← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/bioperl/trusty

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Bio/PopGen/IO.pm

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2013-09-22 13:39:48 UTC
  • mfrom: (3.1.11 sid)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20130922133948-c6z62zegjyp7ztou
Tags: 1.6.922-1
http://bugs.debian.org/722910
* New upstream release.
* Replaces and Breaks grinder (<< 0.5.3-3~) because of overlaping contents.
  Closes: #722910
* Stop Replacing and Breaking bioperl ( << 1.6.9 ): not needed anymore. 

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
Bio/PopGen/IO.pm
16
16
Bio::PopGen::IO - Input individual,marker,allele information
17
17
 
18
18
=head1 SYNOPSIS
19
 
 
 
19
 
20
20
  use Bio::PopGen::IO;
21
21
  my $io = Bio::PopGen::IO->new(-format => 'csv',
22
 
                               -file   => 'data.csv');
 
22
                                -file   => 'data.csv');
23
23
 
24
24
  # Some IO might support reading in a population at a time
25
25
 
126
126
  }
127
127
}
128
128
 
 
129
 
 
130
=head2 format
 
131
 
 
132
 Title   : format
 
133
 Usage   : $format = $stream->format()
 
134
 Function: Get the PopGen format
 
135
 Returns : PopGen format
 
136
 Args    : none
 
137
 
 
138
=cut
 
139
 
 
140
# format() method inherited from Bio::Root::IO
 
141
 
 
142
 
129
143
# _initialize is chained for all PopGen::IO classes
130
144
 
131
145
sub _initialize {