~ubuntu-branches/ubuntu/edgy/ncbi-tools6/edgy

« back to all changes in this revision

Viewing changes to network/wwwblast/Src/Makefile.wblast2_cs

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Barry deFreese
  • Date: 2006-07-19 23:28:07 UTC
  • mfrom: (1.1.5 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20060719232807-et3cdmcjgmnyleyx
Tags: 6.1.20060507-3ubuntu1
Re-merge with Debian

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
#This is makefile for web blast2 that uses c++ showalign API
 
2
builddir = $(NCBI)/c++.metastable/DebugMT/build
 
3
builddir = $(NCBI)/c++.metastable/ReleaseMT/build
 
4
 
 
5
###  DEFAULT COMPILATION FLAGS  -- DON'T EDIT OR MOVE THESE 4 LINES !!!  ###
 
6
include $(builddir)/Makefile.mk
 
7
 
 
8
 
 
9
LOCAL_CPPFLAGS += -I. -I/netopt/ncbi_tools/include -I../../../../internal/blast/SplitDB -DNCBI_ENTREZ_CLIENT -DNCBI_CLIENT_SERVER -DNCBI_INTERNAL_NEW_FORMATTER
 
10
 
 
11
srcdir = .
 
12
BINCOPY = @:
 
13
 
 
14
 
 
15
APP = wblast2_cs.REAL
 
16
 
 
17
SRC = wblast2 showalignwrap
 
18
 
 
19
LIB = xblastformat xblast xnetblast scoremat xalntool xalnmgr blastxml xobjread ncbi_xloader_blastdb xobjutil $(OBJMGR_LIBS:=-static) xhtml xcgi seqdb  blastdb 
 
20
 
 
21
 
 
22
 
 
23
CPPFLAGS = $(ORIG_CPPFLAGS) $(NCBI_C_INCLUDE)
 
24
 
 
25
LIB += $(SD_DBAPI)
 
26
 
 
27
 
 
28
LIBS =  $(NCBI_C_LIBPATH) \
 
29
        -lbob -lsplitdbasn\
 
30
        -lncbitxc2 -lnetblast -lncbiid1 -lncbidesk -lblastapi -lncbitool -lblastcompadj \
 
31
        -lnetentr -lncbiNacc -lnetentr -lnetcli \
 
32
        -lvibgif -lncbidesk -lncbi -lvibrant -lncbicdr -lncbiobj -lncbi \
 
33
        $(NCBI_OTHERLIBS) $(CMPRS_LIBS) $(NETWORK_PURE_LIBS) $(ORIG_LIBS) \
 
34
        -lresolv -lconnext -lxncbi -ldl -lblast
 
35
 
 
36
CFLAGS   = $(ORIG_CFLAGS) 
 
37
CXXFLAGS = $(ORIG_CXXFLAGS)
 
38
LDFLAGS  = $(ORIG_LDFLAGS) \
 
39
         -L../../../../internal/blast/SplitDB/lib
 
40
 
 
41
#                                                                         ###
 
42
#############################################################################
 
43
 
 
44
 
 
45
###  APPLICATION BUILD RULES  -- DON'T EDIT OR MOVE THIS LINE !!!  ###
 
46
 
 
47
include $(builddir)/Makefile.app
 
48
MAKEFILE = Makefile.light_getreq_app
 
49
 
 
50
###  PUT YOUR OWN ADDITIONAL TARGETS (MAKE COMMANDS/RULES) BELOW HERE  ###
 
 
b'\\ No newline at end of file'