← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/bioperl/trusty-proposed

« back to all changes in this revision

Viewing changes to t/data/test1.blasttab3

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2009-03-10 07:19:11 UTC
  • mfrom: (1.2.3 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090310071911-fukqzw54pyb1f0bd
Tags: 1.6.0-2
https://launchpad.net/bugs/324001
* Removed patch system (not used):
  - removed instuctions in debian/rules;
  - removed quilt from Build-Depends in debian/control.
* Re-enabled tests:
  - uncommented test command in debian/rules;
  - uncommented previously missing build-dependencies in debian/control.
  - Re-enabled tests and uncommented build-dependencies accordingly.
* Removed libmodule-build-perl and libtest-harness-perl from
  Build-Depends-Indep (provided by perl-modules).
* Better cleaning of empty directories using find -type d -empty -delete
  instead of rmdir in debian/rules (LP: #324001).

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
t/data/test1.blasttab3
 
1
# BLASTP 2.0MP-WashU [04-May-2006] [linux26-i686-ILP32F64 2006-05-09T11:47:08]
 
2
# Start: 3:11:00 PM CEST May 21, 2008
 
3
# Parameters:
 
4
#   topcomboN=5
 
5
#   links
 
6
#   E=0.0001
 
7
#   mformat=3
 
8
#   V=5
 
9
#   B=5
 
10
# Database: test_orfs.fa
 
11
#   Title: test_orfs.fa
 
12
#   Posted: 11:50:04 AM CEST May 14, 2008
 
13
#   Created: 11:50:04 AM CEST May 14, 2008
 
14
#   Letters: 9460
 
15
#   Records: 307
 
16
# Query: 000086_1606_1131
 
17
# Fields: qid   sid     E       N       Sprime  S       alignlen        nident  npos    nmism   pcident pcpos   qgaps   qgaplen sgaps   sgaplen qframe  qstart  qend    sframe  sstart  send    group   links
 
18
000086_1606_1131        000086_1606_1131        1.7e-11 1       50.12   128     21      21      21      0       100.00  100.00  0       0       0       0       +0      1       21      +0      1       21      1       (1)
 
19
000086_1606_1131        000269_0423_3271        5.4e-06 1       31.81   76      22      17      18      1       77.27   81.82   2       2       2       2       +0      1       20      +0      2       21      1       (1)
 
20
000086_1606_1131        000780_0082_2331        6.9e-06 1       31.46   75      23      17      19      2       73.91   82.61   3       3       1       1       +0      1       20      +0      2       23      1       (1)
 
21
# EXIT: [000086_1606_1131]: 0