← Back to branch summary

~ubuntu-branches/debian/jessie/ugene/jessie

« back to all changes in this revision

Viewing changes to data/back_translation/Mammalia/Bos_taurus_(cow).cut

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Steffen Moeller
  • Date: 2011-11-02 13:29:07 UTC
  • mfrom: (1.2.1) (3.1.11 natty)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20111102132907-o34gwnt0uj5g6hen
Tags: 1.9.8+repack-1
* First release to Debian
  - added README.Debian
  - increased policy version to 3.9.2
  - added URLs for version control system
* Added debug package.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
data/back_translation/Mammalia/Bos_taurus_(cow).cut
 
1
#Species: Bos taurus
 
2
#Division: gbmam
 
3
#Release: CUTG160
 
4
#CdsCount: 13374
 
5
 
 
6
#Coding GC 53.66%
 
7
#1st letter GC 56.64%
 
8
#2nd letter GC 41.89%
 
9
#3rd letter GC 62.46%
 
10
 
 
11
#Codon AA Fraction Frequency Number
 
12
GCA    A     0.200    14.300  74440
 
13
GCC    A     0.430    30.500 158586
 
14
GCG    A     0.120     8.600  44761
 
15
GCT    A     0.250    17.900  92920
 
16
TGC    C     0.570    12.600  65350
 
17
TGT    C     0.430     9.300  48369
 
18
GAC    D     0.580    28.200 146380
 
19
GAT    D     0.420    20.500 106745
 
20
GAA    E     0.390    26.900 139964
 
21
GAG    E     0.610    41.900 217903
 
22
TTC    F     0.580    22.300 116108
 
23
TTT    F     0.420    16.400  85145
 
24
GGA    G     0.240    16.200  83963
 
25
GGC    G     0.360    24.400 126773
 
26
GGG    G     0.250    16.800  87308
 
27
GGT    G     0.160    10.800  56394
 
28
CAC    H     0.620    15.500  80580
 
29
CAT    H     0.380     9.400  48768
 
30
ATA    I     0.150     6.700  34695
 
31
ATC    I     0.520    23.300 121241
 
32
ATT    I     0.330    14.600  75856
 
33
AAA    K     0.390    22.400 116304
 
34
AAG    K     0.610    34.700 180338
 
35
CTA    L     0.060     6.100  31457
 
36
CTC    L     0.210    21.200 110054
 
37
CTG    L     0.430    43.500 226210
 
38
CTT    L     0.120    11.900  61653
 
39
TTA    L     0.060     6.300  32964
 
40
TTG    L     0.120    12.000  62515
 
41
ATG    M     1.000    22.500 116815
 
42
AAC    N     0.590    21.400 111149
 
43
AAT    N     0.410    14.700  76406
 
44
CCA    P     0.250    14.600  76133
 
45
CCC    P     0.350    20.400 105858
 
46
CCG    P     0.130     7.800  40554
 
47
CCT    P     0.270    15.800  82198
 
48
CAA    Q     0.230    10.500  54501
 
49
CAG    Q     0.770    35.000 182079
 
50
AGA    R     0.190    10.700  55827
 
51
AGG    R     0.200    11.400  59080
 
52
CGA    R     0.110     6.400  33382
 
53
CGC    R     0.200    11.100  57520
 
54
CGG    R     0.220    12.500  64928
 
55
CGT    R     0.080     4.600  24131
 
56
AGC    S     0.260    19.300 100361
 
57
AGT    S     0.150    11.000  57061
 
58
TCA    S     0.130     9.900  51566
 
59
TCC    S     0.230    17.300  89928
 
60
TCG    S     0.070     5.000  25856
 
61
TCT    S     0.170    13.100  68245
 
62
ACA    T     0.250    13.000  67675
 
63
ACC    T     0.390    20.100 104248
 
64
ACG    T     0.140     7.200  37451
 
65
ACT    T     0.220    11.500  59690
 
66
GTA    V     0.100     6.300  32751
 
67
GTC    V     0.250    15.900  82596
 
68
GTG    V     0.490    30.800 160334
 
69
GTT    V     0.160    10.100  52375
 
70
TGG    W     1.000    13.500  70151
 
71
TAC    Y     0.600    17.500  90785
 
72
TAT    Y     0.400    11.400  59332
 
73
TAA    *     0.260     0.700   3625
 
74
TAG    *     0.240     0.600   3255
 
75
TGA    *     0.500     1.300   6868