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Viewing changes to src/test/org/apache/commons/math/stat/descriptive/MixedListUnivariateImplTest.java

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Damien Raude-Morvan
  • Date: 2009-08-22 01:13:25 UTC
  • mfrom: (1.1.1 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090822011325-hi4peq1ua5weguwn
Tags: 2.0-1
* New upstream release.
* Set Maintainer field to Debian Java Team
* Add myself as Uploaders
* Switch to Quilt patch system:
  - Refresh all patchs
  - Remove B-D on dpatch, Add B-D on quilt
  - Include patchsys-quilt.mk in debian/rules
* Bump Standards-Version to 3.8.3:
  - Add a README.source to describe patch system
* Maven POMs:
  - Add a Build-Depends-Indep dependency on maven-repo-helper
  - Use mh_installpom and mh_installjar to install the POM and the jar to the
    Maven repository
* Use default-jdk/jre:
  - Depends on java5-runtime-headless
  - Build-Depends on default-jdk
  - Use /usr/lib/jvm/default-java as JAVA_HOME
* Move api documentation to /usr/share/doc/libcommons-math-java/api
* Build-Depends on junit4 instead of junit

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Lines of Context:
src/test/org/apache/commons/math/stat/descriptive/MixedListUnivariateImplTest.java
1
 
/*
2
 
 * Licensed to the Apache Software Foundation (ASF) under one or more
3
 
 * contributor license agreements.  See the NOTICE file distributed with
4
 
 * this work for additional information regarding copyright ownership.
5
 
 * The ASF licenses this file to You under the Apache License, Version 2.0
6
 
 * (the "License"); you may not use this file except in compliance with
7
 
 * the License.  You may obtain a copy of the License at
8
 
 * 
9
 
 *      http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
10
 
 * 
11
 
 * Unless required by applicable law or agreed to in writing, software
12
 
 * distributed under the License is distributed on an "AS IS" BASIS,
13
 
 * WITHOUT WARRANTIES OR CONDITIONS OF ANY KIND, either express or implied.
14
 
 * See the License for the specific language governing permissions and
15
 
 * limitations under the License.
16
 
 */
17
 
package org.apache.commons.math.stat.descriptive;
18
 
 
19
 
import java.util.ArrayList;
20
 
import java.util.List;
21
 
 
22
 
import org.apache.commons.math.util.NumberTransformer;
23
 
import org.apache.commons.math.util.TransformerMap;
24
 
import junit.framework.Test;
25
 
import junit.framework.TestCase;
26
 
import junit.framework.TestSuite;
27
 
 
28
 
/**
29
 
 * Test cases for the {@link ListUnivariateImpl} class.
30
 
 *
31
 
 * @version $Revision: 618202 $ $Date: 2008-02-04 01:44:36 -0700 (Mon, 04 Feb 2008) $
32
 
 */
33
 
 
34
 
public final class MixedListUnivariateImplTest extends TestCase {
35
 
    private double one = 1;
36
 
    private float two = 2;
37
 
    private int three = 3;
38
 
 
39
 
    private double mean = 2;
40
 
    private double sumSq = 18;
41
 
    private double sum = 8;
42
 
    private double var = 0.666666666666666666667;
43
 
    private double std = Math.sqrt(var);
44
 
    private double n = 4;
45
 
    private double min = 1;
46
 
    private double max = 3;
47
 
    private double tolerance = 10E-15;
48
 
 
49
 
    private TransformerMap transformers = new TransformerMap();
50
 
    
51
 
    public MixedListUnivariateImplTest(String name) {
52
 
        super(name);
53
 
        transformers = new TransformerMap();
54
 
 
55
 
        transformers.putTransformer(Foo.class, new FooTransformer());
56
 
 
57
 
        transformers.putTransformer(Bar.class, new BarTransformer());
58
 
 
59
 
    }
60
 
 
61
 
    public void setUp() {
62
 
    }
63
 
 
64
 
    public static Test suite() {
65
 
        TestSuite suite = new TestSuite(MixedListUnivariateImplTest.class);
66
 
        suite.setName("Mixed List Tests");
67
 
        return suite;
68
 
    }
69
 
 
70
 
    /** test stats */
71
 
    public void testStats() {
72
 
        List externalList = new ArrayList();
73
 
 
74
 
        DescriptiveStatistics u = new ListUnivariateImpl(externalList,transformers);
75
 
 
76
 
        assertEquals("total count", 0, u.getN(), tolerance);
77
 
        u.addValue(one);
78
 
        u.addValue(two);
79
 
        u.addValue(two);
80
 
        u.addValue(three);
81
 
        assertEquals("N", n, u.getN(), tolerance);
82
 
        assertEquals("sum", sum, u.getSum(), tolerance);
83
 
        assertEquals("sumsq", sumSq, u.getSumsq(), tolerance);
84
 
        assertEquals("var", var, u.getVariance(), tolerance);
85
 
        assertEquals("std", std, u.getStandardDeviation(), tolerance);
86
 
        assertEquals("mean", mean, u.getMean(), tolerance);
87
 
        assertEquals("min", min, u.getMin(), tolerance);
88
 
        assertEquals("max", max, u.getMax(), tolerance);
89
 
        u.clear();
90
 
        assertEquals("total count", 0, u.getN(), tolerance);
91
 
    }
92
 
 
93
 
    public void testN0andN1Conditions() throws Exception {
94
 
        DescriptiveStatistics u = new ListUnivariateImpl(new ArrayList(),transformers);
95
 
 
96
 
        assertTrue(
97
 
            "Mean of n = 0 set should be NaN",
98
 
            Double.isNaN(u.getMean()));
99
 
        assertTrue(
100
 
            "Standard Deviation of n = 0 set should be NaN",
101
 
            Double.isNaN(u.getStandardDeviation()));
102
 
        assertTrue(
103
 
            "Variance of n = 0 set should be NaN",
104
 
            Double.isNaN(u.getVariance()));
105
 
 
106
 
        u.addValue(one);
107
 
 
108
 
        assertTrue(
109
 
            "Mean of n = 1 set should be value of single item n1, instead it is " + u.getMean() ,
110
 
            u.getMean() == one);
111
 
            
112
 
        assertTrue(
113
 
            "StdDev of n = 1 set should be zero, instead it is: "
114
 
                + u.getStandardDeviation(),
115
 
            u.getStandardDeviation() == 0);
116
 
        assertTrue(
117
 
            "Variance of n = 1 set should be zero",
118
 
            u.getVariance() == 0);
119
 
    }
120
 
 
121
 
    public void testSkewAndKurtosis() {
122
 
        ListUnivariateImpl u =
123
 
            new ListUnivariateImpl(new ArrayList(), transformers);
124
 
 
125
 
        u.addObject("12.5");
126
 
        u.addObject(new Integer(12));
127
 
        u.addObject("11.8");
128
 
        u.addObject("14.2");
129
 
        u.addObject(new Foo());
130
 
        u.addObject("14.5");
131
 
        u.addObject(new Long(21));
132
 
        u.addObject("8.2");
133
 
        u.addObject("10.3");
134
 
        u.addObject("11.3");
135
 
        u.addObject(new Float(14.1));
136
 
        u.addObject("9.9");
137
 
        u.addObject("12.2");
138
 
        u.addObject(new Bar());
139
 
        u.addObject("12.1");
140
 
        u.addObject("11");
141
 
        u.addObject(new Double(19.8));
142
 
        u.addObject("11");
143
 
        u.addObject("10");
144
 
        u.addObject("8.8");
145
 
        u.addObject("9");
146
 
        u.addObject("12.3");
147
 
 
148
 
 
149
 
        assertEquals("mean", 12.40455, u.getMean(), 0.0001);
150
 
        assertEquals("variance", 10.00236, u.getVariance(), 0.0001);
151
 
        assertEquals("skewness", 1.437424, u.getSkewness(), 0.0001);
152
 
        assertEquals("kurtosis", 2.37719, u.getKurtosis(), 0.0001);
153
 
    }
154
 
 
155
 
    public void testProductAndGeometricMean() throws Exception {
156
 
        ListUnivariateImpl u = new ListUnivariateImpl(new ArrayList(),transformers);
157
 
        u.setWindowSize(10);
158
 
 
159
 
        u.addValue(1.0);
160
 
        u.addValue(2.0);
161
 
        u.addValue(3.0);
162
 
        u.addValue(4.0);
163
 
 
164
 
        assertEquals(
165
 
            "Geometric mean not expected",
166
 
            2.213364,
167
 
            u.getGeometricMean(),
168
 
            0.00001);
169
 
 
170
 
        // Now test rolling - StorelessDescriptiveStatistics should discount the contribution
171
 
        // of a discarded element
172
 
        for (int i = 0; i < 10; i++) {
173
 
            u.addValue(i + 2);
174
 
        }
175
 
        // Values should be (2,3,4,5,6,7,8,9,10,11)
176
 
        assertEquals(
177
 
            "Geometric mean not expected",
178
 
            5.755931,
179
 
            u.getGeometricMean(),
180
 
            0.00001);
181
 
 
182
 
    }
183
 
 
184
 
    public static final class Foo {
185
 
        public String heresFoo() {
186
 
            return "14.9";
187
 
        }
188
 
    }
189
 
 
190
 
    public static final class FooTransformer implements NumberTransformer {
191
 
        private static final long serialVersionUID = -4252248129291326127L;
192
 
        public double transform(Object o) {
193
 
            return Double.parseDouble(((Foo) o).heresFoo());
194
 
        }
195
 
    }
196
 
 
197
 
    public static final class Bar {
198
 
        public String heresBar() {
199
 
            return "12.0";
200
 
        }
201
 
    }
202
 
 
203
 
    public static final class BarTransformer implements NumberTransformer {
204
 
        private static final long serialVersionUID = -1768345377764262043L;
205
 
        public double transform(Object o) {
206
 
            return Double.parseDouble(((Bar) o).heresBar());
207
 
        }
208
 
    }
209
 
 
210
 
}