← Back to branch summary

~ubuntu-branches/debian/sid/lammps/sid

« back to all changes in this revision

Viewing changes to tools/moltemplate/examples/coarse_grained_examples/protein_folding_examples/1bead+chaperone/frustrated/images/for_visualization/psf_file_created_by_topotools/system.psf

  • Committer: Package Import Robot
  • Author(s): Anton Gladky
  • Date: 2015-04-29 23:44:49 UTC
  • mfrom: (5.1.3 experimental)
  • Revision ID: package-import@ubuntu.com-20150429234449-mbhy9utku6hp6oq8
Tags: 0~20150313.gitfa668e1-1
Upload into unstable.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
tools/moltemplate/examples/coarse_grained_examples/protein_folding_examples/1bead+chaperone/frustrated/images/for_visualization/psf_file_created_by_topotools/system.psf
 
1
PSF
 
2
 
 
3
       1 !NTITLE
 
4
 REMARKS VMD generated structure x-plor psf file
 
5
 
 
6
      27 !NATOM
 
7
       1      1         2    2      0.000000        1.0000           0
 
8
       2      1         1    1      0.000000        1.0000           0
 
9
       3      1         2    2      0.000000        1.0000           0
 
10
       4      1         1    1      0.000000        1.0000           0
 
11
       5      1         2    2      0.000000        1.0000           0
 
12
       6      1         1    1      0.000000        1.0000           0
 
13
       7      1         3    3      0.000000        1.0000           0
 
14
       8      1         3    3      0.000000        1.0000           0
 
15
       9      1         1    1      0.000000        1.0000           0
 
16
      10      1         2    2      0.000000        1.0000           0
 
17
      11      1         1    1      0.000000        1.0000           0
 
18
      12      1         2    2      0.000000        1.0000           0
 
19
      13      1         1    1      0.000000        1.0000           0
 
20
      14      1         2    2      0.000000        1.0000           0
 
21
      15      1         3    3      0.000000        1.0000           0
 
22
      16      1         3    3      0.000000        1.0000           0
 
23
      17      1         3    3      0.000000        1.0000           0
 
24
      18      1         1    1      0.000000        1.0000           0
 
25
      19      1         1    1      0.000000        1.0000           0
 
26
      20      1         2    2      0.000000        1.0000           0
 
27
      21      1         2    2      0.000000        1.0000           0
 
28
      22      1         1    1      0.000000        1.0000           0
 
29
      23      1         1    1      0.000000        1.0000           0
 
30
      24      1         2    2      0.000000        1.0000           0
 
31
      25      1         2    2      0.000000        1.0000           0
 
32
      26      1         1    1      0.000000        1.0000           0
 
33
      27      1         2    2      0.000000        1.0000           0
 
34
 
 
35
      26 !NBOND: bonds
 
36
       1       2       2       3       3       4       4       5
 
37
       5       6       6       7       7       8       8       9
 
38
       9      10      10      11      11      12      12      13
 
39
      13      14      14      15      15      16      16      17
 
40
      17      18      18      19      19      20      20      21
 
41
      21      22      22      23      23      24      24      25
 
42
      25      26      26      27
 
43
 
 
44
      25 !NTHETA: angles
 
45
      13      14      15       7       8       9       6       7       8
 
46
      16      17      18      15      16      17       2       3       4
 
47
       4       5       6       9      10      11      11      12      13
 
48
      14      15      16       1       2       3       3       4       5
 
49
      10      11      12      12      13      14      25      26      27
 
50
       5       6       7       8       9      10      17      18      19
 
51
      18      19      20      22      23      24      21      22      23
 
52
      19      20      21      20      21      22      23      24      25
 
53
      24      25      26
 
54
 
 
55
      19 !NPHI: dihedrals
 
56
       1       2       3       4       2       3       4       5
 
57
       3       4       5       6       4       5       6       7
 
58
       8       9      10      11       9      10      11      12
 
59
      10      11      12      13      11      12      13      14
 
60
      12      13      14      15      15      16      17      18
 
61
      16      17      18      19      17      18      19      20
 
62
      18      19      20      21      19      20      21      22
 
63
      20      21      22      23      21      22      23      24
 
64
      22      23      24      25      23      24      25      26
 
65
      24      25      26      27
 
66
 
 
67
       0 !NIMPHI: impropers
 
68
 
 
69
 
 
70
       0 !NDON: donors
 
71
 
 
72
 
 
73
       0 !NACC: acceptors
 
74
 
 
75
 
 
76
       0 !NNB
 
77
 
 
78
       0       0       0       0       0       0       0       0
 
79
       0       0       0       0       0       0       0       0
 
80
       0       0       0       0       0       0       0       0
 
81
       0       0       0
 
82
 
 
83
       1       0 !NGRP
 
84
       0       0       0
 
85