} for runtime libraries.
* debian/*.lintian-overrides: drop leading slashes for Lintian 2.5.x.
* debian/control: Standards-Version: 3.9.2 (already compliant).

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262
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226
285
2.7.1.117       2.7.11.18
 
286
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227
287
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288
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289
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240
300
2.7.1.155       2.7.4.24
 
301
2.7.1.n2        2.7.1.161
 
302
2.7.1.n3        2.7.1.164
 
303
2.7.1.n6        2.7.1.163
241
304
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242
305
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306
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252
315
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253
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254
317
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318
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319
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255
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321
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322
2.7.7.n2        2.7.7.67
 
323
2.7.7.n3        2.7.7.73
256
324
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325
2.7.8.n1        2.7.8.30
 
326
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327
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257
328
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329
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333
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263
 
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336
3.1.2.n1        3.1.2.28
 
337
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339
3.1.3.n3        3.1.3.78
265
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341
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283
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359
3.1.4.n1        3.1.4.53
284
360
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285
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286
362
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423
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348
424
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425
3.1.26.n1       3.1.26.12
349
426
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351
428
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360
437
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361
438
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362
439
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363
 
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440
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364
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370
447
3.4.2.3 3.4.17.4
371
 
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372
 
3.4.3.2 3.4.13.18
 
448
3.4.3.1 3.4.13.18       3.4.13.19
 
449
3.4.3.2 3.4.13.18       3.4.13.19
373
450
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374
451
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375
452
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376
 
3.4.3.6 3.4.13.18
 
453
3.4.3.6 3.4.13.18       3.4.13.19
377
454
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378
455
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379
456
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381
458
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382
459
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383
460
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384
 
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461
3.4.4.7 3.4.21.36       3.4.21.37
385
462
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386
463
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387
464
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390
467
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391
468
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392
469
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393
 
3.4.4.16        3.4.21.62
394
 
3.4.4.17        3.4.23.20
 
470
3.4.4.16        3.4.21.62       3.4.21.63       3.4.21.64       3.4.21.65       3.4.21.66       3.4.21.67
 
471
3.4.4.17        3.4.21.103      3.4.23.20       3.4.23.21       3.4.23.22       3.4.23.23       3.4.23.24       3.4.23.25       3.4.23.26       3.4.23.28       3.4.23.29       3.4.23.30
395
472
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396
473
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397
474
3.4.4.20        3.4.22.8
398
475
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399
476
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400
477
3.4.4.23        3.4.23.5
401
 
3.4.4.24        3.4.22.32
 
478
3.4.4.24        3.4.22.32       3.4.22.33
402
479
3.4.11.8        3.4.19.3
403
 
3.4.12.1        3.4.16.5
 
480
3.4.11.n1       3.4.11.24
 
481
3.4.12.1        3.4.16.5        3.4.16.6
404
482
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405
483
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406
484
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410
488
3.4.12.8        3.4.17.4
411
489
3.4.12.10       3.4.19.9
412
490
3.4.12.11       3.4.17.6
413
 
3.4.12.12       3.4.16.5
414
 
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415
 
3.4.13.2        3.4.13.18
 
491
3.4.12.12       3.4.16.5        3.4.16.6
 
492
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493
3.4.13.2        3.4.13.18       3.4.13.19
416
494
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417
 
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495
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421
 
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499
3.4.13.15       3.4.13.18       3.4.13.19
422
500
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423
 
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501
3.4.14.8        3.4.14.9        3.4.14.10
424
502
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425
503
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426
 
3.4.16.1        3.4.16.5
427
 
3.4.16.3        3.4.16.5
 
504
3.4.16.1        3.4.16.5        3.4.16.6
 
505
3.4.16.3        3.4.16.5        3.4.16.6
428
506
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429
507
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430
508
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431
509
3.4.19.10       3.5.1.28
432
 
3.4.21.8        3.4.21.35
433
 
3.4.21.11       3.4.21.36
434
 
3.4.21.13       3.4.16.5
435
 
3.4.21.14       3.4.21.62
 
510
3.4.21.8        3.4.21.34       3.4.21.35
 
511
3.4.21.11       3.4.21.36       3.4.21.37
 
512
3.4.21.13       3.4.16.5        3.4.16.6
 
513
3.4.21.14       3.4.21.62       3.4.21.63       3.4.21.64       3.4.21.65       3.4.21.67
436
514
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437
515
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438
516
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439
517
3.4.21.30       3.4.21.74
440
 
3.4.21.31       3.4.21.68
 
518
3.4.21.31       3.4.21.68       3.4.21.73
441
519
3.4.21.44       3.4.21.43
442
520
3.4.21.87       3.4.23.49
443
 
3.4.22.4        3.4.22.32
 
521
3.4.22.4        3.4.22.32       3.4.22.33
444
522
3.4.22.5        3.4.22.33
445
523
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446
524
3.4.22.11       3.4.24.56
447
525
3.4.22.12       3.4.19.9
448
 
3.4.22.17       3.4.22.52
 
526
3.4.22.17       3.4.22.52       3.4.22.53
449
527
3.4.22.18       3.4.21.26
450
528
3.4.22.19       3.4.24.15
451
529
3.4.22.21       3.4.25.1
452
530
3.4.22.22       3.4.24.37
453
531
3.4.22.23       3.4.21.61
454
 
3.4.23.6        3.4.23.18
 
532
3.4.23.6        3.4.21.103      3.4.23.18       3.4.23.19       3.4.23.20       3.4.23.21       3.4.23.22       3.4.23.23       3.4.23.24       3.4.23.25       3.4.23.26       3.4.23.28       3.4.23.30
455
533
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456
534
3.4.23.8        3.4.23.25
457
535
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459
537
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460
538
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461
539
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462
 
3.4.24.4        3.4.24.25
463
 
3.4.24.5        3.4.25.1
 
540
3.4.24.4        3.4.24.25       3.4.24.26       3.4.24.27       3.4.24.28       3.4.24.29       3.4.24.30       3.4.24.31       3.4.24.32       3.4.24.39       3.4.24.40
 
541
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464
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465
543
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466
544
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471
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473
551
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474
 
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552
3.4.99.26       3.4.21.68       3.4.21.73
475
553
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476
554
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477
555
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487
565
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488
566
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489
567
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568
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569
3.5.1.n1        3.5.1.108
 
570
3.5.1.n2        3.5.1.99
490
571
3.5.2.8 3.5.2.6
491
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492
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504
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587
3.6.1.n5        3.6.1.54
 
588
3.6.3.13        3.6.3.1
 
589
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515
599
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516
 
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600
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601
4.1.2.39        4.1.2.46        4.1.2.47
 
602
4.1.2.n1        4.1.2.44
517
603
4.1.3.2 2.3.3.9
518
604
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551
 
4.2.1.63        3.3.2.9
552
 
4.2.1.64        3.3.2.9
 
637
4.2.1.63        3.3.2.9 3.3.2.10
 
638
4.2.1.64        3.3.2.9 3.3.2.10
 
639
4.2.1.71        4.2.1.27
553
640
4.2.1.72        4.1.1.78
 
641
4.2.1.86        4.2.1.98
554
642
4.2.1.102       4.2.1.100
555
 
4.2.2.4 4.2.2.20
 
643
4.2.2.4 4.2.2.20        4.2.2.21
 
644
4.2.3.n1        4.2.3.38
 
645
4.2.3.n3        4.2.3.56
 
646
4.2.3.n5        4.2.3.52
 
647
4.2.3.n9        4.2.3.44
556
648
4.2.99.1        4.2.2.1
557
649
4.2.99.2        4.2.3.1
558
650
4.2.99.3        4.2.2.2
559
651
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560
 
4.2.99.6        4.2.2.5
 
652
4.2.99.6        4.2.2.5 4.2.2.20        4.2.2.21
561
653
4.2.99.7        4.2.3.2
562
654
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563
655
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569
661
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570
662
4.2.99.17       2.5.1.51
571
663
4.2.99.19       4.4.1.23
 
664
4.2.99.n1       4.2.99.20
 
665
4.3.1.5 4.3.1.23        4.3.1.24        4.3.1.25
572
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667
4.3.1.21        4.3.1.9
573
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574
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689
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590
690
6.3.5.8 2.6.1.85