~ubuntu-branches/ubuntu/utopic/r-bioc-cummerbund/utopic

« back to all changes in this revision

Viewing changes to man/runInfo.Rd

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Andreas Tille
  • Date: 2013-12-28 17:17:25 UTC
  • mfrom: (1.1.2)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20131228171725-polmzo8go4m371c6
Tags: 2.4.1-1
* New upstream version
* debian/rules: Remove useless creation of ${R-Depends}
* debian/control: Versioned Build-Depends: r-base-dev (>= 3.0)
* debian/README.test: add hint how to test the package

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
\name{runInfo}
 
2
\alias{runInfo}
 
3
\alias{runInfo,CuffSet-method}
 
4
 
 
5
%- Also NEED an '\alias' for EACH other topic documented here.
 
6
\title{
 
7
Retrieve run parameters and information from a CuffSet object
 
8
}
 
9
\description{
 
10
Returns a data.frame of cuffdiff run parameters and information
 
11
}
 
12
\usage{
 
13
\S4method{runInfo}{CuffSet}(object)
 
14
}
 
15
%- maybe also 'usage' for other objects documented here.
 
16
\arguments{
 
17
  \item{object}{
 
18
An object of class ('CuffSet')
 
19
}
 
20
}
 
21
\details{
 
22
None
 
23
}
 
24
\value{
 
25
A data.frame of run parameters
 
26
}
 
27
\references{
 
28
None
 
29
}
 
30
\author{
 
31
Loyal A. Goff
 
32
}
 
33
\note{
 
34
None
 
35
}
 
36
 
 
37
%% ~Make other sections like Warning with \section{Warning }{....} ~
 
38
 
 
39
\seealso{
 
40
None
 
41
}
 
42
\examples{
 
43
 
 
44
        a<-readCufflinks(system.file("extdata", package="cummeRbund")) #Create CuffSet object
 
45
        runInfo(a)
 
46
}
 
47