← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/qiime/trusty

« back to all changes in this revision

Viewing changes to qiime_test_data/alpha_rarefaction/arare_max100/rarefaction/rarefaction_10_2.biom

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Andreas Tille
  • Date: 2013-06-17 18:28:26 UTC
  • mfrom: (9.1.2 sid)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20130617182826-376az5ad080a0sfe
Tags: 1.7.0+dfsg-1
Upload preparations done for BioLinux to Debian

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
qiime_test_data/alpha_rarefaction/arare_max100/rarefaction/rarefaction_10_2.biom
 
1
{"rows": [{"id": "10", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "11", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "24", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria"]}}, {"id": "30", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales"]}}, {"id": "45", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "46", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Deferribacteres", "c__Deferribacteres", "o__Deferribacterales", "f__Deferribacteraceae"]}}, {"id": "54", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "56", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "58", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "59", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "61", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "62", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "66", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "68", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "79", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "82", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "91", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Tenericutes", "c__Mollicutes", "o__RF39", "f__"]}}, {"id": "93", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "104", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "108", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "116", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "117", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "122", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__"]}}, {"id": "129", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "146", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "158", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "160", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "165", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Bacilli", "o__Lactobacillales", "f__Lactobacillaceae"]}}, {"id": "169", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "182", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Tenericutes", "c__Erysipelotrichi", "o__Erysipelotrichales", "f__Erysipelotrichaceae"]}}, {"id": "190", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria"]}}, {"id": "201", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "203", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "211", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "214", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes"]}}, {"id": "218", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria"]}}, {"id": "232", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Tenericutes", "c__Erysipelotrichi", "o__Erysipelotrichales", "f__Erysipelotrichaceae"]}}, {"id": "235", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "244", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria"]}}, {"id": "246", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "260", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Prevotellaceae"]}}, {"id": "273", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "278", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "281", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "283", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "288", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "304", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Proteobacteria", "c__Epsilonproteobacteria", "o__Campylobacterales", "f__Helicobacteraceae"]}}, {"id": "305", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "306", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "311", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "318", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "323", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria"]}}, {"id": "347", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Ruminococcaceae"]}}, {"id": "350", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "351", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "354", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "355", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Bacilli", "o__Lactobacillales", "f__Lactobacillaceae"]}}, {"id": "363", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "367", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "378", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "379", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "392", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "396", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "397", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "400", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "401", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Clostridia", "o__Clostridiales", "f__Lachnospiraceae"]}}, {"id": "410", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Bacilli", "o__Turicibacterales", "f__Turicibacteraceae"]}}, {"id": "414", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}], "format": "Biological Observation Matrix 0.9.1-dev", "data": [[0, 3, 1.0], [1, 3, 1.0], [2, 1, 1.0], [3, 1, 1.0], [4, 5, 1.0], [5, 8, 1.0], [6, 0, 2.0], [7, 5, 1.0], [7, 7, 1.0], [8, 0, 1.0], [9, 2, 1.0], [9, 4, 1.0], [9, 5, 1.0], [10, 2, 1.0], [11, 7, 1.0], [12, 1, 1.0], [13, 3, 1.0], [14, 4, 1.0], [15, 0, 2.0], [16, 2, 1.0], [17, 6, 1.0], [18, 5, 1.0], [19, 8, 1.0], [20, 3, 1.0], [21, 3, 1.0], [22, 6, 1.0], [23, 2, 1.0], [24, 3, 1.0], [25, 1, 1.0], [26, 7, 1.0], [27, 2, 1.0], [27, 4, 2.0], [28, 2, 1.0], [29, 5, 1.0], [30, 1, 1.0], [31, 1, 1.0], [32, 2, 2.0], [32, 4, 4.0], [33, 8, 1.0], [34, 7, 1.0], [35, 7, 1.0], [36, 5, 1.0], [36, 7, 2.0], [37, 8, 1.0], [38, 4, 1.0], [39, 7, 1.0], [40, 1, 1.0], [41, 6, 2.0], [42, 7, 1.0], [43, 6, 1.0], [44, 8, 2.0], [45, 4, 1.0], [46, 5, 1.0], [47, 7, 1.0], [48, 2, 1.0], [49, 1, 1.0], [50, 3, 1.0], [51, 2, 1.0], [52, 0, 1.0], [53, 1, 1.0], [53, 3, 1.0], [54, 3, 1.0], [55, 8, 1.0], [56, 5, 1.0], [56, 6, 1.0], [57, 1, 1.0], [58, 6, 1.0], [59, 0, 1.0], [59, 8, 1.0], [60, 8, 1.0], [61, 6, 2.0], [62, 6, 1.0], [63, 5, 2.0], [64, 0, 1.0], [65, 8, 1.0], [66, 3, 1.0], [67, 0, 2.0]], "columns": [{"id": "PC.636", "metadata": null}, {"id": "PC.635", "metadata": null}, {"id": "PC.356", "metadata": null}, {"id": "PC.481", "metadata": null}, {"id": "PC.354", "metadata": null}, {"id": "PC.593", "metadata": null}, {"id": "PC.355", "metadata": null}, {"id": "PC.607", "metadata": null}, {"id": "PC.634", "metadata": null}], "generated_by": "QIIME 1.4.0-dev, svn revision 2809", "matrix_type": "sparse", "shape": [68, 9], "format_url": "http://biom-format.org", "date": "2012-03-14T11:38:44.207695", "type": "OTU table", "id": null, "matrix_element_type": "float"}
 
 
b'\\ No newline at end of file'