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Viewing changes to tools/moltemplate/examples/CG_biomolecules/vesicle_Brannigan2005+Bellesia2010/README_run.sh

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Anton Gladky
  • Date: 2015-04-29 23:44:49 UTC
  • mfrom: (5.1.3 experimental)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20150429234449-mbhy9utku6hp6oq8
Tags: 0~20150313.gitfa668e1-1
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tools/moltemplate/examples/CG_biomolecules/vesicle_Brannigan2005+Bellesia2010/README_run.sh
1
 
# --- Running LAMMPS ---
2
 
#  -- Prerequisites: --
3
 
# The "run.in.nvt" file is a LAMMPS input script containing
4
 
# references to the input scripts and data files
5
 
# you hopefully have created earlier with MOLTEMPLATE and PACKMOL:
6
 
#   system.in.init, system.in.settings, system.in.coords, system.data, 
7
 
#   and table_int.dat
8
 
# If not, carry out the instructions in "README_setup.sh".
9
 
#
10
 
#  -- Instructions: --
11
 
# If "lmp_linux" is the name of the command you use to invoke lammps,
12
 
# then you would run lammps on these files this way:
13
 
 
14
 
lmp_linux -i run.in.min  # Minimize the system (important, and very slow)
15
 
 
16
 
lmp_linux -i run.in.nvt  # Run a simulation at constant volume
17
 
 
18
 
 
19
 
 
20
 
# If you have compiled the MPI version of lammps, you can run lammps in parallel
21
 
#mpirun -np 4 lmp_linux -i run.in.min
22
 
#or
23
 
#mpirun -np 4 lmp_linux -i run.in.nvt
24
 
# (assuming you have 4 processors available)