← Back to branch summary

~ubuntu-branches/debian/sid/lammps/sid

« back to all changes in this revision

Viewing changes to doc/fix_nvt_sllod.html

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Anton Gladky
  • Date: 2015-04-29 23:44:49 UTC
  • mfrom: (5.1.3 experimental)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20150429234449-mbhy9utku6hp6oq8
Tags: 0~20150313.gitfa668e1-1
Upload into unstable.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
doc/fix_nvt_sllod.html
56
56
velocity profile created by fix nvt/sllod.  LAMMPS will give an
57
57
error if this setting is not consistent.
58
58
</P>
59
 
<P>The SLLOD equations of motion coupled to a Nose/Hoover thermostat are
60
 
discussed in <A HREF = "#Tuckerman">(Tuckerman)</A> (eqs 4 and 5), which is what is
61
 
implemented in LAMMPS in a velocity Verlet formulation.
 
59
<P>The SLLOD equations of motion, originally proposed by Hoover and Ladd
 
60
(see <A HREF = "#Evans">(Evans and Morriss)</A>), were proven to be equivalent to
 
61
Newton's equations of motion for shear flow by <A HREF = "#Evans">(Evans and
 
62
Morriss)</A>. They were later shown to generate the desired
 
63
velocity gradient and the correct production of work by stresses for
 
64
all forms of homogeneous flow by <A HREF = "#Daivis">(Daivis and Todd)</A>.  As
 
65
implemented in LAMMPS, they are coupled to a Nose/Hoover chain
 
66
thermostat in a velocity Verlet formulation, closely following the
 
67
implementation used for the <A HREF = "fix_nh.html">fix nvt</A> command.
62
68
</P>
63
69
<P>Additional parameters affecting the thermostat are specified by
64
70
keywords and values documented with the <A HREF = "fix_nh.html">fix nvt</A>
103
109
</P>
104
110
<HR>
105
111
 
106
 
<P>Styles with a <I>cuda</I>, <I>gpu</I>, <I>omp</I>, or <I>opt</I> suffix are functionally
107
 
the same as the corresponding style without the suffix.  They have
108
 
been optimized to run faster, depending on your available hardware, as
109
 
discussed in <A HREF = "Section_accelerate.html">Section_accelerate</A> of the
110
 
manual.  The accelerated styles take the same arguments and should
111
 
produce the same results, except for round-off and precision issues.
 
112
<P>Styles with a <I>cuda</I>, <I>gpu</I>, <I>intel</I>, <I>kk</I>, <I>omp</I>, or <I>opt</I> suffix are
 
113
functionally the same as the corresponding style without the suffix.
 
114
They have been optimized to run faster, depending on your available
 
115
hardware, as discussed in <A HREF = "Section_accelerate.html">Section_accelerate</A>
 
116
of the manual.  The accelerated styles take the same arguments and
 
117
should produce the same results, except for round-off and precision
 
118
issues.
112
119
</P>
113
 
<P>These accelerated styles are part of the USER-CUDA, GPU, USER-OMP and OPT
114
 
packages, respectively.  They are only enabled if LAMMPS was built with
115
 
those packages.  See the <A HREF = "Section_start.html#start_3">Making LAMMPS</A>
116
 
section for more info.
 
120
<P>These accelerated styles are part of the USER-CUDA, GPU, USER-INTEL,
 
121
KOKKOS, USER-OMP and OPT packages, respectively.  They are only
 
122
enabled if LAMMPS was built with those packages.  See the <A HREF = "Section_start.html#start_3">Making
 
123
LAMMPS</A> section for more info.
117
124
</P>
118
125
<P>You can specify the accelerated styles explicitly in your input script
119
126
by including their suffix, or you can use the <A HREF = "Section_start.html#start_7">-suffix command-line
169
176
</P>
170
177
<HR>
171
178
 
172
 
<A NAME = "Tuckerman"></A>
173
 
 
174
 
<P><B>(Tuckerman)</B> Tuckerman, Mundy, Balasubramanian, Klein, J Chem Phys,
175
 
106, 5615 (1997).
 
179
<A NAME = "Evans"></A>
 
180
 
 
181
<P><B>(Evans and Morriss)</B> Evans and Morriss, Phys Rev A, 30, 1528 (1984).
 
182
</P>
 
183
<A NAME = "Daivis"></A>
 
184
 
 
185
<P><B>(Daivis and Todd)</B> Daivis and Todd, J Chem Phys, 124, 194103 (2006).
176
186
</P>
177
187
</HTML>