~ubuntu-branches/ubuntu/maverick/commons-math/maverick

« back to all changes in this revision

Viewing changes to src/test/java/org/apache/commons/math/ode/nonstiff/HighamHall54IntegratorTest.java

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Damien Raude-Morvan
  • Date: 2009-08-22 01:13:25 UTC
  • mfrom: (1.1.1 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090822011325-hi4peq1ua5weguwn
Tags: 2.0-1
* New upstream release.
* Set Maintainer field to Debian Java Team
* Add myself as Uploaders
* Switch to Quilt patch system:
  - Refresh all patchs
  - Remove B-D on dpatch, Add B-D on quilt
  - Include patchsys-quilt.mk in debian/rules
* Bump Standards-Version to 3.8.3:
  - Add a README.source to describe patch system
* Maven POMs:
  - Add a Build-Depends-Indep dependency on maven-repo-helper
  - Use mh_installpom and mh_installjar to install the POM and the jar to the
    Maven repository
* Use default-jdk/jre:
  - Depends on java5-runtime-headless
  - Build-Depends on default-jdk
  - Use /usr/lib/jvm/default-java as JAVA_HOME
* Move api documentation to /usr/share/doc/libcommons-math-java/api
* Build-Depends on junit4 instead of junit

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
/*
 
2
 * Licensed to the Apache Software Foundation (ASF) under one or more
 
3
 * contributor license agreements.  See the NOTICE file distributed with
 
4
 * this work for additional information regarding copyright ownership.
 
5
 * The ASF licenses this file to You under the Apache License, Version 2.0
 
6
 * (the "License"); you may not use this file except in compliance with
 
7
 * the License.  You may obtain a copy of the License at
 
8
 *
 
9
 *      http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
 
10
 *
 
11
 * Unless required by applicable law or agreed to in writing, software
 
12
 * distributed under the License is distributed on an "AS IS" BASIS,
 
13
 * WITHOUT WARRANTIES OR CONDITIONS OF ANY KIND, either express or implied.
 
14
 * See the License for the specific language governing permissions and
 
15
 * limitations under the License.
 
16
 */
 
17
 
 
18
package org.apache.commons.math.ode.nonstiff;
 
19
 
 
20
import junit.framework.Test;
 
21
import junit.framework.TestCase;
 
22
import junit.framework.TestSuite;
 
23
 
 
24
import org.apache.commons.math.ConvergenceException;
 
25
import org.apache.commons.math.ode.DerivativeException;
 
26
import org.apache.commons.math.ode.FirstOrderDifferentialEquations;
 
27
import org.apache.commons.math.ode.FirstOrderIntegrator;
 
28
import org.apache.commons.math.ode.IntegratorException;
 
29
import org.apache.commons.math.ode.TestProblem1;
 
30
import org.apache.commons.math.ode.TestProblem3;
 
31
import org.apache.commons.math.ode.TestProblem4;
 
32
import org.apache.commons.math.ode.TestProblem5;
 
33
import org.apache.commons.math.ode.TestProblemHandler;
 
34
import org.apache.commons.math.ode.events.EventException;
 
35
import org.apache.commons.math.ode.events.EventHandler;
 
36
import org.apache.commons.math.ode.nonstiff.HighamHall54Integrator;
 
37
import org.apache.commons.math.ode.sampling.StepHandler;
 
38
import org.apache.commons.math.ode.sampling.StepInterpolator;
 
39
 
 
40
public class HighamHall54IntegratorTest
 
41
  extends TestCase {
 
42
 
 
43
  public HighamHall54IntegratorTest(String name) {
 
44
    super(name);
 
45
  }
 
46
 
 
47
  public void testWrongDerivative() {
 
48
    try {
 
49
      HighamHall54Integrator integrator =
 
50
          new HighamHall54Integrator(0.0, 1.0, 1.0e-10, 1.0e-10);
 
51
      FirstOrderDifferentialEquations equations =
 
52
          new FirstOrderDifferentialEquations() {
 
53
            private static final long serialVersionUID = -1157081786301178032L;
 
54
            public void computeDerivatives(double t, double[] y, double[] dot)
 
55
            throws DerivativeException {
 
56
            if (t < -0.5) {
 
57
                throw new DerivativeException("{0}", "oops");
 
58
            } else {
 
59
                throw new DerivativeException(new RuntimeException("oops"));
 
60
           }
 
61
          }
 
62
          public int getDimension() {
 
63
              return 1;
 
64
          }
 
65
      };
 
66
 
 
67
      try  {
 
68
        integrator.integrate(equations, -1.0, new double[1], 0.0, new double[1]);
 
69
        fail("an exception should have been thrown");
 
70
      } catch(DerivativeException de) {
 
71
        // expected behavior
 
72
      }
 
73
 
 
74
      try  {
 
75
        integrator.integrate(equations, 0.0, new double[1], 1.0, new double[1]);
 
76
        fail("an exception should have been thrown");
 
77
      } catch(DerivativeException de) {
 
78
        // expected behavior
 
79
      }
 
80
 
 
81
    } catch (Exception e) {
 
82
      fail("wrong exception caught: " + e.getMessage());        
 
83
    }
 
84
  }
 
85
 
 
86
  public void testMinStep() {
 
87
 
 
88
    try {
 
89
      TestProblem1 pb = new TestProblem1();
 
90
      double minStep = 0.1 * (pb.getFinalTime() - pb.getInitialTime());
 
91
      double maxStep = pb.getFinalTime() - pb.getInitialTime();
 
92
      double[] vecAbsoluteTolerance = { 1.0e-15, 1.0e-16 };
 
93
      double[] vecRelativeTolerance = { 1.0e-15, 1.0e-16 };
 
94
 
 
95
      FirstOrderIntegrator integ = new HighamHall54Integrator(minStep, maxStep,
 
96
                                                              vecAbsoluteTolerance,
 
97
                                                              vecRelativeTolerance);
 
98
      TestProblemHandler handler = new TestProblemHandler(pb, integ);
 
99
      integ.addStepHandler(handler);
 
100
      integ.integrate(pb,
 
101
                      pb.getInitialTime(), pb.getInitialState(),
 
102
                      pb.getFinalTime(), new double[pb.getDimension()]);
 
103
      fail("an exception should have been thrown");
 
104
    } catch(DerivativeException de) {
 
105
      fail("wrong exception caught");
 
106
    } catch(IntegratorException ie) {
 
107
    }
 
108
 
 
109
  }
 
110
 
 
111
  public void testIncreasingTolerance()
 
112
    throws DerivativeException, IntegratorException {
 
113
 
 
114
    int previousCalls = Integer.MAX_VALUE;
 
115
    for (int i = -12; i < -2; ++i) {
 
116
      TestProblem1 pb = new TestProblem1();
 
117
      double minStep = 0;
 
118
      double maxStep = pb.getFinalTime() - pb.getInitialTime();
 
119
      double scalAbsoluteTolerance = Math.pow(10.0, i);
 
120
      double scalRelativeTolerance = 0.01 * scalAbsoluteTolerance;
 
121
 
 
122
      FirstOrderIntegrator integ = new HighamHall54Integrator(minStep, maxStep,
 
123
                                                              scalAbsoluteTolerance,
 
124
                                                              scalRelativeTolerance);
 
125
      TestProblemHandler handler = new TestProblemHandler(pb, integ);
 
126
      integ.addStepHandler(handler);
 
127
      integ.integrate(pb,
 
128
                      pb.getInitialTime(), pb.getInitialState(),
 
129
                      pb.getFinalTime(), new double[pb.getDimension()]);
 
130
 
 
131
      // the 1.3 factor is only valid for this test
 
132
      // and has been obtained from trial and error
 
133
      // there is no general relation between local and global errors
 
134
      assertTrue(handler.getMaximalValueError() < (1.3 * scalAbsoluteTolerance));
 
135
      assertEquals(0, handler.getMaximalTimeError(), 1.0e-12);
 
136
 
 
137
      int calls = pb.getCalls();
 
138
      assertEquals(integ.getEvaluations(), calls);
 
139
      assertTrue(calls <= previousCalls);
 
140
      previousCalls = calls;
 
141
 
 
142
    }
 
143
 
 
144
  }
 
145
 
 
146
  public void testBackward()
 
147
      throws DerivativeException, IntegratorException {
 
148
 
 
149
      TestProblem5 pb = new TestProblem5();
 
150
      double minStep = 0;
 
151
      double maxStep = pb.getFinalTime() - pb.getInitialTime();
 
152
      double scalAbsoluteTolerance = 1.0e-8;
 
153
      double scalRelativeTolerance = 0.01 * scalAbsoluteTolerance;
 
154
 
 
155
      FirstOrderIntegrator integ = new HighamHall54Integrator(minStep, maxStep,
 
156
                                                              scalAbsoluteTolerance,
 
157
                                                              scalRelativeTolerance);
 
158
      TestProblemHandler handler = new TestProblemHandler(pb, integ);
 
159
      integ.addStepHandler(handler);
 
160
      integ.integrate(pb, pb.getInitialTime(), pb.getInitialState(),
 
161
                      pb.getFinalTime(), new double[pb.getDimension()]);
 
162
 
 
163
      assertTrue(handler.getLastError() < 5.0e-7);
 
164
      assertTrue(handler.getMaximalValueError() < 5.0e-7);
 
165
      assertEquals(0, handler.getMaximalTimeError(), 1.0e-12);
 
166
      assertEquals("Higham-Hall 5(4)", integ.getName());
 
167
  }
 
168
 
 
169
  public void testEvents()
 
170
    throws DerivativeException, IntegratorException {
 
171
 
 
172
    TestProblem4 pb = new TestProblem4();
 
173
    double minStep = 0;
 
174
    double maxStep = pb.getFinalTime() - pb.getInitialTime();
 
175
    double scalAbsoluteTolerance = 1.0e-8;
 
176
    double scalRelativeTolerance = 0.01 * scalAbsoluteTolerance;
 
177
 
 
178
    FirstOrderIntegrator integ = new HighamHall54Integrator(minStep, maxStep,
 
179
                                                            scalAbsoluteTolerance,
 
180
                                                            scalRelativeTolerance);
 
181
    TestProblemHandler handler = new TestProblemHandler(pb, integ);
 
182
    integ.addStepHandler(handler);
 
183
    EventHandler[] functions = pb.getEventsHandlers();
 
184
    for (int l = 0; l < functions.length; ++l) {
 
185
      integ.addEventHandler(functions[l],
 
186
                                 Double.POSITIVE_INFINITY, 1.0e-8 * maxStep, 1000);
 
187
    }
 
188
    assertEquals(functions.length, integ.getEventHandlers().size());
 
189
    integ.integrate(pb,
 
190
                    pb.getInitialTime(), pb.getInitialState(),
 
191
                    pb.getFinalTime(), new double[pb.getDimension()]);
 
192
 
 
193
    assertTrue(handler.getMaximalValueError() < 1.0e-7);
 
194
    assertEquals(0, handler.getMaximalTimeError(), 1.0e-12);
 
195
    assertEquals(12.0, handler.getLastTime(), 1.0e-8 * maxStep);
 
196
    integ.clearEventHandlers();
 
197
    assertEquals(0, integ.getEventHandlers().size());
 
198
 
 
199
  }
 
200
 
 
201
  public void testEventsErrors() {
 
202
 
 
203
      final TestProblem1 pb = new TestProblem1();
 
204
      double minStep = 0;
 
205
      double maxStep = pb.getFinalTime() - pb.getInitialTime();
 
206
      double scalAbsoluteTolerance = 1.0e-8;
 
207
      double scalRelativeTolerance = 0.01 * scalAbsoluteTolerance;
 
208
 
 
209
      FirstOrderIntegrator integ =
 
210
          new HighamHall54Integrator(minStep, maxStep,
 
211
                                     scalAbsoluteTolerance, scalRelativeTolerance);
 
212
      TestProblemHandler handler = new TestProblemHandler(pb, integ);
 
213
      integ.addStepHandler(handler);
 
214
 
 
215
      integ.addEventHandler(new EventHandler() {
 
216
        public int eventOccurred(double t, double[] y, boolean increasing) {
 
217
          return EventHandler.CONTINUE;
 
218
        }
 
219
        public double g(double t, double[] y) throws EventException {
 
220
          double middle = (pb.getInitialTime() + pb.getFinalTime()) / 2;
 
221
          double offset = t - middle;
 
222
          if (offset > 0) {
 
223
            throw new EventException("Evaluation failed for argument = {0}", t);
 
224
          }
 
225
          return offset;
 
226
        }
 
227
        public void resetState(double t, double[] y) {
 
228
        }
 
229
        private static final long serialVersionUID = 935652725339916361L;
 
230
      }, Double.POSITIVE_INFINITY, 1.0e-8 * maxStep, 1000);
 
231
 
 
232
      try {
 
233
        integ.integrate(pb,
 
234
                        pb.getInitialTime(), pb.getInitialState(),
 
235
                        pb.getFinalTime(), new double[pb.getDimension()]);
 
236
        fail("an exception should have been thrown");
 
237
      } catch (IntegratorException ie) {
 
238
        // expected behavior
 
239
      } catch (Exception e) {
 
240
        fail("wrong exception type caught");
 
241
      }
 
242
 
 
243
  }
 
244
 
 
245
  public void testEventsNoConvergence() {
 
246
 
 
247
    final TestProblem1 pb = new TestProblem1();
 
248
    double minStep = 0;
 
249
    double maxStep = pb.getFinalTime() - pb.getInitialTime();
 
250
    double scalAbsoluteTolerance = 1.0e-8;
 
251
    double scalRelativeTolerance = 0.01 * scalAbsoluteTolerance;
 
252
 
 
253
    FirstOrderIntegrator integ =
 
254
        new HighamHall54Integrator(minStep, maxStep,
 
255
                                   scalAbsoluteTolerance, scalRelativeTolerance);
 
256
    TestProblemHandler handler = new TestProblemHandler(pb, integ);
 
257
    integ.addStepHandler(handler);
 
258
 
 
259
    integ.addEventHandler(new EventHandler() {
 
260
      public int eventOccurred(double t, double[] y, boolean increasing) {
 
261
        return EventHandler.CONTINUE;
 
262
      }
 
263
      public double g(double t, double[] y) {
 
264
        double middle = (pb.getInitialTime() + pb.getFinalTime()) / 2;
 
265
        double offset = t - middle;
 
266
        return (offset > 0) ? (offset + 0.5) : (offset - 0.5);
 
267
      }
 
268
      public void resetState(double t, double[] y) {
 
269
      }
 
270
      private static final long serialVersionUID = 935652725339916361L;
 
271
    }, Double.POSITIVE_INFINITY, 1.0e-8 * maxStep, 3);
 
272
 
 
273
    try {
 
274
      integ.integrate(pb,
 
275
                      pb.getInitialTime(), pb.getInitialState(),
 
276
                      pb.getFinalTime(), new double[pb.getDimension()]);
 
277
      fail("an exception should have been thrown");
 
278
    } catch (IntegratorException ie) {
 
279
       assertTrue(ie.getCause() != null);
 
280
       assertTrue(ie.getCause() instanceof ConvergenceException);
 
281
    } catch (Exception e) {
 
282
      fail("wrong exception type caught");
 
283
    }
 
284
 
 
285
}
 
286
 
 
287
  public void testSanityChecks() {
 
288
    try {
 
289
      final TestProblem3 pb  = new TestProblem3(0.9);
 
290
      double minStep = 0;
 
291
      double maxStep = pb.getFinalTime() - pb.getInitialTime();
 
292
 
 
293
      try {
 
294
        FirstOrderIntegrator integ =
 
295
            new HighamHall54Integrator(minStep, maxStep, new double[4], new double[4]);
 
296
        integ.integrate(pb, pb.getInitialTime(), new double[6],
 
297
                        pb.getFinalTime(), new double[pb.getDimension()]);
 
298
        fail("an exception should have been thrown");
 
299
      } catch (IntegratorException ie) {
 
300
        // expected behavior
 
301
      }
 
302
 
 
303
      try {
 
304
        FirstOrderIntegrator integ =
 
305
            new HighamHall54Integrator(minStep, maxStep, new double[4], new double[4]);
 
306
        integ.integrate(pb, pb.getInitialTime(), pb.getInitialState(),
 
307
                        pb.getFinalTime(), new double[6]);
 
308
        fail("an exception should have been thrown");
 
309
      } catch (IntegratorException ie) {
 
310
        // expected behavior
 
311
      }
 
312
 
 
313
      try {
 
314
        FirstOrderIntegrator integ =
 
315
            new HighamHall54Integrator(minStep, maxStep, new double[2], new double[4]);
 
316
        integ.integrate(pb, pb.getInitialTime(), pb.getInitialState(),
 
317
                        pb.getFinalTime(), new double[pb.getDimension()]);
 
318
        fail("an exception should have been thrown");
 
319
      } catch (IntegratorException ie) {
 
320
        // expected behavior
 
321
      }
 
322
 
 
323
      try {
 
324
        FirstOrderIntegrator integ =
 
325
            new HighamHall54Integrator(minStep, maxStep, new double[4], new double[2]);
 
326
        integ.integrate(pb, pb.getInitialTime(), pb.getInitialState(),
 
327
                        pb.getFinalTime(), new double[pb.getDimension()]);
 
328
        fail("an exception should have been thrown");
 
329
      } catch (IntegratorException ie) {
 
330
        // expected behavior
 
331
      }
 
332
 
 
333
      try {
 
334
        FirstOrderIntegrator integ =
 
335
            new HighamHall54Integrator(minStep, maxStep, new double[4], new double[4]);
 
336
        integ.integrate(pb, pb.getInitialTime(), pb.getInitialState(),
 
337
                        pb.getInitialTime(), new double[pb.getDimension()]);
 
338
        fail("an exception should have been thrown");
 
339
      } catch (IntegratorException ie) {
 
340
        // expected behavior
 
341
      }
 
342
 
 
343
    } catch (Exception e) {
 
344
      fail("wrong exception caught: " + e.getMessage());
 
345
    }
 
346
  }
 
347
 
 
348
  public void testKepler()
 
349
    throws DerivativeException, IntegratorException {
 
350
 
 
351
    final TestProblem3 pb  = new TestProblem3(0.9);
 
352
    double minStep = 0;
 
353
    double maxStep = pb.getFinalTime() - pb.getInitialTime();
 
354
    double[] vecAbsoluteTolerance = { 1.0e-8, 1.0e-8, 1.0e-10, 1.0e-10 };
 
355
    double[] vecRelativeTolerance = { 1.0e-10, 1.0e-10, 1.0e-8, 1.0e-8 };
 
356
 
 
357
    FirstOrderIntegrator integ = new HighamHall54Integrator(minStep, maxStep,
 
358
                                                            vecAbsoluteTolerance,
 
359
                                                            vecRelativeTolerance);
 
360
    integ.addStepHandler(new KeplerHandler(pb));
 
361
    integ.integrate(pb,
 
362
                    pb.getInitialTime(), pb.getInitialState(),
 
363
                    pb.getFinalTime(), new double[pb.getDimension()]);
 
364
    assertEquals("Higham-Hall 5(4)", integ.getName());
 
365
  }
 
366
 
 
367
  private static class KeplerHandler implements StepHandler {
 
368
    public KeplerHandler(TestProblem3 pb) {
 
369
      this.pb = pb;
 
370
      nbSteps = 0;
 
371
      maxError = 0;
 
372
    }
 
373
    public boolean requiresDenseOutput() {
 
374
      return false;
 
375
    }
 
376
    public void reset() {
 
377
      nbSteps = 0;
 
378
      maxError = 0;
 
379
    }
 
380
    public void handleStep(StepInterpolator interpolator,
 
381
                           boolean isLast) throws DerivativeException {
 
382
 
 
383
      ++nbSteps;
 
384
      double[] interpolatedY = interpolator.getInterpolatedState();
 
385
      double[] theoreticalY  = pb.computeTheoreticalState(interpolator.getCurrentTime());
 
386
      double dx = interpolatedY[0] - theoreticalY[0];
 
387
      double dy = interpolatedY[1] - theoreticalY[1];
 
388
      double error = dx * dx + dy * dy;
 
389
      if (error > maxError) {
 
390
        maxError = error;
 
391
      }
 
392
      if (isLast) {
 
393
        assertTrue(maxError < 4e-11);
 
394
        assertTrue(nbSteps < 670);
 
395
      }
 
396
    }
 
397
    private TestProblem3 pb;
 
398
    private int nbSteps;
 
399
    private double maxError;
 
400
  }
 
401
 
 
402
  public static Test suite() {
 
403
    return new TestSuite(HighamHall54IntegratorTest.class);
 
404
  }
 
405
 
 
406
}