~ubuntu-branches/ubuntu/raring/bioperl/raring

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Bio/Tools/Profile.pm

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2008-03-18 14:44:57 UTC
  • mfrom: (4 hardy)
  • mto: This revision was merged to the branch mainline in revision 6.
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080318144457-1jjoztrvqwf0gruk
* debian/control:
  - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
    Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
  - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
    according to the following discussion on Upstream's mail list.
    http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
    (Closes: #448890)
* debian/copyright converted to machine-readable format.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
# $Id: Profile.pm,v 1.8.4.1 2006/10/02 23:10:32 sendu Exp $
1
2
# BioPerl module for Bio::Tools::Profile
2
3
#
3
4
# Cared for by Balamurugan Kumarasamy
29
30
 Bioperl modules. Send your comments and suggestions preferably to
30
31
 the Bioperl mailing list.  Your participation is much appreciated.
31
32
 
32
 
 bioperl-l@bioperl.org              - General discussion
33
 
 http://bioperl.org/MailList.shtml  - About the mailing lists
 
33
  bioperl-l@bioperl.org                  - General discussion
 
34
  http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists  - About the mailing lists
34
35
 
35
36
=head2 Reporting Bugs
36
37
 
37
 
 Report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track
38
 
 of the bugs and their resolution. Bug reports can be submitted via
39
 
 email or the web:
40
 
 
41
 
 bioperl-bugs@bioperl.org
42
 
 http://bugzilla.bioperl.org/
 
38
Report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track
 
39
of the bugs and their resolution. Bug reports can be submitted via the
 
40
web:
 
41
 
 
42
  http://bugzilla.open-bio.org/
 
43
 
43
44
=head1 AUTHOR - Balamurugan Kumarasamy
44
45
 
45
46
 Email: fugui@worf.fugu-sg.org
54
55
 
55
56
 
56
57
package Bio::Tools::Profile;
57
 
use vars qw(@ISA);
58
58
use strict;
59
59
 
60
 
use Bio::Root::Root;
61
60
use Bio::SeqFeature::FeaturePair;
62
 
use Bio::Root::IO;
63
61
use Bio::SeqFeature::Generic;
64
62
 
65
 
@ISA = qw(Bio::Root::Root Bio::Root::IO );
 
63
use base qw(Bio::Root::Root Bio::Root::IO);
66
64
 
67
65
 
68
66