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Viewing changes to Bio/Variation/AAReverseMutate.pm

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2008-03-18 14:44:57 UTC
  • mfrom: (4 hardy)
  • mto: This revision was merged to the branch mainline in revision 6.
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080318144457-1jjoztrvqwf0gruk
* debian/control:
  - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
    Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
  - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
    according to the following discussion on Upstream's mail list.
    http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
    (Closes: #448890)
* debian/copyright converted to machine-readable format.

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Lines of Context:
1
 
# $Id: AAReverseMutate.pm,v 1.7 2003/06/04 08:36:44 heikki Exp $
 
1
# $Id: AAReverseMutate.pm,v 1.12.4.1 2006/10/02 23:10:38 sendu Exp $
2
2
#
3
3
# BioPerl module for Bio::Variation::AAReverseMutate
4
4
#
5
 
# Cared for by Heikki Lehvaslaiho <heikki@ebi.ac.uk>
 
5
# Cared for by Heikki Lehvaslaiho <heikki-at-bioperl-dot-org>
6
6
#
7
7
# Copyright Heikki Lehvaslaiho
8
8
#
55
55
Bioperl modules. Send your comments and suggestions preferably to the 
56
56
Bioperl mailing lists  Your participation is much appreciated.
57
57
 
58
 
  bioperl-l@bioperl.org                         - General discussion
59
 
  http://bio.perl.org/MailList.html             - About the mailing lists
 
58
  bioperl-l@bioperl.org                  - General discussion
 
59
  http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists  - About the mailing lists
60
60
 
61
61
=head2 Reporting Bugs
62
62
 
63
 
report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track
64
 
 the bugs and their resolution.  Bug reports can be submitted via
65
 
 email or the web:
 
63
Report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track
 
64
the bugs and their resolution.  Bug reports can be submitted via the
 
65
web:
66
66
 
67
 
  bioperl-bugs@bio.perl.org
68
 
  http://bugzilla.bioperl.org/
 
67
  http://bugzilla.open-bio.org/
69
68
 
70
69
=head1 AUTHOR - Heikki Lehvaslaiho
71
70
 
72
 
Email:  heikki@ebi.ac.uk
73
 
Address: 
74
 
 
75
 
     EMBL Outstation, European Bioinformatics Institute
76
 
     Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton
77
 
     Cambs. CB10 1SD, United Kingdom 
78
 
 
 
71
Email:  heikki-at-bioperl-dot-org
79
72
 
80
73
=head1 APPENDIX
81
74
 
89
82
 
90
83
package Bio::Variation::AAReverseMutate;
91
84
 
92
 
use vars qw(@ISA);
93
85
use strict;
94
86
 
95
87
# Object preamble - inheritance
97
89
use Bio::Variation::RNAChange;
98
90
use Bio::Variation::Allele;
99
91
 
100
 
@ISA = qw( Bio::Root::Root);
 
92
use base qw(Bio::Root::Root);
101
93
 
102
94
sub new {
103
95
    my($class,@args) = @_;