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Viewing changes to src/test/org/apache/commons/math/stat/descriptive/moment/StandardDeviationTest.java

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Damien Raude-Morvan
  • Date: 2009-08-22 01:13:25 UTC
  • mfrom: (1.1.1 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090822011325-hi4peq1ua5weguwn
Tags: 2.0-1
* New upstream release.
* Set Maintainer field to Debian Java Team
* Add myself as Uploaders
* Switch to Quilt patch system:
  - Refresh all patchs
  - Remove B-D on dpatch, Add B-D on quilt
  - Include patchsys-quilt.mk in debian/rules
* Bump Standards-Version to 3.8.3:
  - Add a README.source to describe patch system
* Maven POMs:
  - Add a Build-Depends-Indep dependency on maven-repo-helper
  - Use mh_installpom and mh_installjar to install the POM and the jar to the
    Maven repository
* Use default-jdk/jre:
  - Depends on java5-runtime-headless
  - Build-Depends on default-jdk
  - Use /usr/lib/jvm/default-java as JAVA_HOME
* Move api documentation to /usr/share/doc/libcommons-math-java/api
* Build-Depends on junit4 instead of junit

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Lines of Context:
src/test/org/apache/commons/math/stat/descriptive/moment/StandardDeviationTest.java
1
 
/*
2
 
 * Licensed to the Apache Software Foundation (ASF) under one or more
3
 
 * contributor license agreements.  See the NOTICE file distributed with
4
 
 * this work for additional information regarding copyright ownership.
5
 
 * The ASF licenses this file to You under the Apache License, Version 2.0
6
 
 * (the "License"); you may not use this file except in compliance with
7
 
 * the License.  You may obtain a copy of the License at
8
 
 * 
9
 
 *      http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
10
 
 * 
11
 
 * Unless required by applicable law or agreed to in writing, software
12
 
 * distributed under the License is distributed on an "AS IS" BASIS,
13
 
 * WITHOUT WARRANTIES OR CONDITIONS OF ANY KIND, either express or implied.
14
 
 * See the License for the specific language governing permissions and
15
 
 * limitations under the License.
16
 
 */
17
 
package org.apache.commons.math.stat.descriptive.moment;
18
 
 
19
 
import junit.framework.Test;
20
 
import junit.framework.TestSuite;
21
 
 
22
 
import org.apache.commons.math.stat.descriptive.StorelessUnivariateStatisticAbstractTest;
23
 
import org.apache.commons.math.stat.descriptive.UnivariateStatistic;
24
 
 
25
 
/**
26
 
 * Test cases for the {@link UnivariateStatistic} class.
27
 
 * 
28
 
 * @version $Revision: 480442 $ $Date: 2006-11-29 00:21:22 -0700 (Wed, 29 Nov 2006) $
29
 
 */
30
 
public class StandardDeviationTest extends StorelessUnivariateStatisticAbstractTest{
31
 
 
32
 
    protected StandardDeviation stat;
33
 
    
34
 
    /**
35
 
     * @param name
36
 
     */
37
 
    public StandardDeviationTest(String name) {
38
 
        super(name);
39
 
    }
40
 
 
41
 
    /* (non-Javadoc)
42
 
     * @see org.apache.commons.math.stat.descriptive.UnivariateStatisticAbstractTest#getUnivariateStatistic()
43
 
     */
44
 
    public UnivariateStatistic getUnivariateStatistic() {
45
 
        return new StandardDeviation();
46
 
    }
47
 
 
48
 
    public static Test suite() {
49
 
        TestSuite suite = new TestSuite(StandardDeviationTest.class);
50
 
        suite.setName("StandardDeviation Tests");
51
 
        return suite;
52
 
    }
53
 
    
54
 
    /* (non-Javadoc)
55
 
     * @see org.apache.commons.math.stat.descriptive.UnivariateStatisticAbstractTest#expectedValue()
56
 
     */
57
 
    public double expectedValue() {
58
 
        return this.std;
59
 
    }
60
 
    
61
 
    /**
62
 
     * Make sure Double.NaN is returned iff n = 0
63
 
     *
64
 
     */
65
 
    public void testNaN() {
66
 
        StandardDeviation std = new StandardDeviation();
67
 
        assertTrue(Double.isNaN(std.getResult()));
68
 
        std.increment(1d);
69
 
        assertEquals(0d, std.getResult(), 0);
70
 
    }
71
 
    
72
 
    /**
73
 
     * Test population version of variance
74
 
     */ 
75
 
    public void testPopulation() {
76
 
        double[] values = {-1.0d, 3.1d, 4.0d, -2.1d, 22d, 11.7d, 3d, 14d};
77
 
        double sigma = populationStandardDeviation(values);
78
 
        SecondMoment m = new SecondMoment();
79
 
        m.evaluate(values);  // side effect is to add values
80
 
        StandardDeviation s1 = new StandardDeviation();
81
 
        s1.setBiasCorrected(false);
82
 
        assertEquals(sigma, s1.evaluate(values), 1E-14);
83
 
        s1.incrementAll(values);
84
 
        assertEquals(sigma, s1.getResult(), 1E-14);
85
 
        s1 = new StandardDeviation(false, m);
86
 
        assertEquals(sigma, s1.getResult(), 1E-14);     
87
 
        s1 = new StandardDeviation(false);
88
 
        assertEquals(sigma, s1.evaluate(values), 1E-14);
89
 
        s1.incrementAll(values);
90
 
        assertEquals(sigma, s1.getResult(), 1E-14);     
91
 
    }
92
 
    
93
 
    /**
94
 
     * Definitional formula for population standard deviation
95
 
     */
96
 
    protected double populationStandardDeviation(double[] v) {
97
 
        double mean = new Mean().evaluate(v);
98
 
        double sum = 0;
99
 
        for (int i = 0; i < v.length; i++) {
100
 
            sum += (v[i] - mean) * (v[i] - mean); 
101
 
        }
102
 
        return Math.sqrt(sum / (double) v.length);
103
 
    }
104
 
 
105
 
}