3
FT /M1_GAS_orthologue="SPy0002"
4
FT /MGAS10394_orthologue="M6_Spy0001"
5
FT /MGAS315_orthologue="dnaA"
6
FT /MGAS8232_orthologue="dnaA"
7
FT /SSI_1_orthologue="SPs0001"
12
FT /fasta_file="fasta/SP_new.tab.seq.00001.out"
15
FT /product="chromosomal replication initiator protein"
16
FT /systematic_id="SpyM50001"
17
FT misc_feature 535..1488
19
FT /domain="HMMPfam:PF00308;Bacterial dnaA
20
FT protein;1.7e-156;codon 112-429"
23
FT /note="HMMPfam hit to PF00308, Bacterial dnaA protein,
25
FT misc_feature 655..678
27
FT /note="PS00017 ATP/GTP-binding site motif A (P-loop)."
28
FT misc_feature 1429..1488
30
FT /note="PS01008 DnaA protein signature."
31
SQ Sequence 1841271 BP; 564546 A; 354645 C; 356610 G; 565470 T; 0 other;
32
ttgttgatat tctgtttttt cttttttagt tttccacata aaaaatagtt gaaaacaata 60
33
gcggtgtcac cttaaaatgg cttttccaca ggttgtggag aacccaaatt aacagtgtta 120
34
atttattttc cacaggttgt ggaaaactag aatagtttat ggtagaatag ttctagaatt 180
35
atccacaaga aggaacctag tatgactgaa aatgaacaaa ttttttggaa cagggtcttg 240
36
gaattagctc agagtcaatt aaaacaggca acttatgaat tttttgttca tgatgcccgt 300
37
ctattaaagg tcgataagca tattgcaact atttacttag atcaaatgaa agaactcttt 360
38
tgggaaaaaa atcttaaaga tgttattctt actgctggtt ttgaagttta taacgctcaa 420
39
atttctgttg actatgtttt cgaagaagac ctaatgattg agcaaaatca gaccaaaatc 480
40
aatcaaaaac ctaagcagca agccttaaat tctttgccta ctgttacttc agatttaaac 540
41
tcgaaatata gttttgaaaa ctttattcaa ggagatgaaa atcgttgggc tgttgctgct 600
42
tcaatagcag tagctaatac tcctggaact acctataatc ctttgtttat ttggggtggc 660
43
cctgggcttg gaaaaaccca tttattaaat gctattggta attctgtact attagaaaat 720
44
ccaaatgctc gaattaaata tatcacagct gaaaacttta ttaatgagtt tgttatccat 780
45
attcgccttg ataccatgga tgaattgaaa gaaaaatttc gtaatttaga tttactcctt 840
46
attgatgata tccaatcttt agctaaaaaa acgctctctg gaacacaaga agagttcttt 900
47
aatactttta atgcacttca taataataac aaacaaattg tcctaacaag cgaccgtaca 960
48
ccagatcatc tcaatgattt agaagatcga ttagttactc gttttaaatg gggattaaca 1020
49
gtcaatatca cacctcctga ttttgaaaca cgagtggcta ttttgacaaa taaaattcaa 1080
50
gaatataact ttatttttcc tcaagatacc attgagtatt tggctggtca atttgattct 1140
51
aatgtcagag atttagaagg tgccttaaaa gatattagtc tggttgctaa tttcaaacaa 1200
52
attgacacga ttactgttga cattgctgcc gaagctattc gcgccagaaa gcaagatgga 1260
53
cctaaaatga cagttattcc catcgaagaa attcaagcgc aagttggaaa attttacggt 1320
54
gttaccgtca aagaaattaa agctactaaa cgaacacaaa atattgtttt agcaagacaa 1380
55
gtagctatgt ttttagcacg tgaaatgaca gataacagtc ttcctaaaat tggaaaagaa 1440
56
tttggtggca gagaccattc aacagtactc catgcctata ataaaatcaa aaacatgatc 1500
57
agccaggacg aaagccttag gatcgaaatt gaaaccataa aaaacaaaat taaataacat 1560
58
gtggaaaaga atatctttta tgaaatagtt atccacaagt tgtgaacaac catttagtct 1620
59
tggattctct cgtttattta gagttatcca ctatatacac aagacctact actactactt 1680
60
attattatac ttattaaata aaggagttct catgattcaa ttttcaatta atcgcacatt 1740
61
atttattcat gctttaaatg caactaaacg tgctattagc actaaaaatg ccattcctat 1800
62
tctttcatca ataaaaattg aagtcactcc tacaggagta actttaacag ggtctaacgg 1860
63
tcaaatatca attgaaaaca ctattcctgt aagtaatgaa aatgctggtt tgctaattac 1920
64
ctctccagga gctattttat tagaagctag tttttttatt aatattattt caagtttgcc 1980
65
agatattagt ataaatgtta aagaaattga acaacaccaa gttgttttaa ccagtggtaa 2040
66
atcagagatt accttaaaag gaaaagatgt tgaccagtat cctcgtctac aagaagtatc 2100
67
aacagaaaat cctttgattt taaaaacaaa attattgaag tctattattg ctgaaacagc 2160
68
ttttgcagcc agtttacaag aaagtcgtcc tattttaaca ggagttcata ttgtattaag 2220
69
taatcataaa gattttaaag cagtagcgac tgactctcat cgtatgagcc aacgtttaat 2280
70
cactttggac aatacttcag cagattttga tgtggttatt ccaagtaaat ctttgagaga 2340
71
attttcagca gtatttacag atgatattga gaccgttgag gtatttttct caccaagcca 2400
72
aatcttgttc agaagtgaac acatttcttt ttatacacgc ctcttagaag gaaattatcc 2460
73
cgatacagac cgtttattaa tgacagaatt tgagacggag gttgttttca atacccaatc 2520
74
ccttcgccac gctatggaac gtgccttctt gatttctaat gctactcaaa atggtactgt 2580
75
taagcttgag attactcaaa atcatatttc agctcatgtt aactcacctg aggttggtaa 2640
76
ggtaaacgag gatttagata ttgttagtca gtctggtagt gatttaacta tcagcttcaa 2700
77
tccaacttac cttattgagt ctttaaaagc tattaaaagt gaaacagtaa aaattcattt 2760
78
cttatcacca gttcgaccat tcaccctaac accaggcgat gaggaagaaa gttttatcca 2820
79
attaattaca ccagtacgaa caaactaagt aagaaaaagc tcccttttag gagttttttt 2880
80
gttattataa atattaacga taatataagt ggagaaaagt gaatgtatca aattggatca 2940
81
tttgttgaaa tgaaaaaacc tcatgcttgt gtaattaaag aaactggtaa aaaggctaat 3000
82
caatggaagg tactgagagt aggagctgat attaaaattc agtgtactaa ctgtcagcat 3060
83
gtgattatga tgagtcgtta tgattttgag cgaaaattaa aaaaagtact gcaaccatga 3120
84
aagtcctttt aaataaataa ttctagctat atttgcaacc aatactttcc taaaaaattg 3180
85
ttagtatgcc gttggaaaat tagctattct aacgttatcg aaagaagaaa ggtggctatt 3240
86
gacaatgacg aaagttgtag cacagttact tagtttctcg gcaaactata tcaaaatgag 3300
87
aataatacac caaactttga taatttaaat gaaggtgaaa gagtggcata atgataagca 3360
88
aatctgaaat tttcttctta ttcataccgc tttttcttct attttttggt ataataatct 3420
89
tgattgaaat ttgaatggag attcgctaaa tggctttaac agcaggtatt gtaggcttac 3480
90
caaatgttgg taaatcaacc ttatttaacg caattacaaa agcaggagca gaagctgcta 3540
91
attatccttt tgcgactatt gatcccaatg ttggtatggt agaggttcca gatgagcgtc 3600
92
tgcaaaaatt gacagaattg attacaccta aaaaaacagt tccgacaacc tttgaattta 3660
93
ctgatattgc aggtatcgtt aaaggtgctt ctagagggga aggtctagga aataaatttt 3720
94
tagctaatat tcgtgaagtc gatgctattg ttcatgtggt acgtgctttt gatgatgaaa 3780
95
atgtcatgcg tgaacaaggt cgtgaggatg ctttcgttga tcctatagca gatattgaca 3840
96
ctattaatct tgaattaatc ttagctgatt tagagtcaat caataaacgt tatgcgcgtg 3900
97
ttgaaaaaat ggcacgaact caaaaagata aagaatcagt agcagagttc aatgttttac 3960
98
aaaagattaa acctgttttg gaagatggga aatcagctag gacaattgag tttacagaag 4020
99
aggaagcaaa agttgttaaa ggtctctttt tattaacaac taaacctgtt ttatatgtag 4080
100
ctaatgtcga tgaagataaa gttgctaatc cagatggtat tgattatgtc aaacaaattc 4140
101
gtgactttgc agctactgaa aatgctgaag tagttgttat ctcagcgcgt gcagaagaag 4200
102
aaatttcaga gcttgacgat gaggataaag aagaattttt ggaagctatc ggtcttactg 4260
103
aatcaggcgt tgataaatta accagagcag cttatcatct cttaggcctt ggaacctatt 4320
104
ttacagcagg tgaaaaagag gttcgtgctt ggacgtttaa gcgtggtata aaagctccac 4380
105
aagctgctgg tattatccat tcagattttg aaagaggttt tattcgtgca gtaaccatgt 4440
106
cttatgatga tctaatgatc tacggttcag aaaaagccgt caaagaagct ggacgcttgc 4500
107
gtgaagaagg aaaagaatac gttgttcaag atggggacat catggaattc agatttaatg 4560
108
tgtaattata ttaaaacaat atcagaaggt tggaagaaca ttccagccct tttggcattt 4620
109
tagaaagaga aaatatggta aaaatgattg ttggtctggg aaatccaggc tctaaatatg 4680
110
aaaaaacaaa gcacaatatt ggttttatgg ctattgacaa tattgtcaag aaccttgacg 4740
111
ttacctttac agatgataaa aattttaaag cacagatagg aagtactttt attaatcatg 4800
112
aaaaagttta ctttgtgaaa cctactactt ttatgaataa tagcggcata gcagtaaaag 4860
113
cattactaac ctactataat attgacataa cagatttaat tgttatctat gatgatttag 4920
114
acatggaagt cagtaaatta cgtttacgta gtaagggttc agcaggagga cataatggca 4980
115
ttaagtcaat cattgcccac attggaactc aggaatttaa ccgaatcaaa gttggtattg 5040
116
gacgaccttt aaaaggtatg actgttatta gccatgtgat gggccaattc aataccgaag 5100
117
ataatattgc tatttcgtta actcttgaca gagttgtcaa tgctgtcaag ttttatttac 5160
118
aagaaaatga ttttgaaaaa acaatgcaga aatttaatgg ataatcatgg atattttaga 5220
119
attatttagt cagaataaga aagtccaatc ctggcactct ggattaacca ccttaggaag 5280
120
acaactggta atggggttat cgggttcaag taaagcattg gctatagctt ccgcttattt 5340
121
agatgatcaa aaaaaaatag ttgtggttac atcaactcaa aatgaggttg aaaaattagc 5400
122
cagcgattta tctagtttac ttgatgaaga acttgttttc caattttttg cagacgatgt 5460
123
ggctgcagcg gaatttatct ttgcgtcaat ggataaagct ctatcaagaa tagaaaccct 5520
124
gcaattttta aggaatccta aatctcaggg cgttttaatt gttagtttat caagcttaag 5580
125
aactttattg ccaaacccag atgtttttac aaagagtcag attcaactaa cagttggaga 5640
126
agattatgat agtgatactc ttactaaaca actgatgaca attggctatc agaaggtctc 5700
127
acaggtcatt agtccgggag aatttagccg tcgaggggat attttagata tctatgagat 5760
128
tacacaagaa ttgccttatc gattggaatt ttttggcgat gatattgata gtattaggca 5820
129
attttatcca gaaactcaaa aatcttttga acaactagaa ggtattttta ttaatccagc 5880
130
aagtgatctt atttttgagg ctagtgattt tcaacgtggc attgagcaat tagaaaaggc 5940
131
tctacaaaca gcacaagatg ataaaaaatc ttatttagaa gatgtattag ctgtttcaaa 6000
132
aaacggtttt aaacataagg atatccgtaa atttcaatca ttattttacg aaaaagagtg 6060
133
gtcattatta gattatattc ctaagggaac gccaatcttt tttgatgatt ttcaaaaact 6120
134
agttgataaa aatgcaagat ttgatttaga gattgctaat ctcttgacag aagatttaca 6180
135
gcaaggaaag gctctttcca atcttaacta ctttgcagat aattatcgag agcttaggca 6240
136
ctataagcca gcgaccttct tttcaaattt tcataaggga cttggaaata tcaaatttga 6300
137
tcagatgcat cagctaactc agtatgccat gcaggaattt tttaatcaat ttcctttgtt 6360
138
gattgatgag attaaacggt atcaaaaaaa tcaaacaacg gttattgtac aggtagagtc 6420
139
tcagtatgct tacgaacgac ttgaaaaatc ttttcaagat taccaatttc gccttccttt 6480
140
agtgagtgct aatcaaattg tttcacgtga atcacaaatt gtaattggag ctatctccag 6540
141
tggtttttat tttgctgatg aaaagttagc gttaatcaca gagcatgaaa tttatcataa 6600
142
aaagatcaaa cgacgcgcta gacgatctaa tattagcaat gctgagcgtt tgaaagatta 6660
143
caatgagtta gcagtaggtg attacgtggt tcataatgtc catggtatcg gtcgctttct 6720
144
tggaattgaa acgattcagg ttcagggaat ccatcgagat tacgttacta ttcaatatca 6780
145
aaattcagac cgtatttctc ttccaattga ccaaattggt agcttatcaa agtacgtttc 6840
146
tgctgatgga aaagaaccta aaattaataa actcaatgat ggtcgttttc aaaagacaaa 6900
147
gcaaaaggtc gctagacaag tagaagatat tgctgatgac cttctaaaat tatatgctga 6960
148
aagaagtcag caaaaaggat tttcattttc accagatgat gacttgcagc gcgcttttga 7020
149
tgatgatttt gcttttgtag aaacagaaga tcaacttagg tctataaagg aaattaaagc 7080
150
tgatatggag agcatgcaac ctatggatcg tcttttagta ggcgatgtag gatttggtaa 7140
151
gacagaagta gctatgaggg cagcctttaa agcggtgaat gatcacaaac aagtagctgt 7200
152
cttagttcca accacagtct tggcccagca gcattatgaa aacttcaaag cacgctttga 7260
153
aaattacctt gttgaggttg acgtcttaag tcgtttccgt agtaaaaaag agcaagctga 7320
154
aacactagaa catgtacaaa aaggtcaaat tgacattatt atcggaaccc atcgactcct 7380
155
atcaaaagat gtggtctttt ctgatttagg attaattgtg attgatgagg aacaacggtt 7440
156
tggtgttaag cataaagaaa ctttaaagga attaaaaact aaggttgacg tcttaacctt 7500
157
aacagctact ccgattccta gaaccttaca catgtctatg ttaggtatcc gagatttatc 7560
158
ggttattgag accccaccaa ccaatcgtta tcctgttcaa acctatgttt tggaaaataa 7620
159
tccaggtctc gttagagaag ctatcattcg tgaaatggat cgtggaggac aaatttttta 7680
160
cgtttacaat aaagttgaca ctattgaaaa gaaagttgca gagctacaag aattagtccc 7740
161
agaagcttct atcggttttg ttcatgggca aatgagtgaa attcaacttg aaaatacctt 7800
162
gattgacttt ataaatggtg attatgatgt ccttgtggct acaacaatca tcgaaacagg 7860
163
agttgacatt tctaatgtaa acactttgtt tattgagaat gctgatcata tgggattgtc 7920
164
aactttatat caactgaggg ggcgcgtcgg aagaagtaat cgtattgcct atgcttacct 7980
165
gatgtatcgt cctgataaga tcctaacaga agtctctgaa aaacgtttag aggctattaa 8040
166
aggctttact gaattaggtt caggcttcaa gattgctatg cgagatttgt ctatacgagg 8100
167
agcaggtaat attttaggag cttctcaaag tggctttatt gattcggtcg gttttgaaat 8160
168
gtattctcag ttattggaac aggctattgc tagcaagcaa ggaaaaacga ctgttcgcca 8220
169
aaaaggtaat actgaaatca atcttcagat tgatgcttat ttaccagatg attatattgc 8280
170
agatgagcgc caaaaaattg acatttacaa gcgtattcga gaaattcaat caagagaaga 8340
171
ttatctcaat ttgcaagatg agctgataga tcgttttgga gagtatcctg atcaagttgc 8400
172
ctatttgtta gagatagctc tgctaaaaca ttatatggac aatgcctttg cggaattagt 8460
173
tgaacgcaaa aataatcagg tcattgttcg atttgaagta acttctttaa gttatttctt 8520
174
gactcaggat tatttcgaag ccttatctaa aacccatctt aaagctaaaa ttagtgaaca 8580
175
tcaggggaaa atcgatatcg tctttgacgt tcgccatcaa aaagattata gaattttaga 8640
176
agaattgatg ttatttggag aaaggcttag tgagataaaa atcagaaaaa acaattcagt 8700
177
ttttaaataa taatttgaaa caacttttag actgaatagt attaatgaca atggaacgaa 8760
178
ctagctcttt atacttttgt caaaaatcta agatctttgc tgcgaaatta ggatcttttc 8820
179
taccatttaa aaaataaaaa tgataaaatg aagaggattg taggagaaat tatgagacta 8880
180
gataaatatc taaaggtatc gcgccttatt aaacgtcgtt cagtagcaaa agaagttgcg 8940
181
gataagggac gaattaaagt taatgggata cttgctaaaa gttcaacgaa tgtaaaacta 9000
182
aatgatcaca ttgaaattag ttttggaaat aaattactga cagtaagagt cattgaaata 9060
183
aaagatagta caaaaaaaga agatgctctt aagatgtatg agataatcag tgaaacaagg 9120
184
ataacattaa atgaagaagc ctagtattgt tcaattaaat aatcattata ttaagaaaga 9180
185
gaatctcaaa aaaaaatttg aagaagaaga atctcaaaaa agaaatcgtt ttatgggatg 9240
186
gatccttgta agtatgatgt ttttatttat tttgccaact tataatcttg tcaaaagtta 9300
187
tgttgatttt gaaaagcaaa atcaacaggt ggttaaatta aaaaaagagt ataatgaatt 9360
188
gtcaaagagt acaaaaaaag aaaaacaatt agcagaacga ctaaaagatg ataattttgt 9420
189
caaaaaatat gctagggcaa aatactattt atcgcgtgaa ggagaaatga tttatcctat 9480
190
tccaggacta ttaccaaaat gatgatggac aatattataa aaaaaataga agcatttctt 9540
191
gctttttctg ataaaaaatt agcagagctg caacaggaaa atcaaaaagt taaagaagaa 9600
added
removed
t/data/no_FH.embl
