← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/maverick/commons-math/maverick

« back to all changes in this revision

Viewing changes to src/test/java/org/apache/commons/math/stat/descriptive/moment/VectorialCovarianceTest.java

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Damien Raude-Morvan
  • Date: 2009-08-22 01:13:25 UTC
  • mfrom: (1.1.1 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090822011325-hi4peq1ua5weguwn
Tags: 2.0-1
* New upstream release.
* Set Maintainer field to Debian Java Team
* Add myself as Uploaders
* Switch to Quilt patch system:
  - Refresh all patchs
  - Remove B-D on dpatch, Add B-D on quilt
  - Include patchsys-quilt.mk in debian/rules
* Bump Standards-Version to 3.8.3:
  - Add a README.source to describe patch system
* Maven POMs:
  - Add a Build-Depends-Indep dependency on maven-repo-helper
  - Use mh_installpom and mh_installjar to install the POM and the jar to the
    Maven repository
* Use default-jdk/jre:
  - Depends on java5-runtime-headless
  - Build-Depends on default-jdk
  - Use /usr/lib/jvm/default-java as JAVA_HOME
* Move api documentation to /usr/share/doc/libcommons-math-java/api
* Build-Depends on junit4 instead of junit

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
src/test/java/org/apache/commons/math/stat/descriptive/moment/VectorialCovarianceTest.java
 
1
//Licensed to the Apache Software Foundation (ASF) under one
 
2
//or more contributor license agreements.  See the NOTICE file
 
3
//distributed with this work for additional information
 
4
//regarding copyright ownership.  The ASF licenses this file
 
5
//to you under the Apache License, Version 2.0 (the
 
6
//"License"); you may not use this file except in compliance
 
7
//with the License.  You may obtain a copy of the License at
 
8
 
 
9
//http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
 
10
 
 
11
//Unless required by applicable law or agreed to in writing,
 
12
//software distributed under the License is distributed on an
 
13
//"AS IS" BASIS, WITHOUT WARRANTIES OR CONDITIONS OF ANY
 
14
//KIND, either express or implied.  See the License for the
 
15
//specific language governing permissions and limitations
 
16
//under the License.
 
17
 
 
18
package org.apache.commons.math.stat.descriptive.moment;
 
19
 
 
20
import org.apache.commons.math.DimensionMismatchException;
 
21
import org.apache.commons.math.TestUtils;
 
22
import org.apache.commons.math.linear.RealMatrix;
 
23
 
 
24
import junit.framework.Test;
 
25
import junit.framework.TestCase;
 
26
import junit.framework.TestSuite;
 
27
 
 
28
public class VectorialCovarianceTest
 
29
extends TestCase {
 
30
 
 
31
    public VectorialCovarianceTest(String name) {
 
32
        super(name);
 
33
        points = null;
 
34
    }
 
35
 
 
36
    public void testMismatch() {
 
37
        try {
 
38
            new VectorialCovariance(8, true).increment(new double[5]);
 
39
            fail("an exception should have been thrown");
 
40
        } catch (DimensionMismatchException dme) {
 
41
            assertEquals(5, dme.getDimension1());
 
42
            assertEquals(8, dme.getDimension2());
 
43
        } catch (Exception e) {
 
44
            fail("wrong exception type caught: " + e.getClass().getName());
 
45
        }
 
46
    }
 
47
 
 
48
    public void testSimplistic() throws DimensionMismatchException {
 
49
        VectorialCovariance stat = new VectorialCovariance(2, true);
 
50
        stat.increment(new double[] {-1.0,  1.0});
 
51
        stat.increment(new double[] { 1.0, -1.0});
 
52
        RealMatrix c = stat.getResult();
 
53
        assertEquals( 2.0, c.getEntry(0, 0), 1.0e-12);
 
54
        assertEquals(-2.0, c.getEntry(1, 0), 1.0e-12);
 
55
        assertEquals( 2.0, c.getEntry(1, 1), 1.0e-12);
 
56
    }
 
57
 
 
58
    public void testBasicStats() throws DimensionMismatchException {
 
59
 
 
60
        VectorialCovariance stat = new VectorialCovariance(points[0].length, true);
 
61
        for (int i = 0; i < points.length; ++i) {
 
62
            stat.increment(points[i]);
 
63
        }
 
64
 
 
65
        assertEquals(points.length, stat.getN());
 
66
 
 
67
        RealMatrix c = stat.getResult();
 
68
        double[][] refC    = new double[][] {
 
69
                { 8.0470, -1.9195, -3.4445},
 
70
                {-1.9195,  1.0470,  3.2795},
 
71
                {-3.4445,  3.2795, 12.2070}
 
72
        };
 
73
 
 
74
        for (int i = 0; i < c.getRowDimension(); ++i) {
 
75
            for (int j = 0; j <= i; ++j) {
 
76
                assertEquals(refC[i][j], c.getEntry(i, j), 1.0e-12);
 
77
            }
 
78
        }
 
79
 
 
80
    }
 
81
 
 
82
    public void testSerial(){
 
83
        VectorialCovariance stat = new VectorialCovariance(points[0].length, true);
 
84
        assertEquals(stat, TestUtils.serializeAndRecover(stat));
 
85
    }
 
86
    
 
87
    @Override
 
88
    public void setUp() {
 
89
        points = new double[][] {
 
90
                { 1.2, 2.3,  4.5},
 
91
                {-0.7, 2.3,  5.0},
 
92
                { 3.1, 0.0, -3.1},
 
93
                { 6.0, 1.2,  4.2},
 
94
                {-0.7, 2.3,  5.0}
 
95
        };
 
96
    }
 
97
 
 
98
    @Override
 
99
    public void tearDown() {
 
100
        points = null;
 
101
    }
 
102
 
 
103
    public static Test suite() {
 
104
        return new TestSuite(VectorialCovarianceTest.class);
 
105
    }
 
106
 
 
107
    private double [][] points;
 
108
 
 
109
}