← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/bioperl/trusty-proposed

« back to all changes in this revision

Viewing changes to t/data/biographics/feature_data.txt

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2009-03-10 07:19:11 UTC
  • mfrom: (1.2.3 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090310071911-fukqzw54pyb1f0bd
Tags: 1.6.0-2
https://launchpad.net/bugs/324001
* Removed patch system (not used):
  - removed instuctions in debian/rules;
  - removed quilt from Build-Depends in debian/control.
* Re-enabled tests:
  - uncommented test command in debian/rules;
  - uncommented previously missing build-dependencies in debian/control.
  - Re-enabled tests and uncommented build-dependencies accordingly.
* Removed libmodule-build-perl and libtest-harness-perl from
  Build-Depends-Indep (provided by perl-modules).
* Better cleaning of empty directories using find -type d -empty -delete
  instead of rmdir in debian/rules (LP: #324001).

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
t/data/biographics/feature_data.txt
1
 
[general]
2
 
pixels = 750
3
 
bases = -1000..21000
4
 
height = 12
5
 
reference = B0511
6
 
 
7
 
[Cosmid]
8
 
glyph = segments
9
 
fgcolor = blue
10
 
key = C. elegans conserved regions
11
 
 
12
 
[EST]
13
 
glyph = segments
14
 
bgcolor= yellow
15
 
connector = solid
16
 
height = 5
17
 
 
18
 
[FGENESH]
19
 
glyph = transcript2
20
 
bgcolor = green
21
 
description = 1
22
 
 
23
 
[SwissProt]
24
 
glyph = arrow
25
 
base  = 1
26
 
linewidth = 2
27
 
fgcolor = red
28
 
description = 1
29
 
 
30
 
[P-element]
31
 
glyph = triangle
32
 
orient = S
33
 
bgcolor   = red
34
 
fgcolor   = white
35
 
fontcolor = black
36
 
label = 1
37
 
point = 1
38
 
 
39
 
Cosmid  B0511   516-619
40
 
Cosmid  B0511   3185-3294
41
 
Cosmid  B0511   10946-11208
42
 
Cosmid  B0511   13126-13511
43
 
Cosmid  B0511   11394-11539
44
 
Cosmid  B0511   14383-14490
45
 
Cosmid  B0511   15569-15755
46
 
Cosmid  B0511   18879-19178
47
 
Cosmid  B0511   15850-16110
48
 
Cosmid  B0511   66-208
49
 
Cosmid  B0511   6354-6499
50
 
Cosmid  B0511   13955-14115
51
 
Cosmid  B0511   7985-8042
52
 
Cosmid  B0511   11916-12046
53
 
P-element       ""      500-500
54
 
P-element       MrQ     700-700
55
 
P-element       MrR     10000-10000
56
 
EST     yk260e10.5      15569-15724
57
 
EST     yk672a12.5      537-618,3187-3294
58
 
EST     yk595e6.5       552-618,3187-3294
59
 
EST     yk846e07.3      11015-11208
60
 
EST     yk53c10
61
 
        yk53c10.3       12876-13577,13882-14121,14169-14535
62
 
        yk53c10.5       18892-19154,15853-16219
63
 
SwissProt       "PECANEX Protein"       5513-16656      "From SwissProt"
64
 
FGENESH "Predicted gene 1"      -1200--500,518-616,661-735,3187-3365,3436-3846  description=Pfam;score=20
65
 
FGENESH "Predicted gene 2"      5513-6497,7968-8136,8278-8383,8651-8839,9462-9515,10032-10705,10949-11340,11387-11524,11765-12067,12876-13577,13882-14121,14169-14535,15006-15209,15259-15462,15513-15753,15853-16219   Mysterious
66
 
FGENESH "Predicted gene 3"      16626-17396,17451-17597
67
 
FGENESH "Predicted gene 4"      18459-18722,18882-19176,19221-19513,19572-30000 note=Transmembrane+protein;score=20,50;score=80