← Back to branch summary

~ubuntu-branches/debian/sid/lammps/sid

« back to all changes in this revision

Viewing changes to examples/USER/atc/hardy/nvt.screen

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Anton Gladky
  • Date: 2015-04-29 23:44:49 UTC
  • mfrom: (5.1.3 experimental)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20150429234449-mbhy9utku6hp6oq8
Tags: 0~20150313.gitfa668e1-1
Upload into unstable.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
examples/USER/atc/hardy/nvt.screen
1
 
LAMMPS (30 Aug 2013)
2
 
dimension 3
3
 
boundary  p p p
4
 
lattice         fcc  5.376 orient x 1 0 0 orient y 0 1 0 orient z 0 0 1
5
 
Lattice spacing in x,y,z = 5.376 5.376 5.376
6
 
region          box block 0 5 0 5 0 5
7
 
read_data       nvt.init
8
 
Reading data file ...
9
 
  orthogonal box = (0 0 0) to (26.88 26.88 26.88)
10
 
  1 by 2 by 2 MPI processor grid
11
 
  500 atoms
12
 
  500 velocities
13
 
pair_style  lj/cut 13.0
14
 
pair_coeff      1 1 0.2381 3.405
15
 
group           internal region box
16
 
500 atoms in group internal
17
 
 
18
 
fix         ATC internal atc field
19
 
ATC: constructing shape function field estimate
20
 
 ATC: version 2.0
21
 
 ATC: peratom PE compute created with ID: 3
22
 
fix_modify  ATC mesh create 1 1 1 box p p p
23
 
 ATC: created uniform mesh with 8 nodes, 1 unique nodes, and 1 elements
24
 
fix_modify  ATC atom_element_map eulerian 100
25
 
fix_modify  ATC fields none
26
 
fix_modify  ATC fields add mass_density energy stress temperature kinetic_temperature
27
 
fix_modify  ATC fields add velocity thermal_energy kinetic_energy
28
 
fix_modify  ATC output nvtFE 100 text
29
 
 ATC: Warning : text output can create _LARGE_ files
30
 
 ATC: output custom names:
31
 
 
32
 
fix         PP  internal atc field
33
 
ATC: constructing shape function field estimate
34
 
 ATC: version 2.0
35
 
 ATC: peratom PE compute created with ID: 3
36
 
fix_modify  PP  filter type step # defaults to running
37
 
fix_modify  PP  filter on
38
 
fix_modify  PP  mesh create 1 1 1 box p p p
39
 
 ATC: created uniform mesh with 8 nodes, 1 unique nodes, and 1 elements
40
 
fix_modify  PP  atom_element_map eulerian 100
41
 
fix_modify  PP  fields add mass_density energy stress temperature kinetic_temperature
42
 
fix_modify  PP  fields add velocity thermal_energy kinetic_energy
43
 
fix_modify  PP  output nvtPP 100 text
44
 
 ATC: Warning : text output can create _LARGE_ files
45
 
 ATC: output custom names:
46
 
 
47
 
thermo          100
48
 
compute_modify  thermo_temp extra 0
49
 
thermo_style    custom step temp etotal ke pe press vol
50
 
timestep        4.0
51
 
reset_timestep  0
52
 
# NOTE fixes performing time integration (init_integrate/final_integrate) should be defined after atc
53
 
fix             NVT all nvt temp 30 30 10.0 drag 0.2 tchain 1
54
 
log             nvt.log
55
 
run             1000
56
 
Setting up run ...
57
 
 ATC: computing bond matrix ...........done
58
 
 ATC: computing bond matrix ...........done
59
 
Memory usage per processor = 40.9608 Mbytes
60
 
Step Temp TotEng KinEng PotEng Press Volume 
61
 
       0    31.104176   -898.55796     46.35782   -944.91578   -584.20571    19421.725 
62
 
     100    29.954062   -903.43223    44.643685   -948.07591   -646.45662    19421.725 
63
 
     200    29.952147   -900.39726    44.640831   -945.03809   -583.44492    19421.725 
64
 
     300     29.91148   -902.38105     44.58022   -946.96127    -626.6874    19421.725 
65
 
     400    29.936718   -900.07678    44.617835   -944.69461   -580.74144    19421.725 
66
 
     500    29.952289   -899.58418    44.641042   -944.22522    -570.0108    19421.725 
67
 
     600    29.980195   -901.64307    44.682633    -946.3257   -614.13849    19421.725 
68
 
     700     29.88447   -901.31686    44.539965   -945.85683   -604.74508    19421.725 
69
 
     800    29.876839   -900.32866    44.528592   -944.85725   -587.67852    19421.725 
70
 
     900    29.966977   -899.86769    44.662933   -944.53062   -581.80498    19421.725 
71
 
    1000    29.907621   -901.57887    44.574469   -946.15334   -613.00908    19421.725 
72
 
Loop time of 1.44902 on 4 procs for 1000 steps with 500 atoms
73
 
 
74
 
Pair  time (%) = 0.747129 (51.5609)
75
 
Neigh time (%) = 0 (0)
76
 
Comm  time (%) = 0.295985 (20.4265)
77
 
Outpt time (%) = 0.00255066 (0.176027)
78
 
Other time (%) = 0.403357 (27.8365)
79
 
 
80
 
Nlocal:    125 ave 129 max 121 min
81
 
Histogram: 1 0 0 0 0 2 0 0 0 1
82
 
Nghost:    2563 ave 2567 max 2559 min
83
 
Histogram: 1 0 0 0 0 2 0 0 0 1
84
 
Neighs:    22787.2 ave 23476 max 22083 min
85
 
Histogram: 1 0 0 0 0 2 0 0 0 1
86
 
FullNghs:  45574.5 ave 47047 max 44066 min
87
 
Histogram: 1 0 0 0 0 2 0 0 0 1
88
 
 
89
 
Total # of neighbors = 182298
90
 
Ave neighs/atom = 364.596
91
 
Neighbor list builds = 0
92
 
Dangerous builds = 0
 
1
No protocol specified
 
2
--------------------------------------------------------------------------
 
3
mpirun was unable to launch the specified application as it could not access
 
4
or execute an executable:
 
5
 
 
6
Executable: ../../../lmp_openmpi
 
7
Node: mithrandir
 
8
 
 
9
while attempting to start process rank 0.
 
10
--------------------------------------------------------------------------
 
11
4 total processes failed to start