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Viewing changes to Bio/Coordinate/Graph.pm

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2008-03-18 14:44:57 UTC
  • mfrom: (4 hardy)
  • mto: This revision was merged to the branch mainline in revision 6.
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080318144457-1jjoztrvqwf0gruk
http://bugs.debian.org/448890
* debian/control:
  - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
    Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
  - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
    according to the following discussion on Upstream's mail list.
    http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
    (Closes: #448890)
* debian/copyright converted to machine-readable format.

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removed removed

Lines of Context:
Bio/Coordinate/Graph.pm
1
 
# $Id: Graph.pm,v 1.4 2003/06/10 18:04:57 jason Exp $
 
1
# $Id: Graph.pm,v 1.10.4.1 2006/10/02 23:10:14 sendu Exp $
2
2
#
3
3
# bioperl module for Bio::Coordinate::Graph
4
4
#
5
 
# Cared for by Heikki Lehvaslaiho <heikki@ebi.ac.uk>
 
5
# Cared for by Heikki Lehvaslaiho <heikki-at-bioperl-dot-org>
6
6
#
7
7
# Copyright Heikki Lehvaslaiho
8
8
#
110
110
Bioperl modules. Send your comments and suggestions preferably to the
111
111
Bioperl mailing lists  Your participation is much appreciated.
112
112
 
113
 
  bioperl-l@bioperl.org                         - General discussion
114
 
  http://bio.perl.org/MailList.html             - About the mailing lists
 
113
  bioperl-l@bioperl.org                  - General discussion
 
114
  http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists  - About the mailing lists
115
115
 
116
116
=head2 Reporting Bugs
117
117
 
118
118
report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track
119
 
 the bugs and their resolution.  Bug reports can be submitted via
120
 
 email or the web:
 
119
the bugs and their resolution.  Bug reports can be submitted via the
 
120
web:
121
121
 
122
 
  bioperl-bugs@bio.perl.org
123
 
  http://bugzilla.bioperl.org/
 
122
  http://bugzilla.open-bio.org/
124
123
 
125
124
=head1 AUTHOR - Heikki Lehvaslaiho
126
125
 
127
 
Email:  heikki@ebi.ac.uk
128
 
Address:
129
 
 
130
 
     EMBL Outstation, European Bioinformatics Institute
131
 
     Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton
132
 
     Cambs. CB10 1SD, United Kingdom
 
126
Email:  heikki-at-bioperl-dot-org
133
127
 
134
128
=head1 APPENDIX
135
129
 
142
136
# Let the code begin...
143
137
 
144
138
package Bio::Coordinate::Graph;
145
 
use vars qw(@ISA );
146
139
use strict;
147
140
 
148
141
# Object preamble - inherits from Bio::Root::Root
149
 
use Bio::Root::Root;
150
142
 
151
 
@ISA = qw(Bio::Root::Root);
 
143
use base qw(Bio::Root::Root);
152
144
 
153
145
 
154
146
sub new {
341
333
 
342
334
=cut
343
335
 
 
336
#' keep emacs happy
 
337
 
344
338
sub dijkstra {
345
339
    my ($self,$root) = @_;
346
340