~ubuntu-branches/ubuntu/edgy/ncbi-tools6/edgy

« back to all changes in this revision

Viewing changes to api/salsap.h

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Barry deFreese
  • Date: 2006-07-19 23:28:07 UTC
  • mfrom: (1.1.5 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20060719232807-et3cdmcjgmnyleyx
Tags: 6.1.20060507-3ubuntu1
Re-merge with Debian

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
28
28
*
29
29
* Version Creation Date:   1/27/96
30
30
*
31
 
* $Revision: 6.3 $
 
31
* $Revision: 6.4 $
32
32
*
33
33
* File Description: 
34
34
*
35
35
* Modifications:  
36
36
* --------------------------------------------------------------------------
37
37
* $Log: salsap.h,v $
 
38
* Revision 6.4  2006/01/10 22:27:06  bollin
 
39
* added function SeqAlignInsertByLoc, to be used when nucleotides are inserted
 
40
* into a sequence that is in an alignment.  An extra segment, where all functions
 
41
* except the one with the insertion are gapped, is created.
 
42
*
38
43
* Revision 6.3  1999/11/24 21:24:28  vakatov
39
44
* Fixed for the C++ and/or MSVC DLL compilation
40
45
*
156
161
        Int4 stop1, Int4 stop2, Int4 x1, Int4 y1, Int4 x2, Int4 y2, 
157
162
        Uint1 strand1, Uint1 strand2);
158
163
 
 
164
NLM_EXTERN SeqAlignPtr LIBCALL SeqAlignInsertByLoc (SeqLocPtr slp, SeqAlignPtr salp);
159
165
 
160
166
/**Delete, Truncate**/
161
167
NLM_EXTERN SeqAlignPtr LIBCALL SeqAlignDeleteByLoc (SeqLocPtr slp, SeqAlignPtr salp);