← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/raring/bioperl/raring

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Bio/Factory/LocationFactoryI.pm

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2008-03-18 14:44:57 UTC
  • mfrom: (4 hardy)
  • mto: This revision was merged to the branch mainline in revision 6.
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080318144457-1jjoztrvqwf0gruk
http://bugs.debian.org/448890
* debian/control:
  - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
    Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
  - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
    according to the following discussion on Upstream's mail list.
    http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
    (Closes: #448890)
* debian/copyright converted to machine-readable format.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
Bio/Factory/LocationFactoryI.pm
1
 
# $Id: LocationFactoryI.pm,v 1.2 2002/10/22 07:45:14 lapp Exp $
 
1
# $Id: LocationFactoryI.pm,v 1.7.4.1 2006/10/02 23:10:18 sendu Exp $
2
2
#
3
3
# BioPerl module for Bio::Factory::LocationFactoryI
4
4
#
26
26
 
27
27
=head1 NAME
28
28
 
29
 
Bio::Factory::LocationFactoryI - DESCRIPTION of Interface
 
29
Bio::Factory::LocationFactoryI - A factory interface for generating locations from a string
30
30
 
31
31
=head1 SYNOPSIS
32
32
 
33
 
Give standard usage here
 
33
 # Do not use directly, see Bio::Factory::LocationFactory for example
 
34
 use Bio::Factory::FTLocationFactory;
 
35
 my $locfact = Bio::Factory::FTLocationFactory->new();
 
36
 my $location = $locfact->from_string("1..200");
 
37
 print $location->start(), " ", $location->end(), " ", $location->strand,"\n";
34
38
 
35
39
=head1 DESCRIPTION
36
40
 
37
 
Describe the interface here
 
41
An interface for Location Factories which generate Bio::LocationI
 
42
objects from a string.
38
43
 
39
44
=head1 FEEDBACK
40
45
 
44
49
Bioperl modules. Send your comments and suggestions preferably to
45
50
the Bioperl mailing list.  Your participation is much appreciated.
46
51
 
47
 
  bioperl-l@bioperl.org              - General discussion
48
 
  http://bioperl.org/MailList.shtml  - About the mailing lists
 
52
  bioperl-l@bioperl.org                  - General discussion
 
53
  http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists  - About the mailing lists
49
54
 
50
55
=head2 Reporting Bugs
51
56
 
52
57
Report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track
53
 
of the bugs and their resolution. Bug reports can be submitted via
54
 
email or the web:
 
58
of the bugs and their resolution. Bug reports can be submitted via the
 
59
web:
55
60
 
56
 
  bioperl-bugs@bioperl.org
57
 
  http://bugzilla.bioperl.org/
 
61
  http://bugzilla.open-bio.org/
58
62
 
59
63
=head1 AUTHOR - Hilmar Lapp
60
64
 
61
65
Email hlapp at gmx.net
62
66
 
63
 
=head1 CONTRIBUTORS
64
 
 
65
 
Additional contributors names and emails here
66
 
 
67
67
=head1 APPENDIX
68
68
 
69
69
The rest of the documentation details each of the object methods.
76
76
 
77
77
 
78
78
package Bio::Factory::LocationFactoryI;
79
 
use vars qw(@ISA);
80
79
use strict;
81
80
use Carp;
82
 
use Bio::Root::RootI;
83
81
 
84
 
@ISA = qw( Bio::Root::RootI );
 
82
use base qw(Bio::Root::RootI);
85
83
 
86
84
=head2 from_string
87
85
 
105
103
 
106
104
    $self->throw_not_implemented();
107
105
}
 
106
 
 
107
1;