← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/trusty/qiime/trusty

« back to all changes in this revision

Viewing changes to qiime_test_data/split_otu_table_by_taxonomy/L3/otu_table_Root_k__Bacteria_p__Bacteroidetes.biom

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Andreas Tille
  • Date: 2013-06-17 18:28:26 UTC
  • mfrom: (9.1.2 sid)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20130617182826-376az5ad080a0sfe
Tags: 1.7.0+dfsg-1
Upload preparations done for BioLinux to Debian

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
qiime_test_data/split_otu_table_by_taxonomy/L3/otu_table_Root_k__Bacteria_p__Bacteroidetes.biom
 
1
{"rows": [{"id": "2", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "3", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "5", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "20", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "27", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "28", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "40", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "54", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "56", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "57", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "59", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "63", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "64", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "69", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "72", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "74", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "75", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "82", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "88", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "96", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "99", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "101", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "103", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "108", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "113", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "120", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "121", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "134", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "137", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "138", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "149", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "151", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "154", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales"]}}, {"id": "155", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "157", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "158", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "163", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "164", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "170", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "181", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "201", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "205", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "211", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "212", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "215", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "219", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "224", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "225", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "226", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "234", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "235", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "238", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "242", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "246", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "247", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "249", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "260", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Prevotellaceae"]}}, {"id": "262", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "266", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "269", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "273", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "283", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "285", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "310", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "311", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "315", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "324", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "337", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "339", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "341", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "344", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "349", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "360", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "363", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "370", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "378", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Rikenellaceae"]}}, {"id": "379", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae"]}}, {"id": "383", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "390", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "396", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "397", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "399", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Porphyromonadaceae"]}}, {"id": "400", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}, {"id": "414", "metadata": {"taxonomy": ["Root", "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__"]}}], "format": "Biological Observation Matrix 0.9.1-dev", "data": [[0, 0, 1.0], [1, 2, 1.0], [2, 0, 1.0], [2, 1, 1.0], [3, 8, 1.0], [4, 7, 2.0], [5, 0, 1.0], [6, 6, 1.0], [7, 0, 37.0], [7, 1, 10.0], [7, 3, 1.0], [7, 8, 4.0], [8, 0, 5.0], [8, 1, 4.0], [8, 2, 1.0], [8, 3, 2.0], [8, 4, 1.0], [8, 5, 1.0], [8, 6, 3.0], [8, 7, 9.0], [8, 8, 2.0], [9, 5, 1.0], [10, 0, 1.0], [10, 1, 1.0], [10, 2, 10.0], [10, 3, 2.0], [10, 4, 2.0], [10, 5, 24.0], [10, 6, 1.0], [11, 2, 1.0], [12, 6, 1.0], [13, 6, 1.0], [14, 0, 2.0], [14, 1, 3.0], [14, 8, 2.0], [15, 0, 1.0], [15, 1, 4.0], [15, 5, 2.0], [15, 7, 2.0], [15, 8, 1.0], [16, 7, 5.0], [17, 0, 19.0], [17, 1, 2.0], [17, 3, 1.0], [17, 8, 1.0], [18, 5, 1.0], [19, 0, 1.0], [20, 1, 1.0], [20, 3, 1.0], [20, 8, 3.0], [21, 7, 1.0], [22, 0, 1.0], [23, 8, 5.0], [24, 5, 1.0], [25, 1, 1.0], [25, 8, 2.0], [26, 0, 1.0], [26, 6, 1.0], [27, 1, 1.0], [28, 8, 1.0], [29, 8, 1.0], [30, 0, 1.0], [31, 0, 2.0], [31, 1, 5.0], [31, 3, 1.0], [31, 8, 1.0], [32, 0, 1.0], [33, 8, 1.0], [34, 8, 1.0], [35, 1, 1.0], [36, 0, 1.0], [36, 1, 1.0], [37, 0, 1.0], [37, 1, 1.0], [38, 5, 1.0], [39, 5, 9.0], [39, 7, 1.0], [40, 1, 3.0], [40, 8, 1.0], [41, 1, 1.0], [42, 8, 13.0], [43, 3, 2.0], [44, 0, 1.0], [45, 1, 1.0], [45, 2, 2.0], [46, 0, 1.0], [47, 3, 1.0], [47, 4, 2.0], [47, 6, 2.0], [48, 2, 1.0], [48, 4, 1.0], [49, 0, 1.0], [50, 1, 1.0], [50, 8, 2.0], [51, 1, 1.0], [52, 8, 1.0], [53, 0, 2.0], [53, 1, 2.0], [53, 7, 7.0], [54, 1, 1.0], [54, 7, 1.0], [55, 7, 1.0], [55, 8, 1.0], [56, 1, 1.0], [57, 4, 1.0], [58, 2, 1.0], [59, 0, 1.0], [60, 0, 1.0], [60, 2, 3.0], [60, 3, 2.0], [60, 4, 1.0], [60, 6, 5.0], [61, 8, 5.0], [62, 8, 1.0], [63, 3, 2.0], [64, 1, 1.0], [65, 0, 1.0], [65, 1, 1.0], [65, 8, 1.0], [66, 0, 1.0], [67, 1, 1.0], [68, 5, 2.0], [69, 0, 1.0], [70, 1, 1.0], [71, 5, 3.0], [72, 1, 1.0], [73, 1, 1.0], [74, 1, 5.0], [74, 2, 2.0], [74, 3, 4.0], [74, 4, 1.0], [74, 6, 2.0], [74, 7, 5.0], [74, 8, 1.0], [75, 0, 3.0], [75, 1, 5.0], [75, 7, 5.0], [75, 8, 9.0], [76, 0, 4.0], [76, 1, 4.0], [76, 3, 1.0], [76, 4, 2.0], [76, 6, 18.0], [76, 8, 21.0], [77, 6, 2.0], [77, 7, 1.0], [78, 2, 1.0], [79, 2, 1.0], [79, 6, 2.0], [80, 0, 3.0], [80, 1, 1.0], [80, 2, 2.0], [80, 5, 9.0], [80, 6, 1.0], [80, 7, 1.0], [80, 8, 1.0], [81, 8, 2.0], [82, 0, 4.0], [82, 2, 3.0], [82, 3, 1.0], [82, 5, 4.0], [82, 6, 2.0], [82, 8, 5.0], [83, 0, 2.0], [83, 1, 10.0], [83, 8, 8.0]], "columns": [{"id": "PC.636", "metadata": null}, {"id": "PC.635", "metadata": null}, {"id": "PC.356", "metadata": null}, {"id": "PC.481", "metadata": null}, {"id": "PC.354", "metadata": null}, {"id": "PC.593", "metadata": null}, {"id": "PC.355", "metadata": null}, {"id": "PC.607", "metadata": null}, {"id": "PC.634", "metadata": null}], "generated_by": "QIIME 1.4.0-dev, svn revision 2835", "matrix_type": "sparse", "shape": [84, 9], "format_url": "http://biom-format.org", "date": "2012-03-14T18:43:57.289513", "type": "OTU table", "id": null, "matrix_element_type": "float"}
 
 
b'\\ No newline at end of file'