← Back to branch summary

~ubuntu-branches/debian/jessie/ugene/jessie

« back to all changes in this revision

Viewing changes to data/back_translation/Vertebrates/Takifugu_rubripes_(Fugu_rubripes).cut

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Steffen Moeller
  • Date: 2011-11-02 13:29:07 UTC
  • mfrom: (1.2.1) (3.1.11 natty)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20111102132907-o34gwnt0uj5g6hen
Tags: 1.9.8+repack-1
* First release to Debian
  - added README.Debian
  - increased policy version to 3.9.2
  - added URLs for version control system
* Added debug package.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
data/back_translation/Vertebrates/Takifugu_rubripes_(Fugu_rubripes).cut
 
1
#Species: Takifugu rubripes
 
2
#Division: gbvrt
 
3
#Release: CUTG160
 
4
#CdsCount: 1119
 
5
 
 
6
#Coding GC 53.53%
 
7
#1st letter GC 54.07%
 
8
#2nd letter GC 41.50%
 
9
#3rd letter GC 65.02%
 
10
 
 
11
#Codon AA Fraction Frequency Number
 
12
GCA    A     0.190    12.900   7065
 
13
GCC    A     0.400    27.400  15027
 
14
GCG    A     0.160    10.700   5905
 
15
GCT    A     0.250    17.400   9563
 
16
TGC    C     0.590    12.800   7027
 
17
TGT    C     0.410     8.800   4842
 
18
GAC    D     0.650    33.000  18134
 
19
GAT    D     0.350    17.800   9789
 
20
GAA    E     0.310    18.700  10270
 
21
GAG    E     0.690    41.700  22889
 
22
TTC    F     0.590    23.600  12969
 
23
TTT    F     0.410    16.200   8889
 
24
GGA    G     0.290    17.900   9834
 
25
GGC    G     0.320    20.000  10974
 
26
GGG    G     0.210    13.100   7210
 
27
GGT    G     0.180    11.200   6156
 
28
CAC    H     0.700    17.800   9794
 
29
CAT    H     0.300     7.500   4102
 
30
ATA    I     0.140     7.100   3892
 
31
ATC    I     0.590    29.100  15963
 
32
ATT    I     0.270    13.100   7188
 
33
AAA    K     0.430    23.200  12732
 
34
AAG    K     0.570    30.100  16546
 
35
CTA    L     0.050     4.600   2503
 
36
CTC    L     0.220    21.100  11595
 
37
CTG    L     0.460    44.700  24580
 
38
CTT    L     0.100     9.200   5076
 
39
TTA    L     0.060     5.800   3178
 
40
TTG    L     0.110    11.100   6095
 
41
ATG    M     1.000    24.400  13415
 
42
AAC    N     0.690    28.700  15784
 
43
AAT    N     0.310    13.200   7247
 
44
CCA    P     0.230    12.700   6952
 
45
CCC    P     0.330    17.900   9833
 
46
CCG    P     0.190    10.200   5594
 
47
CCT    P     0.250    13.300   7280
 
48
CAA    Q     0.210     9.200   5072
 
49
CAG    Q     0.790    34.900  19181
 
50
AGA    R     0.220    11.500   6324
 
51
AGG    R     0.250    13.500   7412
 
52
CGA    R     0.090     4.900   2719
 
53
CGC    R     0.190    10.300   5661
 
54
CGG    R     0.140     7.700   4212
 
55
CGT    R     0.100     5.100   2814
 
56
AGC    S     0.250    22.100  12136
 
57
AGT    S     0.120    10.300   5670
 
58
TCA    S     0.120    10.600   5837
 
59
TCC    S     0.250    21.500  11822
 
60
TCG    S     0.090     7.700   4250
 
61
TCT    S     0.170    14.600   8018
 
62
ACA    T     0.230    12.700   6980
 
63
ACC    T     0.380    21.500  11789
 
64
ACG    T     0.190    10.700   5883
 
65
ACT    T     0.200    11.300   6209
 
66
GTA    V     0.080     5.300   2889
 
67
GTC    V     0.290    19.700  10807
 
68
GTG    V     0.450    30.600  16791
 
69
GTT    V     0.180    12.400   6809
 
70
TGG    W     1.000    11.700   6455
 
71
TAC    Y     0.670    20.500  11240
 
72
TAT    Y     0.330     9.900   5433
 
73
TAA    *     0.270     0.500    298
 
74
TAG    *     0.250     0.500    284
 
75
TGA    *     0.480     1.000    536