← Back to branch summary

~ubuntu-branches/debian/sid/lammps/sid

« back to all changes in this revision

Viewing changes to tools/moltemplate/examples/coarse_grained_examples/membrane_BranniganPRE2005/README_run.sh

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Anton Gladky
  • Date: 2015-04-29 23:44:49 UTC
  • mfrom: (5.1.3 experimental)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20150429234449-mbhy9utku6hp6oq8
Tags: 0~20150313.gitfa668e1-1
Upload into unstable.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
tools/moltemplate/examples/coarse_grained_examples/membrane_BranniganPRE2005/README_run.sh
 
1
# --- Running LAMMPS ---
 
2
#  -- Prerequisites: --
 
3
# The "run.in.nvt" file is a LAMMPS input script containing
 
4
# references to the input scripts and data files
 
5
# you hopefully have created earlier with moltemplate.sh:
 
6
#   system.in.init, system.in.settings, system.data, and table_int.dat
 
7
# If not, carry out the instructions in "README_setup.sh".
 
8
#
 
9
#  -- Instructions: --
 
10
# If "lmp_linux" is the name of the command you use to invoke lammps,
 
11
# then you would run lammps on these files this way:
 
12
 
 
13
 
 
14
lmp_linux -i run.in.npt  # Run a simulation at constant pressure (tension)
 
15
 
 
16
#or 
 
17
 
 
18
lmp_linux -i run.in.nvt  # Run a simulation at constant volume
 
19
 
 
20
#(Note: The constant volume simulation lacks pressure equilibration. These are
 
21
#       completely separate simulations. The results of the constant pressure
 
22
#       simulation are ignored when beginning the simulation at constant volume.
 
23
#       This can be fixed.  Read "run.in.nvt" for equilibration instructions.)
 
24
 
 
25
 
 
26
 
 
27
 
 
28
 
 
29
# If you have compiled the MPI version of lammps, you can run lammps in parallel
 
30
#mpirun -np 4 lmp_linux -i run.in.npt
 
31
#or
 
32
#mpirun -np 4 lmp_linux -i run.in.nvt
 
33
# (assuming you have 4 processors available)