← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/saucy/bioperl/saucy-proposed

« back to all changes in this revision

Viewing changes to debian/README.Debian

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2009-03-10 07:19:11 UTC
  • mfrom: (1.2.3 upstream)
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20090310071911-fukqzw54pyb1f0bd
Tags: 1.6.0-2
https://launchpad.net/bugs/324001
* Removed patch system (not used):
  - removed instuctions in debian/rules;
  - removed quilt from Build-Depends in debian/control.
* Re-enabled tests:
  - uncommented test command in debian/rules;
  - uncommented previously missing build-dependencies in debian/control.
  - Re-enabled tests and uncommented build-dependencies accordingly.
* Removed libmodule-build-perl and libtest-harness-perl from
  Build-Depends-Indep (provided by perl-modules).
* Better cleaning of empty directories using find -type d -empty -delete
  instead of rmdir in debian/rules (LP: #324001).

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
debian/README.Debian
1
 
BioPerl for DEBIAN
2
 
----------------------
3
 
 
4
 
* The Debian package for bioperl suggests the installation of all the perl
5
 
  modules that are 'recommended' in the Build.PL file. As an exception to this,
6
 
  libio-string-perl, libwww-perl, liburi-perl and libxml-writer-perl will be
7
 
  installed by default, as they are more frequently used (see
8
 
  http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html for the
9
 
  discussion).
10
 
 
11
 
  To install bioperl and all the suggested Debian packages, you can use the
12
 
  option ~Rsuggests:^package$ of the `aptitude' package manager, or the command
13
 
  `apt-get -o APT::Install-Suggests=true install'.
14
 
 
15
 
* Please cite:
16
 
 
17
 
@article{bioperl:2002,
18
 
  author={J.E. Stajich and D. Block and K. Boulez and S.E. Brenner
19
 
        and S.A. Chervitz and C. Dagdigian and G. Fuellen and J.G. Gilbert
20
 
        and I. Korf and H. Lapp and H. Lehvaslaiho and C. Matsalla and
21
 
        C.J. Mungall and B.I. Osborne and M.R. Pocock and P. Schattner and
22
 
        M. Senger and L.D. Stein and E. Stupka and M.D. Wilkinson and E. Birney},
23
 
  title="The Bioperl toolkit: Perl modules for the life sciences.",
24
 
  journal="Genome Res.",
25
 
  year=2002,
26
 
  volume=12,
27
 
  number=10,
28
 
  pages="1611-1618",
29
 
  doi={10.1101/gr.361602},
30
 
  pmid="12368254"
31
 
}
32
 
when publishing work to which this package has contribute.
33
 
 
34
 
 -- Fri, 21 Sep 2007 22:52:22 +0900