~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/nwchem/trusty-proposed

« back to all changes in this revision

Viewing changes to QA/tests/he/he_TSHG_FFFT.out

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Michael Banck, Daniel Leidert, Andreas Tille, Michael Banck
  • Date: 2013-07-04 12:14:55 UTC
  • mfrom: (1.1.2)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20130704121455-5tvsx2qabor3nrui
Tags: 6.3-1
* New upstream release.
* Fixes anisotropic properties (Closes: #696361).
* New features include:
  + Multi-reference coupled cluster (MRCC) approaches
  + Hybrid DFT calculations with short-range HF 
  + New density-functionals including Minnesota (M08, M11) and HSE hybrid
    functionals
  + X-ray absorption spectroscopy (XAS) with TDDFT
  + Analytical gradients for the COSMO solvation model
  + Transition densities from TDDFT 
  + DFT+U and Electron-Transfer (ET) methods for plane wave calculations
  + Exploitation of space group symmetry in plane wave geometry optimizations
  + Local density of states (LDOS) collective variable added to Metadynamics
  + Various new XC functionals added for plane wave calculations, including
    hybrid and range-corrected ones
  + Electric field gradients with relativistic corrections 
  + Nudged Elastic Band optimization method
  + Updated basis sets and ECPs 

[ Daniel Leidert ]
* debian/watch: Fixed.

[ Andreas Tille ]
* debian/upstream: References

[ Michael Banck ]
* debian/upstream (Name): New field.
* debian/patches/02_makefile_flags.patch: Refreshed.
* debian/patches/06_statfs_kfreebsd.patch: Likewise.
* debian/patches/07_ga_target_force_linux.patch: Likewise.
* debian/patches/05_avoid_inline_assembler.patch: Removed, no longer needed.
* debian/patches/09_backported_6.1.1_fixes.patch: Likewise.
* debian/control (Build-Depends): Added gfortran-4.7 and gcc-4.7.
* debian/patches/10_force_gcc-4.7.patch: New patch, explicitly sets
  gfortran-4.7 and gcc-4.7, fixes test suite hang with gcc-4.8 (Closes:
  #701328, #713262).
* debian/testsuite: Added tests for COSMO analytical gradients and MRCC.
* debian/rules (MRCC_METHODS): New variable, required to enable MRCC methods.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
All connections between all procs tested: SUCCESS
 
2
 argument  1 = he_TSHG_FFFT.nw
 
3
 
 
4
 
 
5
 
 
6
============================== echo of input deck ==============================
 
7
echo
 
8
start he_dat
 
9
 
 
10
memory global 400 mb
 
11
 
 
12
geometry
 
13
  he 0 0 0
 
14
end
 
15
 
 
16
basis
 
17
 * library cc-pVDZ
 
18
end
 
19
 
 
20
task scf energy
 
21
================================================================================
 
22
 
 
23
 
 
24
                                         
 
25
                                         
 
26
 
 
27
 
 
28
              Northwest Computational Chemistry Package (NWChem) 6.1
 
29
              ------------------------------------------------------
 
30
 
 
31
 
 
32
                    Environmental Molecular Sciences Laboratory
 
33
                       Pacific Northwest National Laboratory
 
34
                                Richland, WA 99352
 
35
 
 
36
                              Copyright (c) 1994-2010
 
37
                       Pacific Northwest National Laboratory
 
38
                            Battelle Memorial Institute
 
39
 
 
40
             NWChem is an open-source computational chemistry package
 
41
                        distributed under the terms of the
 
42
                      Educational Community License (ECL) 2.0
 
43
             A copy of the license is included with this distribution
 
44
                              in the LICENSE.TXT file
 
45
 
 
46
                                  ACKNOWLEDGMENT
 
47
                                  --------------
 
48
 
 
49
            This software and its documentation were developed at the
 
50
            EMSL at Pacific Northwest National Laboratory, a multiprogram
 
51
            national laboratory, operated for the U.S. Department of Energy
 
52
            by Battelle under Contract Number DE-AC05-76RL01830. Support
 
53
            for this work was provided by the Department of Energy Office
 
54
            of Biological and Environmental Research, Office of Basic
 
55
            Energy Sciences, and the Office of Advanced Scientific Computing.
 
56
 
 
57
 
 
58
           Job information
 
59
           ---------------
 
60
 
 
61
    hostname      = arcen
 
62
    program       = ../../../bin/LINUX64/nwchem
 
63
    date          = Tue Feb 14 15:40:20 2012
 
64
 
 
65
    compiled      = Tue_Feb_14_15:40:14_2012
 
66
    source        = /home/d3y133/nwchem-dev/nwchem-trunk
 
67
    nwchem branch = Development
 
68
    input         = he_TSHG_FFFT.nw
 
69
    prefix        = he_dat.
 
70
    data base     = ./he_dat.db
 
71
    status        = startup
 
72
    nproc         =        1
 
73
    time left     =     -1s
 
74
 
 
75
 
 
76
 
 
77
           Memory information
 
78
           ------------------
 
79
 
 
80
    heap     =   13107201 doubles =    100.0 Mbytes
 
81
    stack    =   13107201 doubles =    100.0 Mbytes
 
82
    global   =   52428800 doubles =    400.0 Mbytes (distinct from heap & stack)
 
83
    total    =   78643202 doubles =    600.0 Mbytes
 
84
    verify   = yes
 
85
    hardfail = no 
 
86
 
 
87
 
 
88
           Directory information
 
89
           ---------------------
 
90
 
 
91
  0 permanent = .
 
92
  0 scratch   = .
 
93
 
 
94
 
 
95
 
 
96
 
 
97
                                NWChem Input Module
 
98
                                -------------------
 
99
 
 
100
 
 
101
 
 
102
 Scaling coordinates for geometry "geometry" by  1.889725989
 
103
 (inverse scale =  0.529177249)
 
104
 
 
105
 
 
106
 
 
107
                             Geometry "geometry" -> ""
 
108
                             -------------------------
 
109
 
 
110
 Output coordinates in angstroms (scale by  1.889725989 to convert to a.u.)
 
111
 
 
112
  No.       Tag          Charge          X              Y              Z
 
113
 ---- ---------------- ---------- -------------- -------------- --------------
 
114
    1 he                   2.0000     0.00000000     0.00000000     0.00000000
 
115
 
 
116
      Atomic Mass 
 
117
      ----------- 
 
118
 
 
119
      he                 4.002600
 
120
 
 
121
 
 
122
 Effective nuclear repulsion energy (a.u.)       0.0000000000
 
123
 
 
124
            Nuclear Dipole moment (a.u.) 
 
125
            ----------------------------
 
126
        X                 Y               Z
 
127
 ---------------- ---------------- ----------------
 
128
     0.0000000000     0.0000000000     0.0000000000
 
129
 
 
130
 
 
131
            XYZ format geometry
 
132
            -------------------
 
133
     1
 
134
 geometry
 
135
 he                    0.00000000     0.00000000     0.00000000
 
136
 
 
137
 
 
138
 
 
139
 Summary of "ao basis" -> "" (cartesian)
 
140
 ------------------------------------------------------------------------------
 
141
       Tag                 Description            Shells   Functions and Types
 
142
 ---------------- ------------------------------  ------  ---------------------
 
143
 *                          cc-pVDZ                   on all atoms 
 
144
 
 
145
 
 
146
                      Basis "ao basis" -> "ao basis" (cartesian)
 
147
                      -----
 
148
  he (Helium)
 
149
  -----------
 
150
            Exponent  Coefficients 
 
151
       -------------- ---------------------------------------------------------
 
152
  1 S  3.83600000E+01  0.023809
 
153
  1 S  5.77000000E+00  0.154891
 
154
  1 S  1.24000000E+00  0.469987
 
155
 
 
156
  2 S  2.97600000E-01  1.000000
 
157
 
 
158
  3 P  1.27500000E+00  1.000000
 
159
 
 
160
 
 
161
 
 
162
 Summary of "ao basis" -> "ao basis" (cartesian)
 
163
 ------------------------------------------------------------------------------
 
164
       Tag                 Description            Shells   Functions and Types
 
165
 ---------------- ------------------------------  ------  ---------------------
 
166
 he                         cc-pVDZ                  3        5   2s1p
 
167
 
 
168
 
 
169
                                 NWChem SCF Module
 
170
                                 -----------------
 
171
 
 
172
 
 
173
 
 
174
  ao basis        = "ao basis"
 
175
  functions       =     5
 
176
  atoms           =     1
 
177
  closed shells   =     1
 
178
  open shells     =     0
 
179
  charge          =   0.00
 
180
  wavefunction    = RHF 
 
181
  input vectors   = atomic
 
182
  output vectors  = ./he_dat.movecs
 
183
  use symmetry    = F
 
184
  symmetry adapt  = F
 
185
 
 
186
 
 
187
 Summary of "ao basis" -> "ao basis" (cartesian)
 
188
 ------------------------------------------------------------------------------
 
189
       Tag                 Description            Shells   Functions and Types
 
190
 ---------------- ------------------------------  ------  ---------------------
 
191
 he                         cc-pVDZ                  3        5   2s1p
 
192
 
 
193
 
 
194
 
 
195
 Forming initial guess at       0.0s
 
196
 
 
197
 
 
198
      Superposition of Atomic Density Guess
 
199
      -------------------------------------
 
200
 
 
201
 Sum of atomic energies:          -2.85516045
 
202
 
 
203
      Non-variational initial energy
 
204
      ------------------------------
 
205
 
 
206
 Total energy =      -2.855160
 
207
 1-e energy   =      -3.882025
 
208
 2-e energy   =       1.026865
 
209
 HOMO         =      -0.914148
 
210
 LUMO         =       1.397442
 
211
 
 
212
 
 
213
 Starting SCF solution at       0.0s
 
214
 
 
215
 
 
216
 
 
217
 ----------------------------------------------
 
218
         Quadratically convergent ROHF
 
219
 
 
220
 Convergence threshold     :          1.000E-04
 
221
 Maximum no. of iterations :           30
 
222
 Final Fock-matrix accuracy:          1.000E-07
 
223
 ----------------------------------------------
 
224
 
 
225
 
 
226
 #quartets = 2.100D+01 #integrals = 4.500D+01 #direct =  0.0% #cached =100.0%
 
227
 
 
228
 
 
229
 Integral file          = ./he_dat.aoints.0
 
230
 Record size in doubles =  65536        No. of integs per rec  =  43688
 
231
 Max. records in memory =      2        Max. records in file   =  12281
 
232
 No. of bits per label  =      8        No. of bits per value  =     64
 
233
 
 
234
 
 
235
              iter       energy          gnorm     gmax       time
 
236
             ----- ------------------- --------- --------- --------
 
237
                 1       -2.8551604773  4.95D-08  4.95D-08      0.0
 
238
 
 
239
 
 
240
       Final RHF  results 
 
241
       ------------------ 
 
242
 
 
243
         Total SCF energy =     -2.855160477254
 
244
      One-electron energy =     -3.882025095285
 
245
      Two-electron energy =      1.026864618031
 
246
 Nuclear repulsion energy =      0.000000000000
 
247
 
 
248
        Time for solution =      0.0s
 
249
 
 
250
 
 
251
             Final eigenvalues
 
252
             -----------------
 
253
 
 
254
              1      
 
255
    1   -0.9141
 
256
    2    1.3974
 
257
    3    2.5244
 
258
    4    2.5244
 
259
    5    2.5244
 
260
 
 
261
                       ROHF Final Molecular Orbital Analysis
 
262
                       -------------------------------------
 
263
 
 
264
 Vector    1  Occ=2.000000D+00  E=-9.141479D-01
 
265
              MO Center=  0.0D+00,  0.0D+00,  0.0D+00, r^2= 3.3D-01
 
266
   Bfn.  Coefficient  Atom+Function         Bfn.  Coefficient  Atom+Function  
 
267
  ----- ------------  ---------------      ----- ------------  ---------------
 
268
     1      0.592616  1 He s                  2      0.513027  1 He s          
 
269
 
 
270
 Vector    2  Occ=0.000000D+00  E= 1.397442D+00
 
271
              MO Center=  0.0D+00,  0.0D+00,  0.0D+00, r^2= 7.3D-01
 
272
   Bfn.  Coefficient  Atom+Function         Bfn.  Coefficient  Atom+Function  
 
273
  ----- ------------  ---------------      ----- ------------  ---------------
 
274
     2      1.187231  1 He s                  1     -1.149573  1 He s          
 
275
 
 
276
 Vector    3  Occ=0.000000D+00  E= 2.524372D+00
 
277
              MO Center=  0.0D+00,  0.0D+00,  0.0D+00, r^2= 2.7D-01
 
278
   Bfn.  Coefficient  Atom+Function         Bfn.  Coefficient  Atom+Function  
 
279
  ----- ------------  ---------------      ----- ------------  ---------------
 
280
     4      1.000000  1 He py         
 
281
 
 
282
 Vector    4  Occ=0.000000D+00  E= 2.524372D+00
 
283
              MO Center=  0.0D+00,  0.0D+00,  0.0D+00, r^2= 2.7D-01
 
284
   Bfn.  Coefficient  Atom+Function         Bfn.  Coefficient  Atom+Function  
 
285
  ----- ------------  ---------------      ----- ------------  ---------------
 
286
     3      1.000000  1 He px         
 
287
 
 
288
 Vector    5  Occ=0.000000D+00  E= 2.524372D+00
 
289
              MO Center=  0.0D+00,  0.0D+00,  0.0D+00, r^2= 2.7D-01
 
290
   Bfn.  Coefficient  Atom+Function         Bfn.  Coefficient  Atom+Function  
 
291
  ----- ------------  ---------------      ----- ------------  ---------------
 
292
     5      1.000000  1 He pz         
 
293
 
 
294
 
 
295
 center of mass
 
296
 --------------
 
297
 x =   0.00000000 y =   0.00000000 z =   0.00000000
 
298
 
 
299
 moments of inertia (a.u.)
 
300
 ------------------
 
301
           0.000000000000           0.000000000000           0.000000000000
 
302
           0.000000000000           0.000000000000           0.000000000000
 
303
           0.000000000000           0.000000000000           0.000000000000
 
304
 
 
305
  Mulliken analysis of the total density
 
306
  --------------------------------------
 
307
 
 
308
    Atom       Charge   Shell Charges
 
309
 -----------   ------   -------------------------------------------------------
 
310
    1 He   2     2.00   1.09  0.91  0.00
 
311
 
 
312
       Multipole analysis of the density wrt the origin
 
313
       ------------------------------------------------
 
314
 
 
315
     L   x y z        total         open         nuclear
 
316
     -   - - -        -----         ----         -------
 
317
     0   0 0 0      0.000000      0.000000      2.000000
 
318
 
 
319
     1   1 0 0      0.000000      0.000000      0.000000
 
320
     1   0 1 0      0.000000      0.000000      0.000000
 
321
     1   0 0 1      0.000000      0.000000      0.000000
 
322
 
 
323
     2   2 0 0     -0.775173      0.000000      0.000000
 
324
     2   1 1 0      0.000000      0.000000      0.000000
 
325
     2   1 0 1      0.000000      0.000000      0.000000
 
326
     2   0 2 0     -0.775173      0.000000      0.000000
 
327
     2   0 1 1      0.000000      0.000000      0.000000
 
328
     2   0 0 2     -0.775173      0.000000      0.000000
 
329
 
 
330
 
 
331
 Parallel integral file used       1 records with       0 large values
 
332
 
 
333
 
 
334
 Task  times  cpu:        0.0s     wall:        0.1s
 
335
 Summary of allocated global arrays
 
336
-----------------------------------
 
337
  No active global arrays
 
338
 
 
339
 
 
340
 
 
341
                         GA Statistics for process    0
 
342
                         ------------------------------
 
343
 
 
344
       create   destroy   get      put      acc     scatter   gather  read&inc
 
345
calls:   40       40      188      120       11        0        0        0     
 
346
number of processes/call 1.00e+00 1.00e+00 1.00e+00 0.00e+00 0.00e+00
 
347
bytes total:             1.58e+04 9.88e+03 1.34e+03 0.00e+00 0.00e+00 0.00e+00
 
348
bytes remote:            0.00e+00 0.00e+00 0.00e+00 0.00e+00 0.00e+00 0.00e+00
 
349
Max memory consumed for GA by this process: 2600 bytes
 
350
MA_summarize_allocated_blocks: starting scan ...
 
351
MA_summarize_allocated_blocks: scan completed: 0 heap blocks, 0 stack blocks
 
352
MA usage statistics:
 
353
 
 
354
        allocation statistics:
 
355
                                              heap           stack
 
356
                                              ----           -----
 
357
        current number of blocks                 0               0
 
358
        maximum number of blocks                17              14
 
359
        current total bytes                      0               0
 
360
        maximum total bytes                1052240        22508936
 
361
        maximum total K-bytes                 1053           22509
 
362
        maximum total M-bytes                    2              23
 
363
 
 
364
 
 
365
                                NWChem Input Module
 
366
                                -------------------
 
367
 
 
368
 
 
369
 
 
370
 
 
371
 
 
372
                                     CITATION
 
373
                                     --------
 
374
                Please cite the following reference when publishing
 
375
                           results obtained with NWChem:
 
376
 
 
377
                 M. Valiev, E.J. Bylaska, N. Govind, K. Kowalski,
 
378
              T.P. Straatsma, H.J.J. van Dam, D. Wang, J. Nieplocha,
 
379
                        E. Apra, T.L. Windus, W.A. de Jong
 
380
                 "NWChem: a comprehensive and scalable open-source
 
381
                  solution for large scale molecular simulations"
 
382
                      Comput. Phys. Commun. 181, 1477 (2010)
 
383
                           doi:10.1016/j.cpc.2010.04.018
 
384
 
 
385
                              AUTHORS & CONTRIBUTORS
 
386
                              ----------------------
 
387
      E. J. Bylaska, W. A. de Jong, N. Govind, K. Kowalski, T. P. Straatsma,
 
388
     M. Valiev, H. J. J. van Dam, D. Wang, E. Apra, T. L. Windus, J. Hammond,
 
389
    J. Autschbach, F. Aquino, J. Mullin, P. Nichols, S. Hirata, M. T. Hackler,
 
390
   Y. Zhao, P.-D. Fan, R. J. Harrison, M. Dupuis, D. M. A. Smith, K. Glaesemann,
 
391
    J. Nieplocha, V. Tipparaju, M. Krishnan, A. Vazquez-Mayagoitia, L. Jensen,
 
392
      M. Swart, Q. Wu, T. Van Voorhis, A. A. Auer, M. Nooijen, L. D. Crosby,
 
393
        E. Brown, G. Cisneros, G. I. Fann, H. Fruchtl, J. Garza, K. Hirao,
 
394
        R. Kendall, J. A. Nichols, K. Tsemekhman, K. Wolinski, J. Anchell,
 
395
       D. Bernholdt, P. Borowski, T. Clark, D. Clerc, H. Dachsel, M. Deegan,
 
396
        K. Dyall, D. Elwood, E. Glendening, M. Gutowski, A. Hess, J. Jaffe,
 
397
        B. Johnson, J. Ju, R. Kobayashi, R. Kutteh, Z. Lin, R. Littlefield,
 
398
    X. Long, B. Meng, T. Nakajima, S. Niu, R. Peverati, L. Pollack, M. Rosing,
 
399
          G. Sandrone, M. Stave, H. Taylor, G. Thomas, J. H. van Lenthe,
 
400
                                A. Wong, Z. Zhang.
 
401
 
 
402
 Total times  cpu:        0.0s     wall:        0.1s