~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/qiime/trusty

« back to all changes in this revision

Viewing changes to doc/scripts/split_otu_table.rst

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Andreas Tille
  • Date: 2013-06-17 18:28:26 UTC
  • mfrom: (9.1.2 sid)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20130617182826-376az5ad080a0sfe
Tags: 1.7.0+dfsg-1
Upload preparations done for BioLinux to Debian

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
27
27
                Mapping column to split otu table on
28
28
        -o, `-`-output_dir
29
29
                The output directory
30
 
        
31
 
        **[OPTIONAL]**
32
 
                
33
 
        -c, `-`-column_rename_ids
34
 
                Mapping column used as sample id in the output files. Has to be unique in the splited samples. This option can be helpful to create otu tables and mapping files for Procustes analysis.
35
 
        `-`-include_repeat_cols
36
 
                By default the new mapping files will not have the columns that have the same information, to include them use this option. This can be helpful to create mapping files for Procrustes analysis.
37
30
 
38
31
 
39
32
**Output:**