← Back to branch summary

~ubuntu-branches/debian/jessie/ugene/jessie

« back to all changes in this revision

Viewing changes to data/back_translation/Primates/mitochondrion_Homo_sapiens_(human).cut

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Steffen Moeller
  • Date: 2011-11-02 13:29:07 UTC
  • mfrom: (1.2.1) (3.1.11 natty)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20111102132907-o34gwnt0uj5g6hen
Tags: 1.9.8+repack-1
* First release to Debian
  - added README.Debian
  - increased policy version to 3.9.2
  - added URLs for version control system
* Added debug package.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
data/back_translation/Primates/mitochondrion_Homo_sapiens_(human).cut
 
1
#Species: mitochondrion Homo sapiens
 
2
#Division: gbpri
 
3
#Release: CUTG160
 
4
#CdsCount: 31745
 
5
 
 
6
#Coding GC 44.94%
 
7
#1st letter GC 48.11%
 
8
#2nd letter GC 39.34%
 
9
#3rd letter GC 47.36%
 
10
 
 
11
#Codon AA Fraction Frequency Number
 
12
GCA    A     0.340    23.800 213888
 
13
GCC    A     0.420    29.600 265992
 
14
GCG    A     0.050     3.200  28747
 
15
GCT    A     0.200    14.000 126194
 
16
TGC    C     0.730     4.600  40993
 
17
TGT    C     0.270     1.700  14902
 
18
GAC    D     0.760    14.000 126144
 
19
GAT    D     0.240     4.500  40601
 
20
GAA    E     0.680    16.500 148574
 
21
GAG    E     0.320     7.800  70450
 
22
TTC    F     0.680    37.200 335160
 
23
TTT    F     0.320    17.800 160010
 
24
GGA    G     0.330    19.500 175656
 
25
GGC    G     0.350    20.800 187077
 
26
GGG    G     0.160     9.600  86524
 
27
GGT    G     0.150     8.900  80137
 
28
CAC    H     0.820    18.000 162193
 
29
CAT    H     0.180     4.000  36385
 
30
ATC    I     0.600    51.400 462276
 
31
ATT    I     0.400    33.900 305172
 
32
AAA    K     0.890    23.600 212226
 
33
AAG    K     0.110     3.000  27327
 
34
CTA    L     0.430    70.000 629938
 
35
CTC    L     0.240    38.500 346787
 
36
CTG    L     0.080    13.100 117687
 
37
CTT    L     0.100    16.900 151990
 
38
TTA    L     0.110    17.300 155896
 
39
TTG    L     0.040     6.000  54021
 
40
ATA    M     0.780    44.100 396504
 
41
ATG    M     0.220    12.300 110272
 
42
AAC    N     0.760    34.100 306667
 
43
AAT    N     0.240    10.600  94957
 
44
CCA    P     0.200    11.800 106159
 
45
CCC    P     0.570    33.400 300806
 
46
CCG    P     0.030     1.800  15943
 
47
CCT    P     0.190    11.300 101844
 
48
CAA    Q     0.880    20.500 184525
 
49
CAG    Q     0.120     2.700  24303
 
50
CGA    R     0.410     6.500  58761
 
51
CGC    R     0.360     5.700  51396
 
52
CGG    R     0.050     0.800   7434
 
53
CGT    R     0.180     2.800  24955
 
54
AGC    S     0.140     9.700  87297
 
55
AGT    S     0.050     3.500  31921
 
56
TCA    S     0.280    19.200 172800
 
57
TCC    S     0.340    22.900 206172
 
58
TCG    S     0.040     2.400  21393
 
59
TCT    S     0.140     9.700  87185
 
60
ACA    T     0.360    32.700 294191
 
61
ACC    T     0.450    41.500 373157
 
62
ACG    T     0.030     2.600  23147
 
63
ACT    T     0.160    14.600 131679
 
64
GTA    V     0.380    19.500 175775
 
65
GTC    V     0.280    14.100 127303
 
66
GTG    V     0.130     6.600  59489
 
67
GTT    V     0.210    10.700  95854
 
68
TGA    W     0.900    21.600 194470
 
69
TGG    W     0.100     2.400  21651
 
70
TAC    Y     0.630    22.200 200068
 
71
TAT    Y     0.370    12.900 116277
 
72
AGA    *     0.120     0.400   3646
 
73
AGG    *     0.120     0.400   3719
 
74
TAA    *     0.440     1.600  14080
 
75
TAG    *     0.320     1.100  10251