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Viewing changes to tools/moltemplate/examples/coarse_grained_examples/abstract_2bead_heteropolymer/run.in.nvt

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Anton Gladky
  • Date: 2015-04-29 23:44:49 UTC
  • mfrom: (5.1.3 experimental)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20150429234449-mbhy9utku6hp6oq8
Tags: 0~20150313.gitfa668e1-1
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tools/moltemplate/examples/coarse_grained_examples/abstract_2bead_heteropolymer/run.in.nvt
 
1
# -- Init Section --
 
2
 
 
3
include system.in.init
 
4
 
 
5
# -- Atom Definition Section --
 
6
 
 
7
read_data system.data
 
8
 
 
9
# -- Settings Section --
 
10
 
 
11
include system.in.settings
 
12
 
 
13
# -- Run Section --
 
14
 
 
15
 
 
16
timestep        2.0
 
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dump            1 all custom 2500 traj_nvt.lammpstrj id mol type x y z ix iy iz
 
18
 
 
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# To use Langevin dynamics in LAMMPS you need both "fix langevin" and "fix nve".
 
20
# (See http://lammps.sandia.gov/doc/fix_langevin.html for details.)
 
21
 
 
22
fix fxlan all langevin 300.0 300.0 5000.0 48279
 
23
fix fxnve all nve
 
24
 
 
25
 
 
26
thermo_style    custom step temp pe etotal press vol epair ebond eangle edihed
 
27
thermo          2500  # time interval for printing out "thermo" data
 
28
 
 
29
run             20000000
 
30
 
 
31
write_data  system_after_nvt.data
 
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