← Back to branch summary

~ubuntu-branches/debian/sid/lammps/sid

« back to all changes in this revision

Viewing changes to doc/dihedral_quadratic.txt

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Anton Gladky
  • Date: 2015-04-29 23:44:49 UTC
  • mfrom: (5.1.3 experimental)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20150429234449-mbhy9utku6hp6oq8
Tags: 0~20150313.gitfa668e1-1
Upload into unstable.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
doc/dihedral_quadratic.txt
24
24
 
25
25
:c,image(Eqs/dihedral_quadratic.jpg)
26
26
 
27
 
This dihedral potential can be used to keep a dihedral in a predefined value.
28
 
 
29
 
The following coefficients must be defined for each dihedral type via the
30
 
"dihedral_coeff"_dihedral_coeff.html command as in the example above, or in
31
 
the data file or restart files read by the "read_data"_read_data.html
32
 
or "read_restart"_read_restart.html commands:
33
 
 
34
 
K (energy)
 
27
This dihedral potential can be used to keep a dihedral in a predefined
 
28
value (cis=zero, right-hand convention is used).
 
29
 
 
30
The following coefficients must be defined for each dihedral type via
 
31
the "dihedral_coeff"_dihedral_coeff.html command as in the example
 
32
above, or in the data file or restart files read by the
 
33
"read_data"_read_data.html or "read_restart"_read_restart.html
 
34
commands:
 
35
 
 
36
K (energy/radian^2) 
35
37
phi0 (degrees) :ul
36
38
 
37
39
:line
38
40
 
39
 
Styles with a {cuda}, {gpu}, {omp}, or {opt} suffix are functionally
40
 
the same as the corresponding style without the suffix.  They have
41
 
been optimized to run faster, depending on your available hardware, as
42
 
discussed in "Section_accelerate"_Section_accelerate.html of the
43
 
manual.  The accelerated styles take the same arguments and should
44
 
produce the same results, except for round-off and precision issues.
 
41
Styles with a {cuda}, {gpu}, {intel}, {kk}, {omp}, or {opt} suffix are
 
42
functionally the same as the corresponding style without the suffix.
 
43
They have been optimized to run faster, depending on your available
 
44
hardware, as discussed in "Section_accelerate"_Section_accelerate.html
 
45
of the manual.  The accelerated styles take the same arguments and
 
46
should produce the same results, except for round-off and precision
 
47
issues.
45
48
 
46
 
These accelerated styles are part of the USER-CUDA, GPU, USER-OMP and OPT
47
 
packages, respectively.  They are only enabled if LAMMPS was built with
48
 
those packages.  See the "Making LAMMPS"_Section_start.html#start_3
49
 
section for more info.
 
49
These accelerated styles are part of the USER-CUDA, GPU, USER-INTEL,
 
50
KOKKOS, USER-OMP and OPT packages, respectively.  They are only
 
51
enabled if LAMMPS was built with those packages.  See the "Making
 
52
LAMMPS"_Section_start.html#start_3 section for more info.
50
53
 
51
54
You can specify the accelerated styles explicitly in your input script
52
55
by including their suffix, or you can use the "-suffix command-line