← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/wily/openms/wily

« back to all changes in this revision

Viewing changes to source/TEST/data/PepNovoOutfile.out

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Filippo Rusconi
  • Date: 2012-11-12 15:58:12 UTC
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20121112155812-vr15wtg9b50cuesg
Tags: upstream-1.9.0
Import upstream version 1.9.0

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
source/TEST/data/PepNovoOutfile.out
 
1
PepNovo+, Build 20081230
 
2
Copyright 2008, The Regents of the University of California. All Rights Reserved.
 
3
Created by Ari Frank (arf@cs.ucsd.edu)
 
4
 
 
5
Initializing models (this might take a few seconds)... Done.
 
6
Fragment tolerance : 0.5000
 
7
PM tolernace       : 2.5000
 
8
PTMs considered    : K+42:Y+42
 
9
 
 
10
*** Warning: searching with unmodified cystine, usually the PTM C+57 should be included ***
 
11
 
 
12
 
 
13
>> 0 1
 
14
#Index  RnkScr  PnvScr  N-Gap   C-Gap   [M+H]   Charge  Sequence
 
15
0       9.888   109.029 0.000   0.000   873.621 2       VKEAMAPK
 
16
1       9.236   97.953  99.281  0.000   873.621 2       KEAMAPK
 
17
2       8.872   95.284  0.000   0.000   873.621 2       VKEMAAPK
 
18
3       8.720   95.559  99.281  0.000   873.621 2       KESDAPK
 
19
4       8.640   106.635 0.000   0.000   873.621 2       VKESDAPK
 
20
5       8.472   98.366  99.281  0.000   873.621 2       QEAMAPK
 
21
6       8.383   94.479  99.281  0.000   873.621 2       KSLMAPK
 
22
7       8.348   92.526  0.000   0.000   873.621 2       VKSSDLPK
 
23
8       8.321   110.062 0.000   0.000   873.621 2       VKSMALPK
 
24
9       8.258   114.657 0.000   0.000   873.621 2       VKSMLAPK
 
25
10      8.211   80.165  127.731 0.000   873.031 2       VEAMAPK
 
26
11      8.045   92.633  0.000   0.000   873.621 2       GK+42EAMAPK
 
27
12      8.032   95.220  0.000   0.000   873.621 2       AGVEAMAPK
 
28
13      7.994   87.907  0.000   0.000   873.621 2       VKEATTPK
 
29
14      7.951   93.127  0.000   0.000   873.621 2       NLEAMAPK
 
30
15      7.918   98.986  99.281  0.000   873.621 2       KSMALPK
 
31
16      7.900   94.642  0.000   0.000   873.621 2       VKECVAPK
 
32
17      7.871   105.116 0.000   0.000   873.621 2       VKETTAPK
 
33
18      7.719   95.971  99.281  0.000   873.621 2       QESDAPK
 
34
19      7.632   103.581 99.281  0.000   873.621 2       KSMLAPK
 
35