← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/qiime/trusty

« back to all changes in this revision

Viewing changes to qiime_test_data/core_diversity_analyses/core_output/bdiv_even20/weighted_unifrac_boxplots/SampleType_Stats.txt

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Andreas Tille
  • Date: 2013-06-17 18:28:26 UTC
  • mfrom: (9.1.2 sid)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20130617182826-376az5ad080a0sfe
Tags: 1.7.0+dfsg-1
Upload preparations done for BioLinux to Debian

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
qiime_test_data/core_diversity_analyses/core_output/bdiv_even20/weighted_unifrac_boxplots/SampleType_Stats.txt
 
1
# The tests of significance were performed using a two-sided Student's two-sample t-test.
 
2
# Alternative hypothesis: Group 1 mean != Group 2 mean
 
3
# The nonparametric p-values were calculated using 999 Monte Carlo permutations.
 
4
# The nonparametric p-values contain the correct number of significant digits.
 
5
# Entries marked with "N/A" could not be calculated because at least one of the groups
 
6
# of distances was empty, both groups each contained only a single distance, or
 
7
# the test could not be performed (e.g. no variance in groups with the same mean).
 
8
Group 1 Group 2 t statistic     Parametric p-value      Parametric p-value (Bonferroni-corrected)       Nonparametric p-value   Nonparametric p-value (Bonferroni-corrected)
 
9
All within SampleType   All between SampleType  -5.88620906456  1.21017918172e-06       6.17191382679e-05       0.001   0.051
 
10
All within SampleType   Tongue vs. Tongue       -0.00387968153685       0.997012720117  1       1.000   1.000
 
11
All within SampleType   feces vs. feces 0.846324513582  0.413930729877  1       0.480   1.000
 
12
All within SampleType   L_palm vs. L_palm       -2.12006657727  0.0717144482062 1       0.195   1.000
 
13
All within SampleType   Tongue vs. feces        -16.6148505595  1.30633494311e-10       6.66230820988e-09       0.001   0.051
 
14
All within SampleType   Tongue vs. Other        -15.5743072379  2.87873011175e-07       1.46815235699e-05       0.018   0.918
 
15
All within SampleType   Tongue vs. L_palm       -6.83779578828  4.52562698391e-05       0.00230806976179        0.005   0.255
 
16
All within SampleType   feces vs. Other -22.4795761905  6.82667441289e-10       3.48160395057e-08       0.002   0.102
 
17
All within SampleType   feces vs. L_palm        -9.47841133851  1.80620161578e-07       9.21162824048e-06       0.001   0.051
 
18
All within SampleType   Other vs. L_palm        -15.5743072379  2.87873011175e-07       1.46815235699e-05       0.016   0.816
 
19
All between SampleType  Tongue vs. Tongue       2.09077201664   0.046093682638  1       0.041   1.000
 
20
All between SampleType  feces vs. feces 5.42427720226   5.78024241555e-06       0.000294792363193       0.001   0.051
 
21
All between SampleType  L_palm vs. L_palm       1.40456176363   0.171551902435  1       0.296   1.000
 
22
All between SampleType  Tongue vs. feces        0.425435999984  0.673199711433  1       0.670   1.000
 
23
All between SampleType  Tongue vs. Other        -2.02351893269  0.0526589209653 1       0.081   1.000
 
24
All between SampleType  Tongue vs. L_palm       1.44886308737   0.157748699209  1       0.151   1.000
 
25
All between SampleType  feces vs. Other -2.86806850131  0.00748919469177        0.38194892928   0.009   0.459
 
26
All between SampleType  feces vs. L_palm        2.59805691168   0.0137602007178 0.701770236606  0.009   0.459
 
27
All between SampleType  Other vs. L_palm        -2.02351893269  0.0526589209653 1       0.095   1.000
 
28
Tongue vs. Tongue       feces vs. feces 0.750044426823  0.486999751717  1       0.637   1.000
 
29
Tongue vs. Tongue       L_palm vs. L_palm       N/A     N/A     N/A     N/A     N/A
 
30
Tongue vs. Tongue       Tongue vs. feces        -14.5276177979  1.74708244559e-06       8.91012047252e-05       0.084   1.000
 
31
Tongue vs. Tongue       Tongue vs. Other        -inf    0.0     0.0     0.358   1.000
 
32
Tongue vs. Tongue       Tongue vs. L_palm       -3.30789904413  0.0454635935925 1       0.204   1.000
 
33
Tongue vs. Tongue       feces vs. Other -inf    0.0     0.0     0.201   1.000
 
34
Tongue vs. Tongue       feces vs. L_palm        -6.42184427323  0.000359737131105       0.0183465936864 0.077   1.000
 
35
Tongue vs. Tongue       Other vs. L_palm        -inf    0.0     0.0     0.306   1.000
 
36
feces vs. feces L_palm vs. L_palm       -5.1852610507   0.00350987640246        0.179003696525  0.140   1.000
 
37
feces vs. feces Tongue vs. feces        -28.5454292502  2.12121429245e-12       1.08181928915e-10       0.001   0.051
 
38
feces vs. feces Tongue vs. Other        -34.0548551617  4.2691984701e-08        2.17729121975e-06       0.034   1.000
 
39
feces vs. feces Tongue vs. L_palm       -9.07462749783  1.74389404784e-05       0.0008893859644 0.004   0.204
 
40
feces vs. feces feces vs. Other -49.740299639   2.95463210949e-11       1.50686237584e-09       0.004   0.204
 
41
feces vs. feces feces vs. L_palm        -14.8522463648  4.35201948026e-09       2.21952993493e-07       0.002   0.102
 
42
feces vs. feces Other vs. L_palm        -34.0548551617  4.2691984701e-08        2.17729121975e-06       0.043   1.000
 
43
L_palm vs. L_palm       Tongue vs. feces        -9.39190028367  3.2302713793e-05        0.00164743840344        0.091   1.000
 
44
L_palm vs. L_palm       Tongue vs. Other        -inf    0.0     0.0     0.345   1.000
 
45
L_palm vs. L_palm       Tongue vs. L_palm       -1.6427878515   0.198969548124  1       0.424   1.000
 
46
L_palm vs. L_palm       feces vs. Other -inf    0.0     0.0     0.204   1.000
 
47
L_palm vs. L_palm       feces vs. L_palm        -2.67183775137  0.0319145512483 1       0.080   1.000
 
48
L_palm vs. L_palm       Other vs. L_palm        -inf    0.0     0.0     0.323   1.000
 
49
Tongue vs. feces        Tongue vs. Other        -16.9467769849  1.49126677953e-07       7.60546057561e-06       0.010   0.510
 
50
Tongue vs. feces        Tongue vs. L_palm       4.14358265302   0.00200037577225        0.102019164385  0.006   0.306
 
51
Tongue vs. feces        feces vs. Other -24.4605656354  2.97467043382e-10       1.51708192125e-08       0.003   0.153
 
52
Tongue vs. feces        feces vs. L_palm        10.1419474027   7.84273105284e-08       3.99979283695e-06       0.001   0.051
 
53
Tongue vs. feces        Other vs. L_palm        -16.9467769849  1.49126677953e-07       7.60546057561e-06       0.007   0.357
 
54
Tongue vs. Other        Tongue vs. L_palm       7.80109946447   0.00145676544067        0.074295037474  0.077   1.000
 
55
Tongue vs. Other        feces vs. Other N/A     N/A     N/A     N/A     N/A
 
56
Tongue vs. Other        feces vs. L_palm        18.3780331114   7.91076092027e-08       4.03448806934e-06       0.015   0.765
 
57
Tongue vs. Other        Other vs. L_palm        N/A     N/A     N/A     N/A     N/A
 
58
Tongue vs. L_palm       feces vs. Other -11.7016491967  2.34911604866e-05       0.00119804918481        0.038   1.000
 
59
Tongue vs. L_palm       feces vs. L_palm        1.23760825597   0.244132251286  1       0.204   1.000
 
60
Tongue vs. L_palm       Other vs. L_palm        -7.80109946447  0.00145676544067        0.074295037474  0.056   1.000
 
61
feces vs. Other feces vs. L_palm        26.5264059102   1.33728755302e-10       6.82016652039e-09       0.004   0.204
 
62
feces vs. Other Other vs. L_palm        N/A     N/A     N/A     N/A     N/A
 
63
feces vs. L_palm        Other vs. L_palm        -18.3780331114  7.91076092027e-08       4.03448806934e-06       0.016   0.816