~ubuntu-branches/debian/sid/lammps/sid

« back to all changes in this revision

Viewing changes to doc/compute.html

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Anton Gladky
  • Date: 2015-04-29 23:44:49 UTC
  • mfrom: (5.1.3 experimental)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20150429234449-mbhy9utku6hp6oq8
Tags: 0~20150313.gitfa668e1-1
Upload into unstable.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
180
180
page</A>.
181
181
</P>
182
182
<UL><LI><A HREF = "compute_bond_local.html">angle/local</A> - theta and energy of each angle
183
 
<LI><A HREF = "compute_atom_molecule.html">atom/molecule</A> - sum per-atom properties for each molecule
184
183
<LI><A HREF = "compute_body_local.html">body/local</A> - attributes of body sub-particles
185
184
<LI><A HREF = "compute_bond_local.html">bond/local</A> - distance and energy of each bond
186
185
<LI><A HREF = "compute_centro_atom.html">centro/atom</A> - centro-symmetry parameter for each atom
187
186
<LI><A HREF = "compute_cluster_atom.html">cluster/atom</A> - cluster ID for each atom
188
187
<LI><A HREF = "compute_cna_atom.html">cna/atom</A> - common neighbor analysis (CNA) for each atom
189
188
<LI><A HREF = "compute_com.html">com</A> - center-of-mass of group of atoms
190
 
<LI><A HREF = "compute_com_molecule.html">com/molecule</A> - center-of-mass for each molecule
 
189
<LI><A HREF = "compute_com_chunk.html">com/chunk</A> - center-of-mass for each chunk
191
190
<LI><A HREF = "compute_contact_atom.html">contact/atom</A> - contact count for each spherical particle
192
191
<LI><A HREF = "compute_coord_atom.html">coord/atom</A> - coordination number for each atom
193
192
<LI><A HREF = "compute_damage_atom.html">damage/atom</A> - Peridynamic damage for each atom
201
200
<LI><A HREF = "compute_event_displace.html">event/displace</A> - detect event on atom displacement
202
201
<LI><A HREF = "compute_group_group.html">group/group</A> - energy/force between two groups of atoms
203
202
<LI><A HREF = "compute_gyration.html">gyration</A> - radius of gyration of group of atoms
204
 
<LI><A HREF = "compute_gyration_molecule.html">gyration/molecule</A> - radius of gyration for each molecule
 
203
<LI><A HREF = "compute_gyration_chunk.html">gyration/chunk</A> - radius of gyration for each chunk
205
204
<LI><A HREF = "compute_heat_flux.html">heat/flux</A> - heat flux through a group of atoms
206
205
<LI><A HREF = "compute_improper_local.html">improper/local</A> - angle of each improper
207
 
<LI><A HREF = "compute_inertia_molecule.html">inertia/molecule</A> - inertia tensor for each molecule
 
206
<LI><A HREF = "compute_inertia_chunk.html">inertia/chunk</A> - inertia tensor for each chunk
208
207
<LI><A HREF = "compute_ke.html">ke</A> - translational kinetic energy
209
208
<LI><A HREF = "compute_ke_atom.html">ke/atom</A> - kinetic energy for each atom
210
209
<LI><A HREF = "compute_ke_rigid.html">ke/rigid</A> - translational kinetic energy of rigid bodies
211
210
<LI><A HREF = "compute_msd.html">msd</A> - mean-squared displacement of group of atoms
212
 
<LI><A HREF = "compute_msd_molecule.html">msd/molecule</A> - mean-squared displacement for each molecule
 
211
<LI><A HREF = "compute_msd_chunk.html">msd/chunk</A> - mean-squared displacement for each chunk
213
212
<LI><A HREF = "compute_msd_nongauss.html">msd/nongauss</A> - MSD and non-Gaussian parameter of group of atoms
214
213
<LI><A HREF = "compute_pair.html">pair</A> - values computed by a pair style
215
214
<LI><A HREF = "compute_pair_local.html">pair/local</A> - distance/energy/force of each pairwise interaction
219
218
<LI><A HREF = "compute_pressure.html">pressure</A> - total pressure and pressure tensor
220
219
<LI><A HREF = "compute_property_atom.html">property/atom</A> - convert atom attributes to per-atom vectors/arrays
221
220
<LI><A HREF = "compute_property_local.html">property/local</A> - convert local attributes to localvectors/arrays
222
 
<LI><A HREF = "compute_property_molecule.html">property/molecule</A> - convert molecule attributes to localvectors/arrays
 
221
<LI><A HREF = "compute_property_chunk.html">property/chunk</A> - extract various per-chunk attributes
223
222
<LI><A HREF = "compute_rdf.html">rdf</A> - radial distribution function g(r) histogram of group of atoms
224
223
<LI><A HREF = "compute_reduce.html">reduce</A> - combine per-atom quantities into a single global value
225
224
<LI><A HREF = "compute_reduce.html">reduce/region</A> - same as compute reduce, within a region
226
225
<LI><A HREF = "compute_slice.html">slice</A> - extract values from global vector or array
 
226
<LI><A HREF = "compute_sna.html">sna/atom</A> - calculate bispectrum coefficients for each atom
 
227
<LI><A HREF = "compute_sna.html">snad/atom</A> - derivative of bispectrum coefficients for each atom
 
228
<LI><A HREF = "compute_sna.html">snav/atom</A> - virial contribution from bispectrum coefficients for each atom
227
229
<LI><A HREF = "compute_stress_atom.html">stress/atom</A> - stress tensor for each atom
228
230
<LI><A HREF = "compute_temp.html">temp</A> - temperature of group of atoms
229
231
<LI><A HREF = "compute_temp_asphere.html">temp/asphere</A> - temperature of aspherical particles
 
232
<LI><A HREF = "compute_temp_chunk.html">temp/chunk</A> - temperature of each chunk
230
233
<LI><A HREF = "compute_temp_com.html">temp/com</A> - temperature after subtracting center-of-mass velocity
231
234
<LI><A HREF = "compute_temp_deform.html">temp/deform</A> - temperature excluding box deformation velocity
232
235
<LI><A HREF = "compute_temp_partial.html">temp/partial</A> - temperature excluding one or more dimensions of velocity
235
238
<LI><A HREF = "compute_temp_region.html">temp/region</A> - temperature of a region of atoms
236
239
<LI><A HREF = "compute_temp_sphere.html">temp/sphere</A> - temperature of spherical particles
237
240
<LI><A HREF = "compute_ti.html">ti</A> - thermodyanmic integration free energy values
 
241
<LI><A HREF = "compute_torque_chunk.html">torque/chunk</A> - torque applied on each chunk
238
242
<LI><A HREF = "compute_vacf.html">vacf</A> - velocity-autocorrelation function of group of atoms
 
243
<LI><A HREF = "compute_vcm_chunk.html">vcm/chunk</A> - velocity of center-of-mass for each chunk
239
244
<LI><A HREF = "compute_voronoi_atom.html">voronoi/atom</A> - Voronoi volume and neighbors for each atom 
240
245
</UL>
241
246
<P>There are also additional compute styles submitted by users which are