← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/edgy/ncbi-tools6/edgy

« back to all changes in this revision

Viewing changes to make/makenet.unx

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Barry deFreese
  • Date: 2006-07-19 23:28:07 UTC
  • mfrom: (1.1.5 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20060719232807-et3cdmcjgmnyleyx
Tags: 6.1.20060507-3ubuntu1
Re-merge with Debian

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
make/makenet.unx
1
1
#   -*- makefile -*- for network demo programs and network entrez
2
2
#
3
 
#       $Id: makenet.unx,v 6.210 2005/09/14 00:05:18 ucko Exp $
 
3
#       $Id: makenet.unx,v 6.216 2006/05/03 03:37:42 kans Exp $
4
4
#   test, ignore
5
5
#
6
6
#   Sun with unbundled ANSI compiler [ make CC=acc RAN=ranlib ]
388
388
 
389
389
vibutilities : $(EXEUTILVIB)
390
390
 
391
 
.NO_PARALLEL:   copy nocopy Tentrez sequin Psequin sbtedit Ssequin elecpcr asn2fast asn2asn Nbatch Nbatch3 Nentrcmd seqget idfetch test_ncbi_socket test_ncbi_dsock debug_server rtestval rasn2ff asn2gb asn2gb_psf asn2fsa asn2fsa_psf tbl2asn asn2all gene2xml asnval asnval_psf flint gbseqget insdseqget trna2sap trna2tbl testent2 entrez2 spidey dotmatrix ingenue condense bl2seq
 
391
.NO_PARALLEL:   copy nocopy Tentrez sequin Psequin sbtedit Ssequin elecpcr asn2fast asn2asn cleanasn Nbatch Nbatch3 Nentrcmd seqget idfetch test_ncbi_socket test_ncbi_dsock debug_server rtestval rasn2ff asn2gb asn2gb_psf asn2fsa asn2fsa_psf tbl2asn tbl2asn_psf asn2all gene2xml asnval asnval_psf flint gbseqget insdseqget trna2sap trna2tbl testent2 entrez2 spidey dotmatrix ingenue condense bl2seq
392
392
 
393
393
.WAIT:
394
394
        echo Waiting...go
506
506
        $(SRCCOPY) ../network/vibnet/*.h ../include
507
507
        $(SRCCOPY) ../cdromlib/*.h ../include
508
508
        -$(SRCCOPY) ../network/wwwblast/Src/*.c .
509
 
        -$(SRCCOPY) ../network/wwwblast/Src/*.h ../include
 
509
#       -$(SRCCOPY) ../network/wwwblast/Src/*.h ../include
510
510
        $(SRCCOPY) ../cdromlib/accentr.c .
511
511
        $(SRCCOPY) ../cdromlib/accutils.c .
512
512
        -$(SRCCOPY) ../sequin/*.* .
519
519
        $(SRCCOPY) ../demo/elecpcr.c .
520
520
        $(SRCCOPY) ../demo/asn2fast.c .
521
521
        $(SRCCOPY) ../demo/asn2asn.c .
 
522
        $(SRCCOPY) ../demo/cleanasn.c .
522
523
        $(SRCCOPY) ../demo/fetchent.c .
523
524
        $(SRCCOPY) ../demo/udvmain.c .
524
525
        $(SRCCOPY) ../demo/rtestval.c .
1001
1002
        $(CC) -o tbl2asn $(LDFLAGS) tbl2asn.c $(LIB23) $(LIBCOMPADJ) \
1002
1003
                $(LIB2) $(NETCLILIB) $(LIB1) $(OTHERLIBS) 
1003
1004
 
 
1005
# tbl2asn_psf, uses PUBSEQBioseqFetchEnable instead of PubSeqFetchEnable
 
1006
# should be used only internally within NCBI.
 
1007
tbl2asn_psf : tbl2asn.c 
 
1008
        $(CC) -DINTERNAL_NCBI_TBL2ASN -g -o tbl2asn_psf $(LDFLAGS) tbl2asn.c $(THREAD_OBJ) $(LIB_PS) \
 
1009
        $(LIB23) $(LIBCOMPADJ) $(LIB2) $(LIB1) $(NCBI_SYBLIBS_CT_r) \
 
1010
        $(OTHERLIBS) $(THREAD_OTHERLIBS)
 
1011
 
1004
1012
# gene2xml program (gene2xml)
1005
1013
gene2xml :      gene2xml.c
1006
1014
        $(CC) -g -o gene2xml $(LDFLAGS) gene2xml.c $(NETCLILIB) $(LIB2) $(LIB1) $(OTHERLIBS)
1014
1022
# asnval_psf, uses PUBSEQBioseqFetchEnable instead of PubSeqFetchEnable
1015
1023
# should be used only internally within NCBI.
1016
1024
asnval_psf :    asnval.c
1017
 
        $(CC) -INTERNAL_NCBI_ASN2VAL -g -o asnval_psf $(LDFLAGS) asnval.c $(THREAD_OBJ) $(LIB_PS) \
 
1025
        $(CC) -DINTERNAL_NCBI_ASN2VAL -g -o asnval_psf $(LDFLAGS) asnval.c $(THREAD_OBJ) $(LIB_PS) \
 
1026
        $(LIB23) $(LIBCOMPADJ) $(LIB2) $(LIB1) $(NCBI_SYBLIBS_CT_r) \
 
1027
        $(OTHERLIBS) $(THREAD_OTHERLIBS)
 
1028
 
 
1029
# asnval_dbx_psf, -- debug version -- uses PUBSEQBioseqFetchEnable instead of PubSeqFetchEnable
 
1030
# should be used only internally within NCBI.
 
1031
asnval_dbx_psf :        asnval.c
 
1032
        $(CC) -DINTERNAL_NCBI_ASN2VAL -g -o asnval_dbx_psf $(LDFLAGS) asnval.c $(THREAD_OBJ) $(LIB_PS) \
1018
1033
        $(LIB23) $(LIBCOMPADJ) $(LIB2) $(LIB1) $(NCBI_SYBLIBS_CT_r) \
1019
1034
        $(OTHERLIBS) $(THREAD_OTHERLIBS)
1020
1035
 
1094
1109
asn2asn : asn2asn.c
1095
1110
        $(CC) -o asn2asn $(LDFLAGS) asn2asn.c $(LIB41) $(LIB6) $(LIB2) $(LIB1) $(OTHERLIBS)
1096
1111
 
 
1112
# demo program (cleanasn)
 
1113
 
 
1114
cleanasn : cleanasn.c
 
1115
        $(CC) -o cleanasn $(LDFLAGS) cleanasn.c $(LIB41) $(LIB23) $(LIB6) $(LIB2) $(LIB1) $(OTHERLIBS)
 
1116
 
1097
1117
# demo program (fetchent)
1098
1118
 
1099
1119
fetchent : fetchent.c