~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/qiime/trusty

« back to all changes in this revision

Viewing changes to scripts/start_parallel_jobs.py

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Andreas Tille
  • Date: 2013-06-17 18:28:26 UTC
  • mfrom: (9.1.2 sid)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20130617182826-376az5ad080a0sfe
Tags: 1.7.0+dfsg-1
Upload preparations done for BioLinux to Debian

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
4
4
 
5
5
__author__ = "Greg Caporaso"
6
6
__copyright__ = "Copyright 2011, The QIIME Project"
7
 
__credits__ = ["Greg Caporaso"]
 
7
__credits__ = ["Greg Caporaso", "Jai Ram Rideout"]
8
8
__license__ = "GPL"
9
 
__version__ = "1.5.0"
 
9
__version__ = "1.7.0"
10
10
__maintainer__ = "Greg Caporaso"
11
11
__email__ = "gregcaporaso@gmail.com"
12
12
__status__ = "Release"
26
26
 
27
27
script_info = {}
28
28
script_info['brief_description'] = "Starts multiple jobs in parallel on multicore or multiprocessor systems."
29
 
script_info['script_description'] = "This script is designed to start multiple jobs in parallel on systems with no queueing system, for example a multiple processor or multiple core laptop/desktop machine. This also serves as an example 'cluster_jobs' which users can use a template to define scripts to start parallel jobs in their environment."
30
 
script_info['script_usage'] = [\
31
 
 ("Example",\
32
 
 "Start each command listed in test_jobs.txt in parallel. The run id for these jobs will be RUNID. ",\
 
29
script_info['script_description'] = "This script is designed to start multiple jobs in parallel on systems with no queueing system, for example a multiple processor or multiple core laptop/desktop machine. This also serves as an example 'cluster_jobs' which users can use as a template to define scripts to start parallel jobs in their environment."
 
30
script_info['script_usage'] = [
 
31
 ("Example",
 
32
 "Start each command listed in test_jobs.txt in parallel. The run ID for these jobs will be RUNID.",
33
33
 "%prog -ms test_jobs.txt RUNID")]
34
34
script_info['output_description']= "No output is created."
35
35
script_info['required_options'] = []
36
 
script_info['optional_options'] = [\
37
 
 make_option('-m','--make_jobs',action='store_true',\
38
 
         help='make the job files [default: %default]'),\
39
 
 make_option('-s','--submit_jobs',action='store_true',\
 
36
script_info['optional_options'] = [
 
37
 make_option('-m','--make_jobs',action='store_true',
 
38
         help='make the job files [default: %default]'),
 
39
 make_option('-s','--submit_jobs',action='store_true',
40
40
         help='submit the job files [default: %default]')
41
41
]
42
42
script_info['version'] = __version__
124
124
 
125
125
 
126
126
if __name__ == "__main__":
127
 
    main()
 
 
b'\\ No newline at end of file'
 
127
    main()