← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/qiime/trusty

« back to all changes in this revision

Viewing changes to qiime_test_data/filter_otus_from_otu_table/otu_table_no_singletons.biom

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Andreas Tille
  • Date: 2013-06-17 18:28:26 UTC
  • mfrom: (9.1.2 sid)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20130617182826-376az5ad080a0sfe
Tags: 1.7.0+dfsg-1
Upload preparations done for BioLinux to Debian

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
qiime_test_data/filter_otus_from_otu_table/otu_table_no_singletons.biom
 
1
{"rows": [{"id": "0", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "5", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "6", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "8", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "10", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "11", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "12", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "19", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "22", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "24", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "28", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__TM7", "c__TM7-3", "o__CW040", "f__F16"]}}, {"id": "31", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "36", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Actinobacteria", "c__Actinobacteria", "o__Coriobacteriales", "f__Coriobacteriaceae"]}}, {"id": "37", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "38", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "39", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "40", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "44", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "47", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "48", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "49", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Deferribacteres", "c__Deferribacteres", "o__Deferribacterales", "f__Deferribacteraceae"]}}, {"id": "59", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "63", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "70", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "73", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "74", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "75", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "78", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "84", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "89", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "92", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "96", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "97", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "100", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "102", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "109", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Bacilli", "o__Lactobacillales", "f__Lactobacillaceae"]}}, {"id": "111", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "113", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "117", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "119", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "121", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "123", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "124", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales"]}}, {"id": "129", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "132", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Peptococcaceae"]}}, {"id": "136", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "143", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "144", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria"]}}, {"id": "145", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "148", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "153", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "158", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "159", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "161", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "162", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Bacilli", "o__Lactobacillales", "f__Lactobacillaceae"]}}, {"id": "164", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "165", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "166", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales"]}}, {"id": "167", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "170", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "175", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "177", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales"]}}, {"id": "178", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "180", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "181", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "185", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "187", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "190", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "192", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Tenericutes", "c__Erysipelotrichi", "o__Erysipelotrichales", "f__Erysipelotrichaceae"]}}, {"id": "202", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "203", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "208", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "210", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "212", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "214", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria"]}}, {"id": "216", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "217", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "218", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes"]}}, {"id": "220", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "222", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "224", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "225", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "229", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "230", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Tenericutes", "c__Erysipelotrichi", "o__Erysipelotrichales", "f__Erysipelotrichaceae"]}}, {"id": "232", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "238", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Bacilli", "o__Lactobacillales", "f__Lactobacillaceae"]}}, {"id": "240", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "247", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "250", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "252", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "254", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "257", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "258", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "259", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "267", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "269", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "273", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "275", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "276", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "278", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "282", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "286", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Proteobacteria", "c__Deltaproteobacteria", "o__Desulfovibrionales", "f__Desulfovibrionaceae"]}}, {"id": "287", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "289", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "294", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "297", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Bacilli", "o__Bacillales", "f__Staphylococcaceae"]}}, {"id": "304", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "309", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "312", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "315", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "317", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Proteobacteria", "c__Epsilonproteobacteria", "o__Campylobacterales", "f__Helicobacteraceae"]}}, {"id": "319", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "321", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "327", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "333", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "336", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "341", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "344", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "347", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "349", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "350", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "359", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Clostridiales Family XIII. Incertae Sedis"]}}, {"id": "361", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "368", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "370", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "371", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "375", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "377", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "378", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "380", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "382", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "384", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "385", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "387", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "393", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__"]}}, {"id": "394", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "395", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "396", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "399", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "404", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Tenericutes", "c__Erysipelotrichi", "o__Erysipelotrichales", "f__Erysipelotrichaceae"]}}, {"id": "405", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Clostridiaceae"]}}, {"id": "407", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Bacilli", "o__Turicibacterales", "f__Turicibacteraceae"]}}, {"id": "412", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "413", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}], "format": "Biological Observation Matrix 0.9.1-dev", "data": [[0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0], [0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0], [1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1], [1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0], [1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0], [0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0], [1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 3], [0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0], [16, 0, 0, 0, 12, 0, 0, 0, 0], [6, 0, 4, 0, 2, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 3, 5, 2, 6], [0, 0, 0, 1, 0, 0, 4, 10, 37], [1, 3, 1, 2, 1, 9, 2, 4, 5], [2, 1, 10, 2, 24, 0, 0, 1, 1], [0, 0, 0, 0, 2, 2, 1, 4, 1], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 3, 2], [0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 2], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2], [0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 2, 19], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 0], [0, 4, 4, 0, 1, 2, 0, 2, 1], [1, 4, 2, 6, 0, 0, 0, 0, 0], [2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 1, 0], [1, 1, 0, 2, 4, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0], [0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0], [1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0], [0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1], [1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0], [2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0], [1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0], [0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 1, 0], [4, 9, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0], [0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 5, 2], [1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1], [14, 1, 14, 1, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1], [1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0], [2, 3, 8, 0, 1, 0, 0, 0, 0], [1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1], [1, 0, 0, 0, 10, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0], [0, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 1, 0], [0, 0, 0, 0, 9, 1, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 1], [0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0], [0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2], [2, 1, 0, 5, 0, 1, 0, 0, 0], [29, 1, 10, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0], [0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0], [0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 5, 0], [0, 0, 0, 1, 4, 0, 0, 0, 0], [1, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0], [2, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0], [1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0], [1, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0], [1, 0, 0, 5, 17, 20, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0], [1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 2, 2], [0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0], [1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1], [0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0], [1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0], [1, 5, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 1], [0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 3, 0], [0, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0], [0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0], [0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2], [0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0], [0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [1, 0, 2, 0, 0, 6, 0, 0, 0], [0, 2, 0, 7, 0, 0, 0, 2, 0], [0, 0, 0, 0, 5, 2, 0, 0, 0], [11, 12, 5, 13, 2, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1], [0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1], [0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0], [1, 0, 0, 0, 2, 0, 2, 0, 3], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0], [0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1], [0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 2, 2, 4, 0, 5, 1, 5, 0], [0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 5, 9, 5, 3], [2, 18, 0, 1, 0, 0, 21, 4, 4], [0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0], [1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0], [0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1], [0, 19, 2, 0, 2, 0, 3, 0, 0], [1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 1, 2, 0, 9, 1, 1, 1, 3], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0], [0, 2, 3, 1, 4, 0, 5, 0, 4], [0, 2, 1, 2, 0, 0, 1, 1, 1], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0], [0, 1, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0], [0, 0, 0, 9, 0, 0, 3, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 0, 0, 8, 10, 2], [0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0]], "columns": [{"id": "PC.354", "metadata": null}, {"id": "PC.355", "metadata": null}, {"id": "PC.356", "metadata": null}, {"id": "PC.481", "metadata": null}, {"id": "PC.593", "metadata": null}, {"id": "PC.607", "metadata": null}, {"id": "PC.634", "metadata": null}, {"id": "PC.635", "metadata": null}, {"id": "PC.636", "metadata": null}], "generated_by": "QIIME 1.4.0-dev, svn revision 2813", "matrix_type": "dense", "shape": [144, 9], "format_url": "http://biom-format.org", "date": "2012-03-14T12:55:51.942137", "type": "OTU table", "id": null, "matrix_element_type": "int"}
 
 
b'\\ No newline at end of file'