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Viewing changes to Bio/DB/RefSeq.pm

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Ilya Barygin
  • Date: 2010-01-27 22:48:22 UTC
  • mfrom: (3.1.4 squeeze)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20100127224822-ebot4qbrjxcv38au
Tags: 1.6.1-1ubuntu1
* Merge from Debian testing, remaining changes:
  - disable tests, they produce a FTBFS trying to access the network 
    during run.

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added added

removed removed

Lines of Context:
Bio/DB/RefSeq.pm
1
1
#
2
 
# $Id: RefSeq.pm 11480 2007-06-14 14:16:21Z sendu $
 
2
# $Id: RefSeq.pm 16168 2009-09-25 21:07:32Z cjfields $
3
3
#
4
4
# BioPerl module for Bio::DB::EMBL
5
5
#
 
6
# Please direct questions and support issues to <bioperl-l@bioperl.org> 
 
7
#
6
8
# Cared for by Heikki Lehvaslaiho <heikki-at-bioperl-dot-org>
7
9
#
8
10
# Copyright Jason Stajich
53
55
 
54
56
Allows the dynamic retrieval of sequence objects L<Bio::Seq> from the
55
57
RefSeq database using the dbfetch script at EBI:
56
 
L<http:E<sol>E<sol>www.ebi.ac.ukE<sol>cgi-binE<sol>dbfetch>.
 
58
 
 
59
http://www.ebi.ac.uk/cgi-bin/dbfetch
57
60
 
58
61
In order to make changes transparent we have host type (currently only
59
62
ebi) and location (defaults to ebi) separated out.  This allows later
78
81
  bioperl-l@bioperl.org                  - General discussion
79
82
  http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists  - About the mailing lists
80
83
 
 
84
=head2 Support 
 
85
 
 
86
Please direct usage questions or support issues to the mailing list:
 
87
 
 
88
I<bioperl-l@bioperl.org>
 
89
 
 
90
rather than to the module maintainer directly. Many experienced and 
 
91
reponsive experts will be able look at the problem and quickly 
 
92
address it. Please include a thorough description of the problem 
 
93
with code and data examples if at all possible.
 
94
 
81
95
=head2 Reporting Bugs
82
96
 
83
97
Report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track