← Back to branch summary

~ubuntu-branches/debian/jessie/ugene/jessie

« back to all changes in this revision

Viewing changes to data/back_translation/Rodents/Rattus_norvegicus_(Norway_rat).cut

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Steffen Moeller
  • Date: 2011-11-02 13:29:07 UTC
  • mfrom: (1.2.1) (3.1.11 natty)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20111102132907-o34gwnt0uj5g6hen
Tags: 1.9.8+repack-1
* First release to Debian
  - added README.Debian
  - increased policy version to 3.9.2
  - added URLs for version control system
* Added debug package.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
data/back_translation/Rodents/Rattus_norvegicus_(Norway_rat).cut
 
1
#Species: Rattus norvegicus
 
2
#Division: gbrod
 
3
#Release: CUTG160
 
4
#CdsCount: 15151
 
5
 
 
6
#Coding GC 52.59%
 
7
#1st letter GC 55.66%
 
8
#2nd letter GC 41.70%
 
9
#3rd letter GC 60.40%
 
10
 
 
11
#Codon AA Fraction Frequency Number
 
12
GCA    A     0.230    15.600 109203
 
13
GCC    A     0.390    27.100 189524
 
14
GCG    A     0.100     6.900  47869
 
15
GCT    A     0.280    19.700 137491
 
16
TGC    C     0.550    11.900  82751
 
17
TGT    C     0.450     9.800  68418
 
18
GAC    D     0.570    28.000 195508
 
19
GAT    D     0.430    20.900 146211
 
20
GAA    E     0.390    26.900 187810
 
21
GAG    E     0.610    41.300 288345
 
22
TTC    F     0.580    23.100 161568
 
23
TTT    F     0.420    16.500 115498
 
24
GGA    G     0.250    16.600 115968
 
25
GGC    G     0.330    21.900 152582
 
26
GGG    G     0.240    15.600 108657
 
27
GGT    G     0.170    11.400  79443
 
28
CAC    H     0.610    14.900 104027
 
29
CAT    H     0.390     9.500  66664
 
30
ATA    I     0.150     6.900  48257
 
31
ATC    I     0.520    24.400 170096
 
32
ATT    I     0.330    15.300 106736
 
33
AAA    K     0.380    21.500 150018
 
34
AAG    K     0.620    35.100 245259
 
35
CTA    L     0.080     7.600  52955
 
36
CTC    L     0.200    20.400 142093
 
37
CTG    L     0.410    41.100 286626
 
38
CTT    L     0.120    12.500  87332
 
39
TTA    L     0.060     5.900  41454
 
40
TTG    L     0.130    12.800  89203
 
41
ATG    M     1.000    23.100 161552
 
42
AAC    N     0.590    21.700 151564
 
43
AAT    N     0.410    15.100 105212
 
44
CCA    P     0.280    16.100 112364
 
45
CCC    P     0.310    18.000 125645
 
46
CCG    P     0.110     6.300  43713
 
47
CCT    P     0.300    17.400 121358
 
48
CAA    Q     0.250    11.100  77366
 
49
CAG    Q     0.750    33.800 235764
 
50
AGA    R     0.200    11.200  77965
 
51
AGG    R     0.210    11.800  82391
 
52
CGA    R     0.120     6.800  47207
 
53
CGC    R     0.180     9.800  68486
 
54
CGG    R     0.200    10.900  76123
 
55
CGT    R     0.090     5.000  34788
 
56
AGC    S     0.240    19.200 133954
 
57
AGT    S     0.150    11.800  82659
 
58
TCA    S     0.140    10.900  76435
 
59
TCC    S     0.230    17.800 124290
 
60
TCG    S     0.060     4.400  30458
 
61
TCT    S     0.190    14.800 103148
 
62
ACA    T     0.280    15.300 106544
 
63
ACC    T     0.360    19.700 137673
 
64
ACG    T     0.110     6.200  43237
 
65
ACT    T     0.240    12.900  90372
 
66
GTA    V     0.110     7.200  50048
 
67
GTC    V     0.250    16.200 113143
 
68
GTG    V     0.470    30.000 209458
 
69
GTT    V     0.160    10.400  72270
 
70
TGG    W     1.000    13.200  91958
 
71
TAC    Y     0.600    17.100 119192
 
72
TAT    Y     0.400    11.600  80999
 
73
TAA    *     0.280     0.600   4473
 
74
TAG    *     0.220     0.500   3637
 
75
TGA    *     0.500     1.200   8137