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  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Steffen Moeller
  • Date: 2011-11-02 13:29:07 UTC
  • mfrom: (1.2.1) (3.1.11 natty)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20111102132907-o34gwnt0uj5g6hen
Tags: 1.9.8+repack-1
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src/plugins/genome_aligner/transl/english.ts
 
1
<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
 
2
<!DOCTYPE TS>
 
3
<TS version="2.0">
 
4
<context>
 
5
    <name>BuildSuffixArraySettings</name>
 
6
    <message>
 
7
        <location filename="../src/ui/BuildSuffixArraySettings.ui" line="23"/>
 
8
        <source>Parameters</source>
 
9
        <translation type="unfinished"></translation>
 
10
    </message>
 
11
    <message>
 
12
        <location filename="../src/ui/BuildSuffixArraySettings.ui" line="20"/>
 
13
        <source>Set the paramaters of the selected align short reads algorithm.</source>
 
14
        <translation type="unfinished"></translation>
 
15
    </message>
 
16
    <message>
 
17
        <location filename="../src/ui/BuildSuffixArraySettings.ui" line="37"/>
 
18
        <source>Optimize the index created for reads with length (greater than or) equal to the specified value.  Note, that &lt;b&gt;during short reads aligning a read must be greater than or equal to this value&lt;/b&gt;.</source>
 
19
        <translation type="unfinished"></translation>
 
20
    </message>
 
21
    <message>
 
22
        <location filename="../src/ui/BuildSuffixArraySettings.ui" line="40"/>
 
23
        <source>Optimize for read length </source>
 
24
        <translation type="unfinished"></translation>
 
25
    </message>
 
26
    <message>
 
27
        <location filename="../src/ui/BuildSuffixArraySettings.ui" line="75"/>
 
28
        <source>Chech this box if mismatches between the reference sequence and the reads are allowed.</source>
 
29
        <translation type="unfinished"></translation>
 
30
    </message>
 
31
    <message>
 
32
        <location filename="../src/ui/BuildSuffixArraySettings.ui" line="78"/>
 
33
        <source>Mismatches allowed</source>
 
34
        <translation type="unfinished"></translation>
 
35
    </message>
 
36
    <message>
 
37
        <location filename="../src/ui/BuildSuffixArraySettings.ui" line="92"/>
 
38
        <location filename="../src/ui/BuildSuffixArraySettings.ui" line="105"/>
 
39
        <source>Select the number of mismatched nucleotides allowed.</source>
 
40
        <translation type="unfinished"></translation>
 
41
    </message>
 
42
    <message>
 
43
        <location filename="../src/ui/BuildSuffixArraySettings.ui" line="95"/>
 
44
        <source>Mismatches number</source>
 
45
        <translation type="unfinished"></translation>
 
46
    </message>
 
47
    <message>
 
48
        <location filename="../src/ui/BuildSuffixArraySettings.ui" line="118"/>
 
49
        <location filename="../src/ui/BuildSuffixArraySettings.ui" line="131"/>
 
50
        <source>Select the percentage of mismatches allowed. Note, that absolute number of mismatches can vary for different reads.</source>
 
51
        <translation type="unfinished"></translation>
 
52
    </message>
 
53
    <message>
 
54
        <location filename="../src/ui/BuildSuffixArraySettings.ui" line="121"/>
 
55
        <source>Percentage of mismatches</source>
 
56
        <translation type="unfinished"></translation>
 
57
    </message>
 
58
</context>
 
59
<context>
 
60
    <name>U2::GenomeAlignerPlugin</name>
 
61
    <message>
 
62
        <location filename="../src/GenomeAlignerPlugin.cpp" line="30"/>
 
63
        <source>UGENE genome aligner</source>
 
64
        <translation type="unfinished"></translation>
 
65
    </message>
 
66
    <message>
 
67
        <location filename="../src/GenomeAlignerPlugin.cpp" line="30"/>
 
68
        <source>Assembly DNA to reference sequence</source>
 
69
        <translation type="unfinished"></translation>
 
70
    </message>
 
71
</context>
 
72
<context>
 
73
    <name>U2::GenomeAlignerSettingsWidget</name>
 
74
    <message>
 
75
        <location filename="../src/GenomeAlignerSettingsWidget.cpp" line="61"/>
 
76
        <source>Set index file name</source>
 
77
        <translation type="unfinished"></translation>
 
78
    </message>
 
79
    <message>
 
80
        <location filename="../src/GenomeAlignerSettingsWidget.cpp" line="75"/>
 
81
        <source>Open index file</source>
 
82
        <translation type="unfinished"></translation>
 
83
    </message>
 
84
</context>
 
85
<context>
 
86
    <name>U2::GenomeAlignerTask</name>
 
87
    <message>
 
88
        <location filename="../src/GenomeAlignerTask.cpp" line="21"/>
 
89
        <source>UGENE genome aligner</source>
 
90
        <translation type="unfinished"></translation>
 
91
    </message>
 
92
    <message>
 
93
        <location filename="../src/GenomeAlignerTask.cpp" line="54"/>
 
94
        <source>Can not init short reads loader. %1</source>
 
95
        <translation type="unfinished"></translation>
 
96
    </message>
 
97
</context>
 
98
<context>
 
99
    <name>U2::LocalWorkflow::GenomeAlignerPrompter</name>
 
100
    <message>
 
101
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="89"/>
 
102
        <source> from &lt;u&gt;%1&lt;/u&gt;</source>
 
103
        <translation type="unfinished"></translation>
 
104
    </message>
 
105
    <message>
 
106
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="93"/>
 
107
        <source>Align short reads %1 to the reference genome %2 and send it to output.</source>
 
108
        <translation type="unfinished"></translation>
 
109
    </message>
 
110
</context>
 
111
<context>
 
112
    <name>U2::LocalWorkflow::GenomeAlignerWorker</name>
 
113
    <message>
 
114
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="32"/>
 
115
        <source>Short read sequences</source>
 
116
        <translation type="unfinished"></translation>
 
117
    </message>
 
118
    <message>
 
119
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="32"/>
 
120
        <source>Short reads to be aligned.</source>
 
121
        <translation type="unfinished"></translation>
 
122
    </message>
 
123
    <message>
 
124
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="33"/>
 
125
        <source>Short reads alignment</source>
 
126
        <translation type="unfinished"></translation>
 
127
    </message>
 
128
    <message>
 
129
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="33"/>
 
130
        <source>Result of alignment.</source>
 
131
        <translation type="unfinished"></translation>
 
132
    </message>
 
133
    <message>
 
134
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="36"/>
 
135
        <source>Reference</source>
 
136
        <translation type="unfinished"></translation>
 
137
    </message>
 
138
    <message>
 
139
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="37"/>
 
140
        <source>Reference sequence url. The short reads will be aligned to this genome.</source>
 
141
        <translation type="unfinished"></translation>
 
142
    </message>
 
143
    <message>
 
144
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="38"/>
 
145
        <source>Absolute of percentage mismatches&apos; values</source>
 
146
        <translation type="unfinished"></translation>
 
147
    </message>
 
148
    <message>
 
149
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="39"/>
 
150
        <source>Choose absolute of percentage mismatches&apos; values</source>
 
151
        <translation type="unfinished"></translation>
 
152
    </message>
 
153
    <message>
 
154
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="40"/>
 
155
        <source>Mismatches</source>
 
156
        <translation type="unfinished"></translation>
 
157
    </message>
 
158
    <message>
 
159
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="41"/>
 
160
        <source>Number of mismatches allowed while aligning reads.</source>
 
161
        <translation type="unfinished"></translation>
 
162
    </message>
 
163
    <message>
 
164
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="42"/>
 
165
        <source>Mismatches percentage</source>
 
166
        <translation type="unfinished"></translation>
 
167
    </message>
 
168
    <message>
 
169
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="43"/>
 
170
        <source>Percentage of mismatches allowed while aligning reads.</source>
 
171
        <translation type="unfinished"></translation>
 
172
    </message>
 
173
    <message>
 
174
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="44"/>
 
175
        <source>Align reversed</source>
 
176
        <translation type="unfinished"></translation>
 
177
    </message>
 
178
    <message>
 
179
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="45"/>
 
180
        <source>Set this option to align both direct and reverse reads.</source>
 
181
        <translation type="unfinished"></translation>
 
182
    </message>
 
183
    <message>
 
184
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="46"/>
 
185
        <source>Add ref to result</source>
 
186
        <translation type="unfinished"></translation>
 
187
    </message>
 
188
    <message>
 
189
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="47"/>
 
190
        <source>Set TRUE if you wish to append reference sequence to result alignment</source>
 
191
        <translation type="unfinished"></translation>
 
192
    </message>
 
193
    <message>
 
194
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="48"/>
 
195
        <source>Prebuilt index</source>
 
196
        <translation type="unfinished"></translation>
 
197
    </message>
 
198
    <message>
 
199
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="49"/>
 
200
        <source>Set TRUE if you wish to use prebuilt index for this reference</source>
 
201
        <translation type="unfinished"></translation>
 
202
    </message>
 
203
    <message>
 
204
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="50"/>
 
205
        <source>Index file</source>
 
206
        <translation type="unfinished"></translation>
 
207
    </message>
 
208
    <message>
 
209
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="51"/>
 
210
        <source>Path to the index file</source>
 
211
        <translation type="unfinished"></translation>
 
212
    </message>
 
213
    <message>
 
214
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="62"/>
 
215
        <source>UGENE genome aligner</source>
 
216
        <translation type="unfinished"></translation>
 
217
    </message>
 
218
    <message>
 
219
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="63"/>
 
220
        <source>Unique UGENE algorithm for aligning short reads to reference genome</source>
 
221
        <translation type="unfinished"></translation>
 
222
    </message>
 
223
    <message>
 
224
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="119"/>
 
225
        <source>Short reads list is empty.</source>
 
226
        <translation type="unfinished"></translation>
 
227
    </message>
 
228
    <message>
 
229
        <location filename="../src/GenomeAlignerWorker.cpp" line="157"/>
 
230
        <source>Genome aligner finished. Result name is %1</source>
 
231
        <translation type="unfinished"></translation>
 
232
    </message>
 
233
</context>
 
234
<context>
 
235
    <name>GenomeAlignerSettings</name>
 
236
    <message>
 
237
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="14"/>
 
238
        <source>Form</source>
 
239
        <translation type="unfinished"></translation>
 
240
    </message>
 
241
    <message>
 
242
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="20"/>
 
243
        <source>Set the paramaters of the selected align short reads algorithm.</source>
 
244
        <translation type="unfinished"></translation>
 
245
    </message>
 
246
    <message>
 
247
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="23"/>
 
248
        <source>Parameters</source>
 
249
        <translation type="unfinished"></translation>
 
250
    </message>
 
251
    <message>
 
252
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="31"/>
 
253
        <source>Chech this box if mismatches between the reference sequence and the reads are allowed.</source>
 
254
        <translation type="unfinished"></translation>
 
255
    </message>
 
256
    <message>
 
257
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="34"/>
 
258
        <source>Mismatches allowed</source>
 
259
        <translation type="unfinished"></translation>
 
260
    </message>
 
261
    <message>
 
262
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="48"/>
 
263
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="74"/>
 
264
        <source>Select the number of mismatched nucleotides allowed.</source>
 
265
        <translation type="unfinished"></translation>
 
266
    </message>
 
267
    <message>
 
268
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="87"/>
 
269
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="113"/>
 
270
        <source>Select the percentage of mismatches allowed. Note, that absolute number of mismatches can vary for different reads.</source>
 
271
        <translation type="unfinished"></translation>
 
272
    </message>
 
273
    <message>
 
274
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="51"/>
 
275
        <source>Mismatches number</source>
 
276
        <translation type="unfinished"></translation>
 
277
    </message>
 
278
    <message>
 
279
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="90"/>
 
280
        <source>Percentage of mismatches</source>
 
281
        <translation type="unfinished"></translation>
 
282
    </message>
 
283
    <message>
 
284
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="131"/>
 
285
        <source>Set short reads aligning options.</source>
 
286
        <translation type="unfinished"></translation>
 
287
    </message>
 
288
    <message>
 
289
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="142"/>
 
290
        <source>Use both the read and its reverse complement during aligning.</source>
 
291
        <translation type="unfinished"></translation>
 
292
    </message>
 
293
    <message>
 
294
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="145"/>
 
295
        <source>Align reverse complement reads</source>
 
296
        <translation type="unfinished"></translation>
 
297
    </message>
 
298
    <message>
 
299
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="155"/>
 
300
        <source>Search only for the first occurence of each read in the reference sequence.</source>
 
301
        <translation type="unfinished"></translation>
 
302
    </message>
 
303
    <message>
 
304
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="165"/>
 
305
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="191"/>
 
306
        <source>Omit reads with qualities lower than the specified value. Reads that have no qualities are not omited.</source>
 
307
        <translation type="unfinished"></translation>
 
308
    </message>
 
309
    <message>
 
310
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="215"/>
 
311
        <source>Use an appropriate index to optimize a short reads aligning algorithm.</source>
 
312
        <translation type="unfinished"></translation>
 
313
    </message>
 
314
    <message>
 
315
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="218"/>
 
316
        <source>Index </source>
 
317
        <translation type="unfinished"></translation>
 
318
    </message>
 
319
    <message>
 
320
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="226"/>
 
321
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="239"/>
 
322
        <source>Specify an index to build during execution of the selected short reads aligning algorithm. If this option is selected, the value is &lt;b&gt;required&lt;/b&gt;.</source>
 
323
        <translation type="unfinished"></translation>
 
324
    </message>
 
325
    <message>
 
326
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="229"/>
 
327
        <source>Save index to</source>
 
328
        <translation type="unfinished"></translation>
 
329
    </message>
 
330
    <message>
 
331
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="249"/>
 
332
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="276"/>
 
333
        <source>...</source>
 
334
        <translation type="unfinished"></translation>
 
335
    </message>
 
336
    <message>
 
337
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="256"/>
 
338
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="266"/>
 
339
        <source>Use an appropriate prebuilt index to optimize the selected short reads aligning algorithm. If this option is selected, the value is &lt;b&gt;required&lt;/b&gt;.</source>
 
340
        <translation type="unfinished"></translation>
 
341
    </message>
 
342
    <message>
 
343
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="259"/>
 
344
        <source>Use prebuit index from</source>
 
345
        <translation type="unfinished"></translation>
 
346
    </message>
 
347
    <message>
 
348
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="134"/>
 
349
        <source>Align options</source>
 
350
        <translation type="unfinished"></translation>
 
351
    </message>
 
352
    <message>
 
353
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="158"/>
 
354
        <source>Stop searching on the first successful match</source>
 
355
        <translation type="unfinished"></translation>
 
356
    </message>
 
357
    <message>
 
358
        <location filename="../src/ui/GenomeAlignerSettings.ui" line="168"/>
 
359
        <source>Omit reads with qualities lower than</source>
 
360
        <translation type="unfinished"></translation>
 
361
    </message>
 
362
</context>
 
363
</TS>