~ubuntu-branches/ubuntu/wily/grass/wily

« back to all changes in this revision

Viewing changes to raster/r.in.gdal/r.in.gdal.html

Tags: 7.0.0~rc1+ds1-1~exp1
* New upstream release candidate.
* Repack upstream tarball, remove precompiled Python objects.
* Add upstream metadata.
* Update gbp.conf and Vcs-Git URL to use the experimental branch.
* Update watch file for GRASS 7.0.
* Drop build dependencies for Tcl/Tk, add build dependencies:
  python-numpy, libnetcdf-dev, netcdf-bin, libblas-dev, liblapack-dev
* Update Vcs-Browser URL to use cgit instead of gitweb.
* Update paths to use grass70.
* Add configure options: --with-netcdf, --with-blas, --with-lapack,
  remove --with-tcltk-includes.
* Update patches for GRASS 7.
* Update copyright file, changes:
  - Update copyright years
  - Group files by license
  - Remove unused license sections
* Add patches for various typos.
* Fix desktop file with patch instead of d/rules.
* Use minimal dh rules.
* Bump Standards-Version to 3.9.6, no changes.
* Use dpkg-maintscript-helper to replace directories with symlinks.
  (closes: #776349)
* Update my email to use @debian.org address.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
<h2>DESCRIPTION</h2>
 
2
 
 
3
<em>r.in.gdal</em> allows a user to create a (binary) GRASS raster map layer,
 
4
or imagery group, from any GDAL supported raster map format, with an optional 
 
5
title. The imported file may also be optionally used to create a new location.
 
6
 
 
7
<!--
 
8
 
 
9
Extended explanations:
 
10
 
 
11
<dt><b>-e</b>
 
12
<dd>Extend the DEFAULT_WIND in PERMANENT mapset to include the region of
 
13
the new map layer.  Old resolution is preserved, but the region, and rows/cols
 
14
are updated.  This will fail if the user doesn't have write access to the
 
15
PERMANENT mapset.
 
16
</dl>-->
 
17
 
 
18
<h3>GDAL supported raster formats</h3>
 
19
 
 
20
Full details on GDAL supported formats are available at:<p>
 
21
<a href="http://www.gdal.org/formats_list.html">http://www.gdal.org/formats_list.html</a><p>
 
22
Selected formats of the more than 80 supported formats:
 
23
<div class="code"><pre>
 
24
 
 
25
Long Format Name                                        Code                    Creation        Georeferencing          Maximum File Size
 
26
 
 
27
Arc/Info ASCII Grid                                     AAIGrid                 Yes             Yes                     No limits
 
28
Arc/Info Binary Grid                                    AIG                     No              Yes                     --
 
29
AIRSAR Polarimetric                                     AIRSAR                  No              No                      --
 
30
Microsoft Windows Device Independent Bitmap (.bmp)      BMP                     Yes             Yes                     4GiB
 
31
BSB Nautical Chart Format (.kap)                        BSB                     No              Yes                     --
 
32
VTP Binary Terrain Format (.bt)                         BT                      Yes             Yes                     --
 
33
CEOS (Spot for instance)                                CEOS                    No              No                      --
 
34
First Generation USGS DOQ (.doq)                        DOQ1                    No              Yes                     --
 
35
New Labelled USGS DOQ (.doq)                            DOQ2                    No              Yes                     --
 
36
Data (.dt0, .dt1)                                       DTED                    No              Yes                     --
 
37
ERMapper Compressed Wavelets (.ecw)                     ECW                     Yes             Yes                     
 
38
ESRI .hdr Labelled                                      EHdr                    No              Yes                     --
 
39
ENVI .hdr Labelled Raster                               ENVI                    Yes             Yes                     No limits
 
40
Envisat Image Product (.n1)                             Envisat                 No              No                      --
 
41
EOSAT FAST Format                                       FAST                    No              Yes                     --
 
42
FITS (.fits)                                            FITS                    Yes             No                      
 
43
Graphics Interchange Format (.gif)                      GIF                     Yes             No                      2GB
 
44
Arc/Info Binary Grid (.adf)                             GIO                     Yes             Yes                  
 
45
GRASS Rasters                                           GRASS                   No              Yes                     --
 
46
TIFF / GeoTIFF (.tif)                                   GTiff                   Yes             Yes                     4GiB
 
47
Hierarchical Data Format Release 4 (HDF4)               HDF4                    Yes             Yes                     2GiB
 
48
Erdas Imagine (.img)                                    HFA                     Yes             Yes                     No limits
 
49
Atlantis MFF2e                                          HKV                     Yes             Yes                     No limits
 
50
Image Display and Analysis (WinDisp)                    IDA                     Yes             Yes                     2GB
 
51
ILWIS Raster Map (.mpr,.mpl)                            ILWIS                   Yes             Yes                     --
 
52
Japanese DEM (.mem)                                     JDEM                    No              Yes                     --
 
53
JPEG JFIF (.jpg)                                        JPEG                    Yes             Yes                     4GiB (max dimentions 65500x65500)
 
54
JPEG2000 (.jp2, .j2k)                                   JPEG2000                Yes             Yes                     2GiB
 
55
JPEG2000 (.jp2, .j2k)                                   JP2KAK                  Yes             Yes                     No limits
 
56
NOAA Polar Orbiter Level 1b Data Set (AVHRR)            L1B                     No              Yes                     --
 
57
Erdas 7.x .LAN and .GIS                                 LAN                     No              Yes                     2GB
 
58
In Memory Raster                                        MEM                     Yes             Yes                     2GiB
 
59
Atlantis MFF                                            MFF                     Yes             Yes                     No limits
 
60
Multi-resolution Seamless Image Database                MrSID                   No              Yes                     --
 
61
NDF                                                     NLAPS Data Format       No              Yes                     No limits
 
62
NITF                                                    NITF                    Yes             Yes             
 
63
NetCDF                                                  netCDF                  Yes             Yes                     2GB
 
64
OGDI Bridge                                             OGDI                    No              Yes                     --
 
65
PCI .aux Labelled                                       PAux                    Yes             No                      No limits
 
66
PCI Geomatics Database File                             PCIDSK                  Yes             Yes                     No limits
 
67
Portable Network Graphics (.png)                        PNG                     Yes             No              
 
68
PCRaster (.map)                                         PCRaster                Yes             No                      
 
69
Netpbm (.ppm,.pgm)                                      PNM                     Yes             No                      No limits
 
70
RadarSat2 XML (product.xml)                             RS2                     No              Yes                     4GB
 
71
USGS SDTS DEM (*CATD.DDF)                               SDTS                    No              Yes                     --
 
72
SAR CEOS                                                SAR_CEOS                No              Yes                     --
 
73
USGS ASCII DEM (.dem)                                   USGSDEM                 No              Yes                     --
 
74
X11 Pixmap (.xpm)                                       XPM                     Yes             No                      
 
75
</pre></div>
 
76
 
 
77
<h3>Location Creation</h3>
 
78
 
 
79
<em>r.in.gdal</em> attempts to preserve projection information when importing
 
80
datasets if the source format includes projection information, and if
 
81
the GDAL driver supports it.  If the projection of the source dataset does
 
82
not match the projection of the current location <em>r.in.gdal</em> will 
 
83
report an error message (<tt>Projection of dataset does not appear to 
 
84
match current location</tt>) and then report the PROJ_INFO parameters of
 
85
the source dataset.
 
86
 
 
87
<p>If the user wishes to ignore the difference between the apparent coordinate
 
88
system of the source data and the current location, they may pass the 
 
89
<b>-o</b> flag to override the projection check. 
 
90
 
 
91
<p>
 
92
If the user wishes to import the data with the full projection definition,
 
93
it is possible to have r.in.gdal automatically create a new location based
 
94
on the projection and extents of the file being read.  This is accomplished
 
95
by passing the name to be used for the new location via the <b>location</b>
 
96
parameter.  Upon completion of the command, a new location will have been
 
97
created (with only a PERMANENT mapset), and the raster will have been
 
98
imported with the indicated <b>output</b> name into the PERMANENT mapset.
 
99
 
 
100
<h3>Support for GCPs</h3>
 
101
In case the image contains GCPs they are written to a
 
102
POINTS file within an imagery group. They can directly be used for 
 
103
<a href=i.rectify.html>i.rectify</a>.
 
104
<p>
 
105
The <b>target</b> option allows you to automatically re-project the GCPs 
 
106
from their own projection into another projection read from the 
 
107
PROJ_INFO file of the location name <b>target</b>. 
 
108
<p>
 
109
If the <b>target</b> location does not exist, a new location will be 
 
110
created matching the projection definition of the GCPs. The target of 
 
111
the output group will be set to the new location, and 
 
112
<a href=i.rectify.html>i.rectify</a> can now be used without any further 
 
113
preparation. 
 
114
<p>
 
115
Some satellite images (e.g. NOAA/AVHRR, ENVISAT) can contain hundreds 
 
116
or thousands of GCPs. In these cases thin plate spline coordinate 
 
117
transformation is recommended, either before import with 
 
118
<b>gdalwarp -tps</b> or after import with <b>i.rectify -t</b>.
 
119
 
 
120
<h2>NOTES</h2>
 
121
 
 
122
Import of large files can be significantly faster when setting <b>memory</b> to
 
123
the size of the input file.
 
124
 
 
125
<p>The <em>r.in.gdal</em> command does support the following features, as long as 
 
126
the underlying format driver supports it:
 
127
 
 
128
<p>
 
129
<dl>
 
130
 
 
131
<dt> Color Table
 
132
<dd> Bands with associated colortables will have the color tables transferred.
 
133
Note that if the source has no colormap, r.in.gdal in GRASS 5.0 will emit
 
134
no colormap.  Use r.colors map=... color=grey to assign a greyscale colormap.
 
135
In a future version of GRASS r.in.gdal will likely be upgraded to automatically
 
136
emit greyscale colormaps.<br>
 
137
 
 
138
<dt> Data Types
 
139
<dd> Most GDAL data types are supported.  Float32 and Float64 type bands
 
140
are translated as GRASS floating point cells (but not double precision ...
 
141
this could be added if needed), and most other types are translated as 
 
142
GRASS integer cells.  This includes 16bit integer data sources.  Complex
 
143
(some SAR signal data formats) data bands are translated to two floating
 
144
point cell layers (*.real and *.imaginary).<br>
 
145
 
 
146
<dt> Georeferencing
 
147
<dd> If the dataset has affine georeferencing information, this will be used
 
148
to set the north, south, east and west edges.  Rotational coefficients will
 
149
be ignored, resulting in incorrect positioning for rotated datasets.<br>
 
150
 
 
151
<dt> Projection
 
152
<dd> The datasets projection will be used to compare to the current location
 
153
or to define a new location.  Internally GDAL represents projections in 
 
154
OpenGIS Well Known Text format.  A large subset of the total set of GRASS
 
155
projections are supported.<br>
 
156
 
 
157
<dt> Null Values
 
158
<dd> Raster bands for which a null value is recognised by GDAL will have
 
159
the null pixels transformed into GRASS style nulls during import.  Many
 
160
generic formats (and formats poorly supported by GDAL) do not have a way
 
161
of recognising null pixels in which case r.null should be used after the
 
162
import.<br>
 
163
 
 
164
<dt> GCPs
 
165
<dd> Datasets that have Ground Control Points will have them imported as
 
166
a POINTS file associated with the imagery group.  Datasets with only one
 
167
band that would otherwise have been translated as a simple raster map
 
168
will also have an associated imagery group if there are ground control points.
 
169
The coordinate system of the ground control points is reported by r.in.gdal
 
170
but not preserved.  It is up to the user to ensure that the location 
 
171
established with i.target has a compatible coordinate system before using
 
172
the points with i.rectify.<br>
 
173
 
 
174
</dl>
 
175
 
 
176
<p>Planned improvements to <em>r.in.gdal</em> in the future include support for
 
177
reporting everything known about a dataset if the <b>output</b> parameter is not set.
 
178
 
 
179
<h3>Error Messages</h3>
 
180
 
 
181
<i>"ERROR: Input map is rotated - cannot import."</i><br>
 
182
In this case the image must be first externally rotated, applying the rotation info stored in 
 
183
the metadata field of the raster image file. For example, the 
 
184
<a href="http://www.gdal.org/gdal_utilities.html">gdalwarp</a>  software can be used 
 
185
to transform the map to North-up (note, there are several gdalwarp parameters to select the
 
186
resampling algorithm):
 
187
 
 
188
<div class="code"><pre>
 
189
gdalwarp rotated.tif northup.tif
 
190
</pre></div>
 
191
 
 
192
<p><i>"ERROR: Projection of dataset does not appear to match the current location."</i><br>
 
193
 
 
194
You need to create a location whose projection matches the data you
 
195
wish to import. Try using <b>location</b> parameter to create a new
 
196
location based upon the projection information in the file. If desired,
 
197
you can then re-project it to another location with <em>r.proj</em>.
 
198
Alternatively you can override this error by using the <b>-o</b> flag.
 
199
 
 
200
<p><i>"WARNING: G_set_window(): Illegal latitude for North"</i><br>
 
201
 
 
202
Latitude/Longitude locations in GRASS can not have regions which exceed
 
203
90&deg; North or South. Non-georeferenced imagery will have coordinates
 
204
based on the images's number of pixels: 0,0 in the bottom left; cols,rows
 
205
in the top right. Typically imagery will be much more than 90 pixels tall
 
206
and so the GIS refuses to import it. If you are sure that the data is
 
207
appropriate for your Lat/Lon location and intentd to reset the map's
 
208
bounds with the <em>r.region</em> module directly after import you may
 
209
use the <b>-l</b> flag to constrain the map coordinates to legal values.
 
210
 
 
211
While the resulting bounds and resolution will likely be wrong for your
 
212
map the map's data will be unaltered and safe. After resetting to known
 
213
bounds with <em>r.region</em> you should double check them with
 
214
<em>r.info</em>, paying special attention to the map resolution. In most
 
215
cases you will want to import into the datafile's native projection, or
 
216
into a simple XY location and use the Georectifaction tools
 
217
(<em>i.rectify</em> et al.) to properly project into the target location.
 
218
The <b>-l</b> flag should <i>only</i> be used if you know the projection
 
219
is correct but the internal georeferencing has gotten lost, and you know
 
220
the what the map's bounds and resolution should be beforehand.
 
221
 
 
222
 
 
223
<h2>EXAMPLES</h2>
 
224
 
 
225
<h3>ECAD Data</h3>
 
226
 
 
227
The <a href="http://eca.knmi.nl/">European Climate Assessment and Dataset (ECAD) project</a> 
 
228
provides climate data for europe ranging from 1950 - 2010. To import the different 
 
229
chunks of data provided by the project as netCDF files, the offset parameter can be used to get 
 
230
daily numbered raster maps from 1. Jan. 1950 on. Make sure you are in a LatLong location.
 
231
 
 
232
<div class="code"><pre>
 
233
# Import precipitation data
 
234
r.in.gdal -o input=rr_0.25deg_reg_1950-1964_v4.0.nc output=precipitation offset=0
 
235
r.in.gdal -o input=rr_0.25deg_reg_1965-1979_v4.0.nc output=precipitation offset=5479
 
236
r.in.gdal -o input=rr_0.25deg_reg_1980-1994_v4.0.nc output=precipitation offset=10957
 
237
r.in.gdal -o input=rr_0.25deg_reg_1995-2010_v4.0.nc output=precipitation offset=16436
 
238
 
 
239
# Import air pressure data
 
240
r.in.gdal -o input=pp_0.25deg_reg_1950-1964_v4.0.nc output=air_pressure offset=0
 
241
r.in.gdal -o input=pp_0.25deg_reg_1965-1979_v4.0.nc output=air_pressure offset=5479
 
242
r.in.gdal -o input=pp_0.25deg_reg_1980-1994_v4.0.nc output=air_pressure offset=10957
 
243
r.in.gdal -o input=pp_0.25deg_reg_1995-2010_v4.0.nc output=air_pressure offset=16436
 
244
 
 
245
# Import min temperature data
 
246
r.in.gdal -o input=tn_0.25deg_reg_1950-1964_v4.0.nc output=temperatur_min offset=0
 
247
r.in.gdal -o input=tn_0.25deg_reg_1965-1979_v4.0.nc output=temperatur_min offset=5479
 
248
r.in.gdal -o input=tn_0.25deg_reg_1980-1994_v4.0.nc output=temperatur_min offset=10957
 
249
r.in.gdal -o input=tn_0.25deg_reg_1995-2010_v4.0.nc output=temperatur_min offset=16436
 
250
 
 
251
# Import max temperature data
 
252
r.in.gdal -o input=tx_0.25deg_reg_1950-1964_v4.0.nc output=temperatur_max offset=0
 
253
r.in.gdal -o input=tx_0.25deg_reg_1965-1979_v4.0.nc output=temperatur_max offset=5479
 
254
r.in.gdal -o input=tx_0.25deg_reg_1980-1994_v4.0.nc output=temperatur_max offset=10957
 
255
r.in.gdal -o input=tx_0.25deg_reg_1995-2010_v4.0.nc output=temperatur_max offset=16436
 
256
 
 
257
# Import mean temperature data
 
258
r.in.gdal -o input=tg_0.25deg_reg_1950-1964_v4.0.nc output=temperatur_mean offset=0
 
259
r.in.gdal -o input=tg_0.25deg_reg_1965-1979_v4.0.nc output=temperatur_mean offset=5479
 
260
r.in.gdal -o input=tg_0.25deg_reg_1980-1994_v4.0.nc output=temperatur_mean offset=10957
 
261
r.in.gdal -o input=tg_0.25deg_reg_1995-2010_v4.0.nc output=temperatur_mean offset=16436
 
262
</pre></div>
 
263
 
 
264
 
 
265
<h3>GTOPO30 DEM</h3>
 
266
 
 
267
To avoid that the GTOPO30 data are read incorrectly, you can add a new line
 
268
"PIXELTYPE SIGNEDINT" in the .HDR to force interpretation of the file as
 
269
signed rather than unsigned integers. Then the .DEM file can be imported.
 
270
Finally, e.g. the 'terrain' color table can be assigned to the imported map
 
271
with <em>r.colors</em>.
 
272
 
 
273
 
 
274
<h3>GLOBE DEM</h3>
 
275
 
 
276
To import <a href="http://www.ngdc.noaa.gov/seg/topo/gltiles.shtml">GLOBE DEM tiles</a>
 
277
(approx 1km resolution, better than GTOPO30 DEM data), the user has to download
 
278
additionally the related <a href="ftp://ftp.ngdc.noaa.gov/GLOBE_DEM/data/elev/esri/hdr/">HDR file(s)</a>.
 
279
Finally, e.g. the 'terrain' color table can be assigned to the imported map with <em>r.colors</em>.
 
280
 
 
281
<h3>Worldclim.org</h3>
 
282
To import <a href="http://www.worldclim.org">Worldclim</a> data, the following
 
283
line has to be added to each .hdr file:
 
284
<div class="code"><pre>
 
285
PIXELTYPE SIGNEDINT
 
286
</pre></div>
 
287
 
 
288
<h3>HDF</h3>
 
289
 
 
290
The import of HDF bands requires the specification of the individual bands
 
291
as seen by GDAL:
 
292
<div class="code"><pre>
 
293
# Example MODIS FPAR
 
294
gdalinfo MOD15A2.A2003153.h18v04.004.2003171141042.hdf
 
295
...
 
296
Subdatasets:
 
297
  SUBDATASET_1_NAME=HDF4_EOS:EOS_GRID:"MOD15A2.A2003153.h18v04.004.2003171141042.hdf":MOD_Grid_MOD15A2:Fpar_1km
 
298
  SUBDATASET_1_DESC=[1200x1200] Fpar_1km MOD_Grid_MOD15A2 (8-bit unsigned integer)
 
299
  SUBDATASET_2_NAME=HDF4_EOS:EOS_GRID:"MOD15A2.A2003153.h18v04.004.2003171141042.hdf":MOD_Grid_MOD15A2:Lai_1km
 
300
  SUBDATASET_2_DESC=[1200x1200] Lai_1km MOD_Grid_MOD15A2 (8-bit unsigned integer)
 
301
...
 
302
 
 
303
# import of first band, here FPAR 1km:
 
304
r.in.gdal HDF4_EOS:EOS_GRID:"MOD15A2.A2003153.h18v04.004.2003171141042.hdf":MOD_Grid_MOD15A2:Fpar_1km \
 
305
          out=fpar_1km_2003_06_02
 
306
# ... likewise for other HDF bands in the file.
 
307
</pre></div>
 
308
 
 
309
 
 
310
<h2>SEE ALSO</h2>
 
311
<em>
 
312
<a href="r.colors.html">r.colors</a>,
 
313
<a href="r.in.ascii.html">r.in.ascii</a>,
 
314
<a href="r.in.bin.html">r.in.bin</a>,
 
315
<a href="r.null.html">r.null</a>
 
316
</em>
 
317
 
 
318
 
 
319
<h2>REFERENCES</h2>
 
320
 
 
321
GDAL Pages: <a href="http://www.gdal.org">http://www.gdal.org/</a><br>
 
322
 
 
323
 
 
324
<h2>AUTHOR</h2>
 
325
 
 
326
<a href="http://home.gdal.org/warmerda/">Frank Warmerdam</a>
 
327
 (<a href="mailto:warmerdam AT pobox dot com">email</a>).
 
328
 
 
329
<p><i>Last changed: $Date: 2014-11-01 20:59:34 +0100 (Sat, 01 Nov 2014) $</i>