← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/raring/bioperl/raring

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Bio/SearchIO/EventHandlerI.pm

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2008-03-18 14:44:57 UTC
  • mfrom: (4 hardy)
  • mto: This revision was merged to the branch mainline in revision 6.
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080318144457-1jjoztrvqwf0gruk
http://bugs.debian.org/448890
* debian/control:
  - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
    Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
  - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
    according to the following discussion on Upstream's mail list.
    http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
    (Closes: #448890)
* debian/copyright converted to machine-readable format.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
Bio/SearchIO/EventHandlerI.pm
1
 
# $Id: EventHandlerI.pm,v 1.9 2003/04/09 03:52:36 sac Exp $
 
1
# $Id: EventHandlerI.pm,v 1.13.4.1 2006/10/02 23:10:25 sendu Exp $
2
2
#
3
3
# BioPerl module for Bio::SearchIO::EventHandlerI
4
4
#
35
35
Bioperl modules. Send your comments and suggestions preferably to
36
36
the Bioperl mailing list.  Your participation is much appreciated.
37
37
 
38
 
  bioperl-l@bioperl.org              - General discussion
39
 
  http://bioperl.org/MailList.shtml  - About the mailing lists
 
38
  bioperl-l@bioperl.org                  - General discussion
 
39
  http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists  - About the mailing lists
40
40
 
41
41
=head2 Reporting Bugs
42
42
 
43
43
Report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track
44
 
of the bugs and their resolution. Bug reports can be submitted via
45
 
email or the web:
 
44
of the bugs and their resolution. Bug reports can be submitted via the
 
45
web:
46
46
 
47
 
  bioperl-bugs@bioperl.org
48
 
  http://bugzilla.bioperl.org/
 
47
  http://bugzilla.open-bio.org/
49
48
 
50
49
=head1 AUTHOR - Jason Stajich
51
50
 
52
 
Email jason@bioperl.org
53
 
 
54
 
Describe contact details here
55
 
 
56
 
=head1 CONTRIBUTORS
57
 
 
58
 
Additional contributors names and emails here
 
51
Email jason-at-bioperl.org
59
52
 
60
53
=head1 APPENDIX
61
54
 
69
62
 
70
63
 
71
64
package Bio::SearchIO::EventHandlerI;
72
 
use vars qw(@ISA);
73
65
use strict;
74
66
use Carp;
75
67
 
76
 
use Bio::Event::EventHandlerI;
77
68
 
78
 
@ISA = qw (Bio::Event::EventHandlerI);
 
69
use base qw(Bio::Event::EventHandlerI);
79
70
 
80
71
=head2 start_result
81
72
 
171
162
   $self->throw_not_implemented();
172
163
}
173
164
 
 
165
=head2 start_iteration
 
166
 
 
167
 Title   : start_iteration
 
168
 Usage   : $handler->start_iteration()
 
169
 Function: Starts an Iteration event cycle
 
170
 Returns : none
 
171
 Args    : type of event and associated hashref
 
172
 
 
173
 
 
174
=cut
 
175
 
 
176
sub start_iteration {
 
177
   my ($self,@args) = @_;
 
178
   $self->throw_not_implemented
 
179
}
 
180
 
 
181
=head2 end_iteration
 
182
 
 
183
 Title   : end_iteration
 
184
 Usage   : $handler->end_iteration()
 
185
 Function: Ends an Iterationevent cycle
 
186
 Returns : Bio::Search::Iteration::IterationI object
 
187
 Args    : type of event and associated hashref
 
188
 
 
189
 
 
190
=cut
 
191
 
 
192
sub end_iteration {
 
193
   my ($self,@args) = @_;
 
194
   $self->throw_not_implemented();
 
195
}
 
196
 
174
197
=head2 register_factory
175
198
 
176
199
 Title   : register_factory