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Viewing changes to qiime_test_data/pick_otus/blast_picked_otus_prebuilt_db/seqs_otus.log

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Andreas Tille
  • Date: 2013-06-17 18:28:26 UTC
  • mfrom: (9.1.2 sid)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20130617182826-376az5ad080a0sfe
Tags: 1.7.0+dfsg-1
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Lines of Context:
qiime_test_data/pick_otus/blast_picked_otus_prebuilt_db/seqs_otus.log
 
1
OtuPicker parameters:
 
2
Similarity:0.97
 
3
blast_program:blastn
 
4
is_protein:False
 
5
max_e_value:1e-10
 
6
min_aligned_percent:0.5
 
7
seqs_per_blast_run:1000
 
8
Blast database: refseqs.fasta
 
9
Num OTUs: 2
 
10
Result path: blast_picked_otus_prebuilt_db//seqs_otus.txt
 
11
Num failures: 149
 
12
Failures: PC.354_296    PC.354_299      PC.354_3        PC.354_303      PC.354_308      PC.354_334      PC.354_344      PC.354_346      PC.354_358      PC.354_359      PC.354_370      PC.354_378      PC.354_387      PC.354_411      PC.354_412      PC.354_458      PC.355_291      PC.355_300      PC.355_301      PC.355_324      PC.355_327      PC.355_328      PC.355_353      PC.355_361      PC.355_372      PC.355_374      PC.355_375      PC.355_382      PC.355_384      PC.355_385      PC.355_399      PC.355_403      PC.355_413      PC.355_459      PC.355_460      PC.355_544      PC.355_545      PC.355_546      PC.356_295      PC.356_325      PC.356_336      PC.356_341      PC.356_347      PC.356_355      PC.356_363      PC.356_406      PC.356_410      PC.356_449      PC.356_451      PC.356_453      PC.356_456      PC.356_542      PC.356_543      PC.481_292      PC.481_304      PC.481_307      PC.481_317      PC.481_321      PC.481_322      PC.481_326      PC.481_329      PC.481_338      PC.481_357      PC.481_371      PC.481_377      PC.481_397      PC.481_418      PC.481_455      PC.593_313      PC.593_314      PC.593_342      PC.593_343      PC.593_369      PC.593_400      PC.593_408      PC.593_414      PC.593_450      PC.593_454      PC.593_547      PC.607_297      PC.607_302      PC.607_312      PC.607_323      PC.607_330      PC.607_332      PC.607_348      PC.607_352      PC.607_356      PC.607_360      PC.607_365      PC.607_380      PC.607_391      PC.607_395      PC.607_401      PC.607_405      PC.607_416      PC.607_452      PC.607_457      PC.607_541      PC.634_1        PC.634_2        PC.634_60       PC.635_305      PC.635_306      PC.635_315      PC.635_316      PC.635_319      PC.635_320      PC.635_333      PC.635_345      PC.635_350      PC.635_364      PC.635_367      PC.635_368      PC.635_381      PC.635_383      PC.635_386      PC.635_388      PC.635_390      PC.635_394      PC.635_398      PC.635_404      PC.635_461      PC.636_294      PC.636_298      PC.636_309      PC.636_310      PC.636_311      PC.636_318      PC.636_331      PC.636_335      PC.636_337      PC.636_339      PC.636_340      PC.636_349      PC.636_351      PC.636_354      PC.636_366      PC.636_373      PC.636_376      PC.636_389      PC.636_392      PC.636_396      PC.636_402      PC.636_407      PC.636_409      PC.636_415      PC.636_417      PC.636_61