← Back to branch summary

~ubuntu-branches/debian/sid/lammps/sid

« back to all changes in this revision

Viewing changes to examples/accelerate/log.lj.1Feb14.kokkos.omp.1

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Anton Gladky
  • Date: 2015-04-29 23:44:49 UTC
  • mfrom: (5.1.3 experimental)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20150429234449-mbhy9utku6hp6oq8
Tags: 0~20150313.gitfa668e1-1
Upload into unstable.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
examples/accelerate/log.lj.1Feb14.kokkos.omp.1
 
1
LAMMPS (27 May 2014)
 
2
KOKKOS mode is enabled (../lammps.cpp:468)
 
3
  using 1 OpenMP thread(s) per MPI task
 
4
# 3d Lennard-Jones melt
 
5
 
 
6
variable        x index 1
 
7
variable        y index 1
 
8
variable        z index 1
 
9
 
 
10
variable        xx equal 20*$x
 
11
variable        xx equal 20*1
 
12
variable        yy equal 20*$y
 
13
variable        yy equal 20*1
 
14
variable        zz equal 20*$z
 
15
variable        zz equal 20*1
 
16
 
 
17
package         kokkos neigh half
 
18
 
 
19
units           lj
 
20
atom_style      atomic
 
21
 
 
22
lattice         fcc 0.8442
 
23
Lattice spacing in x,y,z = 1.6796 1.6796 1.6796
 
24
region          box block 0 ${xx} 0 ${yy} 0 ${zz}
 
25
region          box block 0 20 0 ${yy} 0 ${zz}
 
26
region          box block 0 20 0 20 0 ${zz}
 
27
region          box block 0 20 0 20 0 20
 
28
create_box      1 box
 
29
Created orthogonal box = (0 0 0) to (33.5919 33.5919 33.5919)
 
30
  1 by 1 by 1 MPI processor grid
 
31
create_atoms    1 box
 
32
Created 32000 atoms
 
33
mass            1 1.0
 
34
 
 
35
velocity        all create 1.44 87287 loop geom
 
36
 
 
37
pair_style      lj/cut 2.5
 
38
pair_coeff      1 1 1.0 1.0 2.5
 
39
 
 
40
neighbor        0.3 bin
 
41
neigh_modify    delay 0 every 20 check no
 
42
 
 
43
fix             1 all nve
 
44
 
 
45
run             100
 
46
Memory usage per processor = 7.79551 Mbytes
 
47
Step Temp E_pair E_mol TotEng Press 
 
48
       0         1.44   -6.7733681            0   -4.6134356   -5.0197073 
 
49
     100    0.7574531   -5.7585055            0   -4.6223613   0.20726105 
 
50
Loop time of 2.29105 on 1 procs (1 MPI x 1 OpenMP) for 100 steps with 32000 atoms
 
51
 
 
52
Pair  time (%) = 1.82425 (79.6249)
 
53
Neigh time (%) = 0.338632 (14.7806)
 
54
Comm  time (%) = 0.0366232 (1.59853)
 
55
Outpt time (%) = 0.000144005 (0.00628553)
 
56
Other time (%) = 0.0914049 (3.98965)
 
57
 
 
58
Nlocal:    32000 ave 32000 max 32000 min
 
59
Histogram: 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
 
60
Nghost:    19657 ave 19657 max 19657 min
 
61
Histogram: 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
 
62
Neighs:    1.20283e+06 ave 1.20283e+06 max 1.20283e+06 min
 
63
Histogram: 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
 
64
 
 
65
Total # of neighbors = 1202833
 
66
Ave neighs/atom = 37.5885
 
67
Neighbor list builds = 5
 
68
Dangerous builds = 0