~ubuntu-branches/ubuntu/precise/ncbi-tools6/precise

« back to all changes in this revision

Viewing changes to api/gbftdef.h

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Aaron M. Ucko
  • Date: 2005-03-27 12:00:15 UTC
  • mfrom: (2.1.2 hoary)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20050327120015-embhesp32nj73p9r
Tags: 6.1.20041020-3
* Fix FTBFS under GCC 4.0 caused by inconsistent use of "static" on
  functions.  (Closes: #295110.)
* Add a watch file, now that we can.  (Upstream's layout needs version=3.)

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
3
3
*   -- GenBank Feature table define file
4
4
*
5
5
* $Log: gbftdef.h,v $
 
6
* Revision 6.18  2004/08/17 15:50:52  kans
 
7
* added GBQUAL_old_locus_tag and GBQUAL_compare
 
8
*
 
9
* Revision 6.17  2003/10/07 13:50:36  kans
 
10
* added gap, operon, oriT features and ecotype, estimated_length and operon qualifiers
 
11
*
 
12
* Revision 6.16  2003/08/19 15:18:37  kans
 
13
* added GBQUAL_segment, increased ParFlat_TOTAL_GBQUAL and opt_qual array size
 
14
*
 
15
* Revision 6.15  2003/05/07 22:03:31  kans
 
16
* added GBQUAL_mol_type, raised opt_qual array to 51 elements
 
17
*
 
18
* Revision 6.14  2003/02/22 21:20:05  kans
 
19
* added GBQUAL_locus_tag, legal for now in gene features
 
20
*
 
21
* Revision 6.13  2002/04/17 14:41:08  kans
 
22
* added GBQUAL_serovar to source feature
 
23
*
 
24
* Revision 6.12  2002/03/26 16:06:30  kans
 
25
* added transgenic, environmental_sample, and isolation_source
 
26
*
 
27
* Revision 6.11  2002/02/13 18:45:52  kans
 
28
* increased ParFlat_TOTAL_GBFEAT, added snoRNA
 
29
*
6
30
* Revision 6.10  2001/04/10 22:17:03  tatiana
7
31
* GBQUAL_endogenous_virus backed off to /note
8
32
*
154
178
#define GBQUAL_virion            70
155
179
#define GBQUAL_focus             71
156
180
#define GBQUAL_specimen_voucher  72
157
 
#define GBQUAL_protein_id            73
158
 
#define GBQUAL_country               74
159
 
#define GBQUAL_organelle                 75
160
 
#define GBQUAL_transcript_id     76
 
181
#define GBQUAL_protein_id        73
 
182
#define GBQUAL_country           74
 
183
#define GBQUAL_organelle         75
 
184
#define GBQUAL_transcript_id     76
 
185
#define GBQUAL_transgenic        77
 
186
#define GBQUAL_environmental_sample 78
 
187
#define GBQUAL_isolation_source  79
 
188
#define GBQUAL_serovar           80
 
189
#define GBQUAL_locus_tag         81
 
190
#define GBQUAL_mol_type          82
 
191
#define GBQUAL_segment           83
 
192
#define GBQUAL_ecotype           84
 
193
#define GBQUAL_estimated_length  85
 
194
#define GBQUAL_operon            86
 
195
#define GBQUAL_old_locus_tag     87
 
196
#define GBQUAL_compare           88
161
197
 
162
 
#define ParFlat_TOTAL_GBQUAL     77
 
198
#define ParFlat_TOTAL_GBQUAL     89
163
199
#define ParFlat_TOTAL_IntOr       3
164
200
#define ParFlat_TOTAL_LRB         3
165
201
#define ParFlat_TOTAL_Exp         2
166
202
#define ParFlat_TOTAL_Rpt         7
167
 
#define ParFlat_TOTAL_GBFEAT     63
 
203
#define ParFlat_TOTAL_GBFEAT     67
168
204
 
169
205
#define  Class_pos_aa             1
170
206
#define  Class_text               2
197
233
    Int2     mand_num;
198
234
    Int2     mand_qual[5];
199
235
    Int2     opt_num;
200
 
    Int2     opt_qual[50];
 
236
    Int2     opt_qual[55];
201
237
} SematicFeat, PNTR SematicFeatPtr;
202
238
 
203
239
typedef struct gbfeat_name {